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Schistosoma mansoni
cluster # 11400 cluster # 11400       Sequences # 65       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11400#0 length = 911 sequences # 2  
consensus_11400#1 length = 643 sequences # 4  
consensus_11400#2 length = 567 sequences # 59  

consensusID : consensus_11400#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 911
fasta sequence
                              [CTTCGGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTGTTTTTTCTTGATGTTTCATTCTTCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGNTTCTGTTTCATTTCANAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGNAATTNTTTTTCTTTTTTTTCTTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATATGCATATTGGTTGATTTATTTTGTCCCCCCTCTCTCTCTTTTCGCTCTATGTGTATGTTCGTTAATTTATCACCCCCCCCTTATAGATTGAGAANTATATCAGCTCAATTNGAATTTGGATGGATATAAATTTTATGTGATACTATCACATACAAATGATTTTATGTTTATTTACTATAT]

[+] EMBL CD081846             [CTTCGGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTGTTTTTTCTTGATGTTTCATTCTTCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGNTTCTGTTTCATTTCANAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGNAATTNTTTTTCTTTTTTTTCTTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATATGCATATTGGTTGATTTATTTTGTCCCCCCTCTCTCTCTTTTCGCTCTATGTGTATGTTCGTTAATTTATCACCCCCCCCTTATAGATTGAGAANTATATCAGCTCAATTNGAATTTGGATGGATATAAATTTTATGTGATACTATCACATACAAATGATTTTATGTTTATTTACTATAT]
[-] EMBL CD192303             [                                            aTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATANATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTGTTTTTTCTTGATGTTTCATTCTTCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATCTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_11400#0 CTTCGGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTA TTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTT AACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTT TTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAA AAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTG TTGTTTTTTCTTGATGTTTCATTCTTCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAG ATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTC TGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTT CTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTAT TACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAA CAGTGTGNTTCTGTTTCATTTCANAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGT TTCTTTGAATAGGTTGNAATTNTTTTTCTTTTTTTTCTTTTCGGGTTCTATTATTGAGAA TGGGAAAGATATGCATATTGGTTGATTTATTTTGTCCCCCCTCTCTCTCTTTTCGCTCTA TGTGTATGTTCGTTAATTTATCACCCCCCCCTTATAGATTGAGAANTATATCAGCTCAAT TNGAATTTGGATGGATATAAATTTTATGTGATACTATCACATACAAATGATTTTATGTTT ATTTACTATAT



consensusID : consensus_11400#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 643
fasta sequence
                              [TCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGTTCTGTTTCATTTCAAAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGTAA-TTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATAATGCATATTGTTTGTATTATTTTTGTCCCCCCCTCTCTCTCTTTTTCGTCTCTATGTGTATGTTCGTTTATTTTAATCACCCCCNCCCCTTATTAGATTGAGATTATAATCAAGCTTCAAATTTGAATTTTGTATGGATTATTAATTTTTATGTTGTATACTATTCACATAAACAAAATGAATTTTAATGTT---TTATATATACATATATAAATATTGTTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CD075562             [TCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATATATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGTTCTGTTTCATTTCAAAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGTAA TTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATAATGCATATTGTTTGTATTATTTTTGTCCCCCCCTCTCTCTCTTTTTCGTCTCTATGTGTATGTTCGTTTATTTTAATCACCCCCNCCCCTTATTAGATTGAGATTATAATCAAGCTTCAAATTTGAATTTTGTATGGATTATTAATTTTTATGTTGTATACTATTCACATAAACAAAATGAATTTTAATGTT   TTATATATACATATATAAAT                            ]
[-] EMBL CD135372             [                                                                                   TAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGTTCTGTTTCATTTCAAAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGTAATTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATAATGCATATTGTTTGTATTATTTTTGTCCCCCCCTCTCTCTCTTTTT                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD140551             [                                                                                                                    AATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCACAATATGACTATTATTACTATTAC   TATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGTTCTGTTTCATTTCAAAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAGTAGGTTGTAA TTTTTTTTCCTTTTTTTCTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATAATACATATTGTTTGTATTATTTTTGTCCCCCCCTCTCTCT                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI394841             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acaTTATTAGATTGAGATTATANTCAAGCTTCAAATTTGAATTTTGTATGGATTACTAATTTTTATGTTGTATACTATTCACATAAACAAAATGAATTTTAATGTTTTCTTATATATACATATATAAATATTGTTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_11400#1 TCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAGATCATTATAACTGTTATACTTTATA TATATACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGTTCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATA CGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAATTTCTTATAACTGAACACTGATTCTCAC AATATGACTATTATTACTATTACTATTATTATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGAT TGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAATCCCAACAGTGTGTTCTGTTTCATTTCAAAGG GAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAAAAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGTAATTTTTTTT CTTTTTTTTCTTTCGGGTTCTATTATTGAGAATGGGAAAGATAATGCATATTGTTTGTAT TATTTTTGTCCCCCCCTCTCTCTCTTTTTCGTCTCTATGTGTATGTTCGTTTATTTTAAT CACCCCCNCCCCTTATTAGATTGAGATTATAATCAAGCTTCAAATTTGAATTTTGTATGG ATTATTAATTTTTATGTTGTATACTATTCACATAAACAAAATGAATTTTAATGTTTTATA TATACATATATAAATATTGTTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_11400#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 59
consensus length = 567
fasta sequence
                              [ATAATGAAAGTATTGGGAATTTGTGTTATACTTACATTAATATTCAATGGAATAAATTGTATAAAAAATAAGAAAGTCAAATGTTATCGATGTTCCGATTGTCCTAATCCATTCGATAAGACACAAATAACTGAATTAGGTAATTGTAACTTTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGATGAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTG]

[-] EMBL CD116920             [ATAATGAAAGTATTGGGAATTTGTGTTATACTTACATTAATATTCAATGGAATAAATTGTATAAAAAATAAGAAAGTCAAATGTTATCGATGTTCCGATTGTCCTAATCCATTCGATAAGACACAAATAACTGAATTAGGTAATTGTAACTTTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGATGAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD200638             [                                                                                                 ATTGTCCTAATCCATTCGATAAGACACAAATAACTGAATTAGGTAATTGTAACTTTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGATGAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTC                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD200505             [                                                                                                                  GATAAGACACACATAACTGAATTAGGTAATTGTAACTTTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGATGAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCC                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD170196             [                                                                                                                                                                                 GATGAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCG                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD182557             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182341             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTCCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182579             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182606             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182645             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182650             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182651             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGGGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182609             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGGGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATGGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182652             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTGGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTAGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182653             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAGCTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACACTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182699             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATCAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182384             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTGCAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182398             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGT ACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182340             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182500             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTGACTCGATCTCTCCCG                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD182375             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182385             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182392             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182408             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182684             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACGATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACT                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD182430             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182399             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACACATACTAATAAATTCAT                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD182457             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182464             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182479             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182477             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182481             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182491             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182493             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182504             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182513             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182515             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182516             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182546             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182548             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182550             [                                                                                                                                                                                                                                                             GCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGAT                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD182661             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182414             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAGTTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182453             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCTCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182532             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACCCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182537             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182563             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATCTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182602             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182336             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182373             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182416             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182452             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182674             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182507             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182696             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATCTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTTCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182466             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182522             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182659             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATC                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD182682             [                                                                                                                                                                                                                                                              CTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTA                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD192179             [                                                                                                                                                                                                                                                                                TGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTG]


>consensus_11400#2 ATAATGAAAGTATTGGGAATTTGTGTTATACTTACATTAATATTCAATGGAATAAATTGT ATAAAAAATAAGAAAGTCAAATGTTATCGATGTTCCGATTGTCCTAATCCATTCGATAAG ACACAAATAACTGAATTAGGTAATTGTAACTTTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGAT GAAGATAATTATAGAATTGCGAAAGATTGTGTAGCAAGTTGTGTTCCACAAGATCGTCGT GGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAATGCATCACCT AAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACT AATAAATTCATATATTGAACGGTTAACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCG CTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCAT CTATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCA ACAGGGATCTATTAAATGTCATTGTTG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11400#0      CTTCGGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTA 60
consensus_11400#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11400#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11400#0      TTAATTACTAGTTTTACAATTTTTATTACATATACTAATAAATTCATATATTGAACGGTT 120
consensus_11400#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11400#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11400#0      AACTCGATCTCTCCCGCTCGATCACCCGCCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTT 180
consensus_11400#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11400#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11400#0      TTAAGTCTCATCAAACTATTTGCTTTCAATATCCATCTATCTCTCACAAAATATTAAAAA 240
consensus_11400#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11400#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11400#0      AAAGACAAACTTGTTTAGATTTCTGTTTTGTAACCAACAGGGATCTATTAAATGTCATTG 300
consensus_11400#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11400#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11400#0      TTGTTTTTTCTTGATGTTTCATTCTTCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAG 360
consensus_11400#1      -------------------------TCCCAACTATATCGAACGAATCAATCAATAAAGAG 35
consensus_11400#2      ----------------------------------------------------ATAATGAA 8
                                                                           **** ** 

consensus_11400#0      ATCATTATAACTGTTATACTTTATATATAT--ACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGT 418
consensus_11400#1      ATCATTATAACTGTTATACTTTATATATAT--ACATGTATTACAATAGAATAACAAGGGT 93
consensus_11400#2      AGTATTGGGAAT-TTGTGTTATACTTACATTAATATTCAATGGAATAAATTGTATAAAAA 67
                       *  ***   * * ** *  * **  ** **  * **  * *  **** * *    *    

consensus_11400#0      TCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAAT 478
consensus_11400#1      TCTGTAGAGGTATCTCTTGTCTGAATACGTTTGTTGTAATTATCAATTACATATTGTAAT 153
consensus_11400#2      ATAAGAAAGTCAAATGTTATC--GATGTTCCGATTGTCCTAATCCATTCGATA----AGA 121
                            * **  *  * ** **   **       ****  * *** ***  ***    *  

consensus_11400#0      TTCTTATAACTGAAC--ACTGATTCTCACAATATGACTATTA--TTACTATTACTATTAT 534
consensus_11400#1      TTCTTATAACTGAAC--ACTGATTCTCACAATATGACTATTA--TTACTATTACTATTAT 209
consensus_11400#2      CACAAATAACTGAATTAGGTAATTGTAACT-TTTGTCGAACAGTTTACACTTATCGTGAT 180
                         *  *********     * *** * **  * ** * *  *  ****  ***   * **

consensus_11400#0      TATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTGGCGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAA 594
consensus_11400#1      TATTATTACTATCGCTTTTAAAGCTTAGGATTG-CGTTGTTGTTTCCCCATTTCTGTCAA 268
consensus_11400#2      GAAGATAATTATAGAATT----GCGAAAGATTG-TGTAGCAAGTT----GTGTTCCACAA 231
                        *  ** * *** *  **    **  * *****  ** *    **     * *    ***

consensus_11400#0      TCCCAACAGTGTGNTTCTGTTTCATTTCANAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAA 654
consensus_11400#1      TCCCAACAGTGTGTT-CTGTTTCATTTCAAAGGGAACTTTATATCCAACTTATTTTTAAA 327
consensus_11400#2      GATCGTCGTGGTGGTAAAGCTGGCTTAGTAACTGAATGTTGTGATGAAGATTATTGTAAT 291
                          *  *   *** *   * *   **    *  ***  ** *    **  *  ** *** 

consensus_11400#0      AAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGNAATTNTTTTTCTTTTTTTT-----CTTTTCGGGTTCT 709
consensus_11400#1      AAAAGTTTCTTTGAATAGGTTGTAATTTTTTTTCTTTTTTTT-----CTTT-CGGGTTCT 381
consensus_11400#2      GCA---TCACCTAAACATTATTCCATTTCATTTCTATTAATTACTAGTTTTACAATTTTT 348
                         *   *    * ** *   *   ***   ***** **  **      *** *   ** *

consensus_11400#0      ATTATTGAGAATGGGAAAGATA-TGCATATTGGTTGATTTATTTTGTCCCCCCTCTCTCT 768
consensus_11400#1      ATTATTGAGAATGGGAAAGATAATGCATATTGTTTGTATTATTTTTGTCCCCCCCTCTCT 441
consensus_11400#2      ATTACATATACTAATAAATTCA---TATATTGAACG-GTTAACTCGATCTCTCCCGCTCG 404
                       ****   * * *   ***   *    ******   *  ***  *    * * * * *** 

consensus_11400#0      CT---TTTCG-CTCTATGTGTATGTTCGTTAATTT--ATCACCCCCCCC--TTAT-AGAT 819
consensus_11400#1      CTCTTTTTCGTCTCTATGTGTATGTTCGTTTATTTTAATCACCCCCNCCCCTTATTAGAT 501
consensus_11400#2      ATC--ACCCG--CCCGCTCGCTCGCTCGCTTATTACATTTATTTTTAAGTCTCATCAAAC 460
                        *      **   *     *   * *** * ***    * *          * ** * * 

consensus_11400#0      TGAGAANTATATCA-GCTC--AATTNGAATTTGG-ATGGATA--TAAATTTTATGTG--A 871
consensus_11400#1      TGAGATTATAATCAAGCTTCAAATTTGAATTTTGTATGGATTATTAATTTTTATGTTGTA 561
consensus_11400#2      TA--TTTGCTTTCAATATCC--ATCT--ATCTCTCACAAAATATTAAAAAAAAGACA--A 512
                       *          ***   *    **    ** *   *   *    ***     *      *

consensus_11400#0      TACTAT-CACATACA---AATGATTTT--ATGTTTATTTACTATAT-------------- 911
consensus_11400#1      TACTATTCACATAAACAAAATGAATTTTAATGTTTTATATATACATATATAAATATTGTT 621
consensus_11400#2      ACTTGTTTAGATT-------TCTGTTTT-GTAACCAACAGGGATCTAT-TAAATGTCATT 563
                          * *  * **        *   ***   *           *  *              

consensus_11400#0      ----------------------
consensus_11400#1      GCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 643
consensus_11400#2      GTTG------------------ 567
                                             




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)