These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11506#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 60 consensus length = 443 fasta sequence [CACATTTGCAGTAATGAAACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATT-TCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATTTACTGAAAGTGTGAA--GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT-GAACATAACTGTCGAG-TTAAAATTC-GA---AAATATCTTGAAGAAGATAAT-T-TAGGTGAAAA-ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG-TTTAAACAAGCG-TTTAGATAT-GCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG-CT-AA-A-AAAGAATA-TCAACATTCAA-TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG-TA-GCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAG-CGTCCGAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGACCG] [+] EMBL CD166766 [CACATTTGCAGTAATGAGACTCATCTTAATATTTGCACTAATTATTGTCGTTGCTGTTAAATGTAACTGCTGAATCCCAAGCTAGTCAAAAGGAACTATATACTGAAAGTGTGAA GTTATGGAAGTCAATCACAGAACTTTGGAAGAGATTT GAACATAACTGTCGAG TTAAAATTC GA AAATATCTTGAAGAAGATAAT T TAGGCGAAAA ATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCG TTTAAACAAGCG TTTAGATAT GCGCTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG CT A A AAAGAATA TCAACATTCAA TGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAG TA GCCGAAAACTAATTCTTAGTCTGATTATAAGATAGATAA ] [+] EMBL CD064324 [ 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Sequences nbr = 24 consensus length = 314 fasta sequence [TCATCACCGGTCCGACGGCTCACGGAAC-TTGGAAGAGATTG-AC-TAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA-GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG-TTAAGCGT-TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACATGAGCGTCAGAGTTCCGT] [+] EMBL CD167276 [TCATCACCGGTCCGACGGCTCACGGAAC TTGGAAGAGATCG ACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAGTATC TGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT TTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATTCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCACTGTACAT ] [+] EMBL CD167385 [ GGTCCGACGGCTCACGGAACTTTGGAAGAGATTG AC TAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAA GAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATG TTAAGCGT 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 296 fasta sequence [NTGAACATAACTGTCGAGNNTTAAAATTCGNAAAATATTCTTGAAGAAGATAATTTAGGGTGAAAAATTACGCCGCTGATTGTATAGCATCTATCGTTAACGCGTCTTAAACAATGCGTGTTAGATAGTGCGTTTAGTCAGAAGATCAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCCGACATGAGCGTCAAGTTCCGTGAGCCTC] [-] EMBL CD167335 [NTGAACATAACTGTCGAGNNTTAAAATTCGNAAAATATTCTTGAAGAAGATAATTTAGGGTGAAAAATTACGCCGCTGATTGTATAGCATCTATCGTTAACGCGTCTTAAACAATGCGTGTTAGATAGTGCGTTTAGTCAGAAGATCAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGAATTTTAATTCAATAAAGTAGCCGAAAACTAATCTTAGTTTGATTATAAGATAGATAATCCGACATGAGCGTCAAGTTCCGTGAGCCTC] consensusID : consensus_11506#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 241 fasta sequence [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT-G-ATTTAATTC-ATAAAGT-TCCGTGAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGTCCGGTCCG] [-] EMBL CD167300 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCATAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT GAATTTTAATC ATAAAGTAGCCGTCAAAGTTCCGTGAGCCGTCGGTCCGGTC ] [-] EMBL CD167277 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAA G ATTTAATTC AA T AAAGTTCCGTGAGCCGTCGGACCGGctcg] [-] EMBL CD167408 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT G ATTTAATTC AATAAGT TCCGTGAgcc ] [-] EMBL CD167364 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT ATTTAATTCGATAAAGT TCCGTG ] [-] EMBL CD065642 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAATGG ATTTAATTC ATAAAGT TC ] [-] EMBL CD167358 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAAT G ATT ] [-] EMBL CD128450 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAAC AGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAGCTAAAAAAGAATATCAACATTCAATGAGTCTAA G AT ] [-] EMBL CD167260 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGCAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATC TAATAGCTAAAAAAGAATATCAA ] [-] EMBL CD065545 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACATCTTTAATAG ] [-] EMBL CD128402 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGAAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTT AGCGTTTAAACAAGCGTTTAGATATGCGTTTATCAGAAGACAGAGCAGAATAAACA ] [-] EMBL CD128355 [TGAACATAACTGTCGAGTTAAAATTCGAAAATATCTTGAAGAAGATAATTTAGGTGGAAAATTAGCCGCTGTTGTAAGCATCTATGTTAAG ] consensusID : consensus_11506#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||