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consensusID : consensus_11361#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 35 consensus length = 1284 fasta sequence
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[CTCGNGGGCCAA-ATTTCGGCACGAGG-----TCTAATTATCATTTTACAATCTTATACAATTATGATTGAATTACGTCGTTTATCTACTATACTTCTTGGTCTTGCTATAACATTAATTACGATTGGTATGGCTACATCACAATGGAGATGTGGTGGATTATTTGATTCATGTCAAAGAGGACATTCAAAAGATGCAATTATAGCTATTGTAGCATTATTACTTATTGGAGTTATTGCTTTAGCAGTTGTCTTTTTACTAGATCTCATTGGATTGTGTTCAGATGTAATTGTTGCTACTGCAGGTTATGTAACTGCACGTTTTATTTTATTATATTTGGGTACAGCTTGTTTAGTTACTGGTATATTAGTATATACTGGTAAATTTGATCAGACATGGTCATATTTTTTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCAAGTTGCTATTTTAGCTATAATGAGTTCACGTTGTATATCAGTACGTACAGAACGAGTTGTTGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTC-ATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATACTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTATTCACATGCATATA]
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[CATCGAGCCAATTTTCGGCACGAGGCTTACTGGTATATTAGTATATACTGGTAAATTTGATCAGACATGGTCATATTTTTTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCAAGTTGCTATTTTAGCTATAATGAGTTCACGTTGTATATCAGTACGTACAGAACGAGTTGTTGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACG-TTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATACTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTA-TTCACATGCATATACCAATAACTTGTAAGCTTTATATAAATCAATCAGTTTCTATGCTTAAGTATTTCCCCTATTTATTACCCATTTCATACAATAAACGTTTAATATCTACATCTTACTTACTTACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCAAGGAGCATAGACCTCTCACCATCATATCTATATCTATATCAGCTTATATCTCTATGTGAATTTCCCATATCAGAACAAGAATCAGTATTCAACCATTTTGTATCTCTATGTCTTCAGTCCATTATATATATATATATTACCTTGCTTACATTNTTT]
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[GAGGGGTACAGCTTGTTTAGTTACTGGTATATTAGTATATACTGGTAAATTTGATCAGACATGGTCATATTTTTTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCAAGTTGCTATTTATCAGTACGTACAGAACGAGTTGTTGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTCAATCAATCTCCATATCTAATCTATACTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTATTCACATGCATATACCAATAACTTGTAAGCTTTATATAAATCAATCATTTATTACCCATTTCATACAATAAACGTTTAATATCTACATCTTACTTACTTACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCAAGGAGCATAGACCTCTCACCATCATATCTATATCTATATCAGCTTATATCTCTATGTGAATTTCCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTATCTCTATGTCTTCAGTCCATTATATATATATATATTACCTTGCTTACATTNTTTTATATTCTTCAGTAACTATGGATACAAATATGTT]
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[GGTCCGAGGCGTATGGCTACATCACAATGGAGATGTGGTGGTATTATTTGATTCATGTCAAAGAGGACATTCAAAAGATGCAATTATAGCTATTGTAGCATTATTACTTATTGGAGTTATTGCTTTAGCAGTTGTCTTTTTACTAGATCTCATTGGATTGTGTTCAGATGTAATTGTTGCTACTGCAGGTTATGTAACTGCACGTTTTATTTTATTATATTTGGGTACAGCTTGTTTAGTTACTGGTATATTAGTATATACTGGTAAATTTGATCAGACATGGTCATATTTTTTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCAAGTTGCTATTTTAGCTATAATGAGTTCACGTTGTATATCAGTACGTACAGAACGAGTTGTTGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATACTGCATTCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTNTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTATTCACATGCATATACCAATAA]
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[+] EMBL CD063152 [ TATATCAGTACGTACAGAACGAGTTGTTGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCT ]
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[TGAGGTGTGCTGTTCTAATTGACATTTTACAATCTTATCAAATTATGATTGAATTACGTCGTTTATCTACTAGACATCTTGGACTTGCTATAACATTAC]
[+] EMBL AI067364 [TGAGGTGTGCTGTTCTAATTGACATTTTACAATCTTATCAAATTATGATTGAATTACGTCGTTTATCTACTAGACATCTTGGACTTGCTATAACATTAC]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#0 ATCTTATACAATTATGATTGAATTACGTCGTTTATCTACTATACTTCTTGGTCTTGCTAT 120
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#0 ATGTCAAAGAGGACATTCAAAAGATGCAATTATAGCTATTGTAGCATTATTACTTATTGG 240
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consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#0 AGTTATTGCTTTAGCAGTTGTCTTTTTACTAGATCTCATTGGATTGTGTTCAGATGTAAT 300
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consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 --------------------------------------CATCGAGCCAATTTTCGGCACG 22
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* * *
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* * * ** *** ** * * **** **** * * * * *
consensus_11361#2 TTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCAAGTTGCTATTTTAGCTATAATGAGTTCA 139
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** ***** * ** **** ** * **
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consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 TATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTT 259
consensus_11361#3 TATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTT 228
consensus_11361#0 TATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTT 598
consensus_11361#4 TATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATCAACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTT 472
consensus_11361#1 TATAGCTATTGTAGCATTATTACTTATTGGAGTTATTGCTTTAGCAGTTGTCTTTTTACT 254
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 TATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATA 319
consensus_11361#3 TATCCCCTTCAAT-------------------------CAATCTCCATATCTAATCTATA 263
consensus_11361#0 TATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATA 658
consensus_11361#4 TATCCCCTTCAATATGTAACCTACTTTTAAATGCTGATCAATCTCCATATCTAATCTATA 532
consensus_11361#1 AGATCTCATTGGATTGTGTTCAGATGTAATTGTTGCTACTGCAGGTTATGTAACTGCACG 314
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 CTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTA 379
consensus_11361#3 CTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTA 323
consensus_11361#0 CTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTA 718
consensus_11361#4 CTGCATTCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTNTGCATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTA 592
consensus_11361#1 TTTTATTTTATTATATTTGGGTACAGCTTGTTTAGTTACTGGTATATTAGTATATACTGG 374
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 TTCACATGCATATACCAATAACTTGTAAGCTTTATATAAATCAATCAGTTTCTATGCTTA 439
consensus_11361#3 TTCACATGCATATACCAATAACTTGTAAGCTTTATATAAATCAATCA------------- 370
consensus_11361#0 TTCACATGCATATACCAATAACTTGTAAGCTTTATATAAATCAATCAGTTTCTATGCTTA 778
consensus_11361#4 TTCACATGCATATACCAATAA--------------------------------------- 613
consensus_11361#1 TAAATTTGATCAGACATGGTCATATTTTTTGGCTACTGTTGGTGGTGTATTTGCAATGCA 434
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 AGTATTTCCCCTATTTATTACCCATTTCATACAATAAACGTTTAATATCTACATCTTACT 499
consensus_11361#3 -------------TTTATTACCCATTTCATACAATAAACGTTTAATATCTACATCTTACT 417
consensus_11361#0 AGTATTTCCCCTATTTATTACCCATTTCATACAATAAACGTTTAATATCTACATCTTACT 838
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 AGTTGCTATTTTAGCTATAATGAGTTCACGTTGTATATCAGTACGTACAGAACGAGTTGT 494
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 TACTTACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCAAGGAGCATAGACCTCTCACCATCATATCTAT 559
consensus_11361#3 TACTTACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCAAGGAGCATAGACCTCTCACCATCATATCTAT 477
consensus_11361#0 TACTTACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCAAGGAGCATAGACCTCTCACCATCATATCTAT 898
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 TGTACGTTCAACACGTTAAATGACGAGATATTTACTGGGAAACGTTTTTTTAAACAAATC 554
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 ATCTATATCAGCTTATATCTCTATGTGAATTTCCCATATCAGAACAAGAATCAGTATTCA 619
consensus_11361#3 ATCTATATCAGCTTATATCTCTATGTGAATTTCCCAT--TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 535
consensus_11361#0 ATCTATATCAGCTTATATCTCTATGTGAATTTCCCATATCAGAACAAGAATCAGTATTCA 958
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 AACAGATGAACCAGTTGATCTATTCGTTTATCCCCTTCATATGTAACCTACTTTTAAATG 614
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 ACCATTTTGTATCTCTATGTCTTCAGTCCATTATATATATATATATTACCTTGCTTACAT 679
consensus_11361#3 NNNNNNNTGTATCTCTATGTCTTCAGTCCATTATATATATATATATTACCTTGCTTACAT 595
consensus_11361#0 ACCATTTTGTATCTCTATGTCTTCAGTCCATTATATATATATATATTACCTTGCTTACAT 1018
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 CTGATCAATCTCCATATCTAATCTATACTGCATGCTATTGGATTGTAAGTTTCTTTTTGC 674
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 TNTTT------------------------------------------------------- 684
consensus_11361#3 TNTTTTATATTCTTCAGTAACTATGGATACAAATATGTT--------------------- 634
consensus_11361#0 TTTTTTATATTCTTCAGTAACTATGGATACAAATATGTTTGTTCGTTTTTTTTGTAGACA 1078
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 ATTATTATTTTCATGAATTCGCTTCTATTCACATGCATATA------------------- 715
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#0 GATATATGAATATTCTATTTGTTAATTGTCTCCATTTGGGCTTCAATTTAAAATTTAGGC 1138
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#0 TGTACAATCTTTTATTATTATTATTATTATTGATATTAAGATTTTTTTCGCTTTTAATAA 1198
consensus_11361#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_11361#0 TTGGGGAATAAAATTTCAAATATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCC 1258
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consensus_11361#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11361#2 --------------------------
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consensus_11361#0 ATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA 1284
consensus_11361#4 --------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||