|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11506#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 60 consensus length = 443 fasta sequence
[CACATTTGCAGTAATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT-TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA--GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT-GAACATAACTGTCGAG-TTAAAATTC-GA---AAATATCTTGAAGAAGATAAT-T-TAGGTGAAAA-ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG-TTTAAACAAGCG-TTTAGATAT-GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG-CT-AA-A-AAAGAATA-TCAACATTCAA-TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG-TA-GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG-CGTCCGAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGACCG]
[+] EMBL CD166766 [CACATTTGCAGTAATGAGACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATTGTCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATATACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGCGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGCTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTCTGATTATAAGATAGATAA ]
[+] EMBL CD064324 [ aTAATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAGGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAGTAG CT AA G AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAA ]
[+] EMBL CD064331 [ AATGAAACTCATCTTAATATTCGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAA ]
[-] EMBL CD064357 [ ATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAGAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGATTAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAA ATAGA GATCAC ]
[-] EMBL CD166765 [ ATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAAT ]
[-] EMBL CD064092 [ ATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAAT ]
[-] EMBL CD166689 [ ATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TATAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACT ATTCTTAG TTGATTATAAGATAGATAtc ]
[+] EMBL SM689 [ gagCTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGNAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGNTAAT T TAGNTGAAAA NTTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGNTAAGNG TTTAAACAAGCG TTTAGATATGGCGTTTNTCNGAca ]
[+] EMBL SM357 [ TAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GATTTAAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA AT ]
[+] EMBL SM3581 [ TAATTATT TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GATTTAAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA AT ]
[+] EMBL SM498 [ GCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTG AAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCTACTAGTTTAAG ]
[+] EMBL AA791341 [ TAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGCCCGAACGGTCA ATTGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTA GTTAAGCGATTTAAACAAGCGATTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAA GAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCG AAACTAATTCTTAG TTGATTATAAGta ]
[+] EMBL CD191599 [ cCTCTTCCCTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GATCATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCTGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTCCAAAA ]
[+] EMBL CD065700 [ aACGGAACTTTGGAAGAGATTT GAACAT AC GTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD200136 [ ACTTTGGTAGACATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAGACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAAT ]
[+] EMBL CD200133 [ ACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAAT ]
[+] EMBL CD200105 [ ACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAC GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAAT ]
[+] EMBL CD065753 [ TGGAAGAGA TT GAACAT ACTGACGAG TT AAATTC GA AAATAT TTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTGGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[-] EMBL CD167265 [ GGAAGAGATTT GAACACAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAAT ]
[+] EMBL CD167301 [ gtGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AGATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAACATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[-] EMBL CD065458 [ GAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG CTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA ACAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTGGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTAC ]
[-] EMBL CD167425 [ AGATTTGGAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTACACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA ACAAAGAATA TCAACGTTCAA TGAGTCTAGTGAATTTTAATTCAATAAAG TATGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTCCG AAGTTCCGTGAGCCGTCGGACC ]
[+] EMBL CD128356 [ TTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD128336 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATCAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD128303 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAA ]
[+] EMBL CD065526 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD128340 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTGCGAcatgcacg ]
[+] EMBL CD065559 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD128337 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD128304 [ TT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTG TGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATGAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD167240 [ TT GAACATAACTGTCGAG TT AATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGGTAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGGATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATNAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[-] EMBL CD167432 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGACAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTACACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AACA AAAGAATA TCAACATTCTA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTC AAAGTTCCGTAAGCC TCGGTCCG]
[-] EMBL CD167348 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATTAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGT CATGAG CGTCCGAAAGTTCCGTGAGCCGgcc ]
[-] EMBL CD167439 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATC CTGTACATGAG CGTCCGAAAGTTCCGTGAGCCGT ]
[-] EMBL CD167478 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
[-] EMBL CD167429 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TC ACATTCAA TGAGTCTAATGAATTT ]
[-] EMBL CD128373 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGTATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG ACATGAGCCGTC AAGTTCCGTGA ]
[-] EMBL CD128334 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGA ]
[-] EMBL CD065747 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAATCTATAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCCT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATA ]
[+] EMBL CD167481 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTTA GCCGtc ]
[-] EMBL CD128243 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[-] EMBL CD128448 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATCC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCACCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CTAAA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTAT AGATAGATAATCACTGTACATGgc ]
[-] EMBL CD128294 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCGTCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATGG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[-] EMBL CD167354 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAGAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACTAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTA G ATTTTAATTCAATAAAG Tcc ]
[-] EMBL CD128322 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTCAGT AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTCTATCAGAAGACAGAGCAGAATATACATCTTTAATAG CT A C AAAGAATA TCTACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATCAA ]
[-] EMBL CD128494 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTC TAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG AC TG G CGTC ]
[-] EMBL CD167324 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAg ]
[+] EMBL CD167307 [ aT GAAC T ACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT G TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCGATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAA ]
[-] EMBL CD128211 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TC ACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAta ]
[-] EMBL CD065725 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTC TAGTTTGATTATAAGATAGATAATC C G ACATGAG CGTCCG ]
[+] EMBL CD167482 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAACTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTA ]
[-] EMBL CD167341 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATACTCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAGACTAATTC TAGTTTGATTATAAGATAGATAATCAC TACATGAG CGTCCG ]
[-] EMBL CD065530 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAGTTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGAATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAACTGAGTCTAATGAATTT ]
[-] EMBL CD128511 [ T GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG ACAT ]
[+] EMBL CD167406 [ AACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGATAAGCG TTTAAACAAGCG TTCAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGAT ATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD167283 [ tgACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD167288 [ gACATAACTGTCGAG TT AAATTC GA AAATATC TGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATATATGTTAAGCG TTTAAACATGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACAT TTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATG ]
[+] EMBL CD167271 [ tgACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTCCGA ]
[+] EMBL CD128524 [ tgACATAACTGTCGAGATTAAAATTC GA AAATATCTCGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG CGTCCG ]
[+] EMBL CD128274 [ tgACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATC TGAAGAAGATAAT T TAGGTGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT AA A AAAGAATA ACAACATTCAA TGAGTCTAATGAATT ]
consensusID : consensus_11506#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 388 fasta sequence
[ACGGCTCACGGAACTTGGAAGAGATTGACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTGTATGTATTCTTAAGAAAAAATTCAACATATTCATTTCATCTTTTCTCATCTTTTTAGATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCCAAAATATTTTTTTGAAAAAAAGGAATGAATACATTTGA]
[+] EMBL CD128240 [ACGGCTCACGGAACTTGGAAGAGATTGACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTGTATGTATTCTTAAGAAAAAATTCAACATATTCATTTCATCTTTTCTCATCTTTTTAGATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTA ]
[+] EMBL AA960683 [ ATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCCAAAATATTTTTTTGAAAAAAAGGAATGAATACATTTGA]
consensusID : consensus_11506#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 24 consensus length = 314 fasta sequence
[TCATCACCGGTCCGACGGCTCACGGAAC-TTGGAAGAGATTG-AC-TAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA-GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG-TTAAGCGT-TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCAGAGTTCCGT]
[+] EMBL CD167276 [TCATCACCGGTCCGACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATCG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAGTATC TGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD167385 [ GGTCCGACGGCTCACGGAACTTTGGAAGAGATTG AC TAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCAGAGTTCCGT]
[+] EMBL CD167253 [ cCCGACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATTGAAC T ACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTGTCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCTATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD167479 [ CCGACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATTGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT CTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCT AAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD167344 [ taCCGA GGCTCACGGAACTTTGGAAGAGATTG AC AACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAAT TCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGTAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATC ]
[+] EMBL CD128475 [ ACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATTG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACACCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAA ]
[+] EMBL CD065510 [ ACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATTG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD167247 [ gtcCGGCTTACGGAAC TTGGAAGAGATTGAAC TAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTCAGTTTGATTATNAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD167263 [ CGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATTG AA ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD167349 [ GCTCACGGAACTTTGGAAGAGATTG AC T ACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGATTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD128487 [ CACGGAAC TTGGGAGAGATTG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATG ]
[+] EMBL CD167380 [ CACGGAAC TTGGAAGAGATTG AC ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATC TGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTG TGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATCCAATGAGTCTAATGGATT ]
[+] EMBL CD167211 [ tACGG AC TTGGAAGAGCTTG AC ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATAACAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD167396 [ AC TTGGAAGAGATTG AC ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATC TGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD128244 [ TG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATGTCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCA ]
[+] EMBL CD167259 [ TG AC TAGCTGTCGAGTT AAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTGTCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGACTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ]
[+] EMBL CD167279 [ TG AC ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGGTACGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACA ]
[+] EMBL CD167243 [ TG AC ATACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAAT TCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[+] EMBL CD167293 [ TG AC TAACTGTCGAGTTAAGATTCGAAAATATCTTGAACGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTA ]
[+] EMBL CD167345 [ AC T ACTGTCGAGTTAAAA TCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGTATTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATCAGATAGATAATCACTGT ]
[+] EMBL CD167379 [ AATTCGAAAATATC TGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATT ]
[-] EMBL CD167312 [ tcgGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTT ]
[+] EMBL CD128341 [ TGAAAAATTAGCCGCTGTTGT AGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAAT ]
[+] EMBL CD166854 [ actCGT ATAAACCTGCGGTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAA ]
consensusID : consensus_11506#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 296 fasta sequence
[NTGAACATAACTGTCGAGNNTTAAAATTCGNAAAATATTCTTGAAGAAGATAATTTAGGGTGAAAAATTACGCCGCTGATTGTATAGCATCTATCGTTAACGCGTCTTAAACAATGCGTGTTAGATAGTGCGTTTAGTCAGAAGATCAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCCGACATGAGCGTCAAGTTCCGTGAGCCTC]
[-] EMBL CD167335 [NTGAACATAACTGTCGAGNNTTAAAATTCGNAAAATATTCTTGAAGAAGATAATTTAGGGTGAAAAATTACGCCGCTGATTGTATAGCATCTATCGTTAACGCGTCTTAAACAATGCGTGTTAGATAGTGCGTTTAGTCAGAAGATCAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCCGACATGAGCGTCAAGTTCCGTGAGCCTC]
consensusID : consensus_11506#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 241 fasta sequence
[TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT-G-ATTTAATTC-ATAAAGT-TCCGTGAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGTCCGGTCCG]
[-] EMBL CD167300 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCATAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT GAATTTTAATC ATAAAGTAGCCGTCAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGTCCGGTC ]
[-] EMBL CD167277 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAA G ATTTAATTC AA T AAAGTTCCGTGAGCCGTCGGACCGGctcg]
[-] EMBL CD167408 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT G ATTTAATTC AATAAGT TCCGTGAgcc ]
[-] EMBL CD167364 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT ATTTAATTCGATAAAGT TCCGTG ]
[-] EMBL CD065642 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGG ATTTAATTC ATAAAGT TC ]
[-] EMBL CD167358 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT G ATT ]
[-] EMBL CD128450 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAAC AGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAA G AT ]
[-] EMBL CD167260 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGCAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATC TAATAGCTAAAAAAGAATATCAA ]
[-] EMBL CD065545 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG ]
[-] EMBL CD128402 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTT AGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACA ]
[-] EMBL CD128355 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGGAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAG ]
consensusID : consensus_11506#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 207 fasta sequence
[CGGAACTTGGGAAGAGATTGAACATAACTGTCGAGTTAAAACTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTATGTT-AAGCGTTTAAACAACGCGTTGTAGATACTGCGTTTATCACGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACAGTTCAATGAGTCTAATGAATT]
[+] EMBL CD167458 [CGGAACTTGGGAAGAGATTGAACATAACTGTCGAGTTAAAACTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTATGTT AAGCGTTTAAACAACGCGTTGTAGATACTGCGTTTATCACGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACAGTTCAATGAGTCTAATGAATT]
[+] EMBL CD065783 [ tgGAGCAT ACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTATGTTGAAGCGTTTAAACAA GCGTT TAGATA TGCGTTTATCA GAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCGAC GTTCAATGAGTCTAATGAATT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_11506#0 CACATTTGCAGTAATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATTTCGTTGCTGTTAAA 60
consensus_11506#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#0 TGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAAGTTATG 120
consensus_11506#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#2 -------------------------------------------------TCATCACCGGT 11
consensus_11506#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#0 GAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTTGAACATAACTGTCGAGTT--AAAATTCGA 178
consensus_11506#3 -----------------------------NTGAACATAACTGTCGAGNNTTAAAATTCGN 31
consensus_11506#1 ---ACGGCTCACGGAACTTGG-AAGAGA-TTGA-CATAACTGTCGAGTT--AAAATTCGA 52
consensus_11506#5 -----------CGGAACTTGGGAAGAGA-TTGAACATAACTGTCGAGTT--AAAACTCGA 46
consensus_11506#2 CCGACGGCTCACGGAACTTGG-AAGAGA-TTGA--CTAACTGTCGAGTT--AAAATTCGA 65
consensus_11506#4 ------------------------------TGAACATAACTGTCGAGTT--AAAATTCGA 28
*** *********** **** ***
consensus_11506#0 AAA-TAT-CTTGAAGAAGATAATTTAGG-TGAAAAATTA-GCCGCTG-TTGTA-AGCATC 232
consensus_11506#3 AAAATATTCTTGAAGAAGATAATTTAGGGTGAAAAATTACGCCGCTGATTGTATAGCATC 91
consensus_11506#1 AAA-TAT-CTTGAAGAAGATAATTTAGG-TGAAAAATTA-GCCGCTG-TTGTA-AGCATC 106
consensus_11506#5 AAA-TAT-CTTGAAGAAGATAATTTAGG-TGAAAAATTA-GCCGCTG-TT---------- 91
consensus_11506#2 AAA-TAT-CTTGAAGAAGATAATTTAGG-TGAAAAATTA-GCCGCTG-TTGTA-AGCATC 119
consensus_11506#4 AAA-TAT-CTTGAAGAAGATAATTTAGG-TGAAAAATTA-GCCGCTG-TTGTA-AGCATC 82
*** *** ******************** ********** ******* **
consensus_11506#0 T----------------------------------------------------------A 234
consensus_11506#3 T----------------------------------------------------------A 93
consensus_11506#1 TGTATGTATTCTTAAGAAAAAATTCAACATATTCATTTCATCTTTTCTCATCTTTTTAGA 166
consensus_11506#5 -----------------------------------------------------------A 92
consensus_11506#2 T----------------------------------------------------------A 121
consensus_11506#4 T----------------------------------------------------------A 84
*
consensus_11506#0 T-GTTAA-GCGT-TTAAACAA-GCGT-TTAGATA-TGCGTTTA-TCAGAAGA-CAGAGCA 286
consensus_11506#3 TCGTTAACGCGTCTTAAACAATGCGTGTTAGATAGTGCGTTTAGTCAGAAGATCAGAGCA 153
consensus_11506#1 T-GTTAA-GCGT-TTAAACAA-GCGTT-TAGATA-TGCGTTTATCA-GAAGA-CAGAGCA 218
consensus_11506#5 T-GTTAA-GCGT-TTAAACAACGCGTTGTAGATACTGCGTTTATCACGAAGA-CAGAGCA 148
consensus_11506#2 T-GTTAA-GCGT-TTAAACAA-GCGTT-TAGATA-TGCGTTTATCA-GAAGA-CAGAGCA 173
consensus_11506#4 T-GTTAA-GCGT-TTAAACAA-GCGTT-TAGATA-TGCGTTTATCA-GAAGA-CAGAGCA 136
* ***** **** ******** **** ****** ******** ***** *******
consensus_11506#0 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACA-TTCAATGAGTCTAATGAATTT 345
consensus_11506#3 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACA-TTCAATGAGTCTAATGAATTT 212
consensus_11506#1 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACA-TTCAATGAGTCTAATGAATTT 277
consensus_11506#5 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACAGTTCAATGAGTCTAATGAATT- 207
consensus_11506#2 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACA-TTCAATGAGTCTAATGAATTT 232
consensus_11506#4 GAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACA-TTCAATGAGTCTAATGA--TT 193
************************************** ***************** *
consensus_11506#0 TAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG 405
consensus_11506#3 TAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAAT-CTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATC---C 268
consensus_11506#1 TAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG 337
consensus_11506#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11506#2 TAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTG 292
consensus_11506#4 TAATTCA-TAAAGTTCCGTGAAAGT--TCCGTGAGCCGTCGGTCCGGTCCG--------- 241
consensus_11506#0 TACATGAGCGTCCGAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGACCG------------- 443
consensus_11506#3 GACATGAGCGTC---AAGTTCCGTGAGCCTC-------------------- 296
consensus_11506#1 TACATGAGCGTCCAAAATATTTTTTTGAAAAAAAGGAATGAATACATTTGA 388
consensus_11506#5 ---------------------------------------------------
consensus_11506#2 TACATGAGCGTCAGAGTTCCGT----------------------------- 314
consensus_11506#4 ---------------------------------------------------
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||