These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11530#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 119 consensus length = 1589 fasta sequence 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EMBL CD070187 [ CAGGTAACCATCTGTCTTTA TCAC C CAGTTTGACTATGACGGAACAGATAAGCCAAGAGTCTCCTGTCCAAACACCTATGTATTCCAAAGGTTTGACTTCATCGGCTTTCGTCTCTGGCGGACTAAAAATTCGGCTTCGCCGGGACGCAGCTATGGATTTCA ATATTGGGAA A GGTAAACGAGCT AAAAGTAAAA CGGCT CCTGCAACA TTTCGTATTGTAGAGTCATGGTGTGATGCAGATGCTCCAGGAGGAGATTTTACCAGAAGGGCCAGAGCAGCTACTAGTAATTCT ACTTCCCCTACATTTAGTCT GGTCTCGGGGGGATTACGTGTTGGTGATA ] [+] EMBL CD070439 [ CAGGTAACCATCTGTCTTTA TCAC C CAGTTTGACTATGACGGAACAGATAAGCCAAGAGTCTCCTGTCCAAACACCTATGTATTCCAAAGGTTTGACTTCATCGGCTTTCGTTTCTGGCGGACTAAAAATTCGGCTTCGCCGGGACGCAGCTATGGATTTCA ATATTGGGAC A GGTAAACGAGCT ACAAGTAAAA CGGCT CCTGCAACA TTTCGTATT ] [+] EMBL CD070398 [ CAGGTAACCATCTGTCTTTA TCAC C CAGTTTGACTATGACGGAACAGATAAGCCAAGAGTCTCCTGTCCAAACACCTATGTATTCCAAAGGTTTGACTTCATCGGCTTTCGTTTCTGGCGGACTAAAAATTCGGCTTCGCCGGAACGCAGCTATGGATTTCA ATATTGGGCA A G ] [+] EMBL CD070224 [ CAGGTAACCATCTGTCTTTA TCAC C 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ATATGGGGAA AGGGTAAACGAGCTAAAAAGTAAAA CGGCTCCCTGCAACA TTTCGTATGNTAGAGTCATGGTGTGATGCAGATGCTCCAGNAGNAGATTTTACCAGAAGGGCCAGAGCAGCTACTAGTAATTCT ACTTCCCCTACATTTAGTCT GGTCTCGGGGGGATTACGTGTTGGTGATATAGTCTGGGCTAAACTTGCTGGCTATCCGTATTGGCCATCCCAGGTTAACGCTATCTGGGCTCGCACTGCCCATCAGCTTTCTCAAGCCACTCTACTTCCAACTTCACAGTCATTGGACAGCAATGCGTCATCTTTGGCTGTTCTTGC GACTCCTTCAGATCCAAGTTTAG C GGCTGGATATACTGCTCGCGTTGAC TGGCTTGCTTGGGATCAGTGTTCTTATTTAAGCTGTGCTAAGTTGTACCCCTTTAAAGAGTCTTTTGATAAACTTTATAATCCACGTACCCGGGTAAAAGGATACGCAGAAGCTGTGCGCCTTGCGAAGCAAATTGTGAATGGGACCTATATTCCCAATGAAAATTTGGATTCTCAGTTGTGTATGTCTCCACAAAATAAATCTCACTCATCATTGTCTGGTCAGATTTCGGCGCCACCTAGTACTGATAGCCAGTGGTCATC ] [-] EMBL CD070372 [ A GGTAAACGAGCT AAAAGTAAAA CGGCT CCTGCAACA TTTCGTATTGTAGAGTCATGGTGTGATGCAGATGCTCCAGGAGGAGATTNTACCAGAAGGGCCAGAGCAGCTACTAGTAATTCT ACTTCCCCTACATTTAGTCT GGTCTCGGGGGGATTACGTGTTGGTGATATAGTCTGGGCTAAACTTGCTGGCTATCCGTATTGGCCATCCCAGGTTAACGCTATCTGGGCTCGCACTGCCCATCAGCTTTCTCAAGCCACTCTACTTCCAACTTCACAGTCATTGGACAGCAATGCGTCATCTTTGGCTGTTCTTGC 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GAAGCAAATTGTGAATGGGACCTATATTCCCAATGAAAATTTGGATTCTCAGTTGTGTATGTCTCCACAAAATAAATCTCACTCATCATTGTCTGGTCAGATTTCGGCGCCACCTAGTACTGATAGCCAGTGGTCATCTATGACAACCCTTTCATCCTCCCTAGAAATTCCGACTACAGGTACTAGTAATCAAACTTCTCGTGAATTAATGGACAAACACACCATACTATTGCCATCTGAACTACCACCAGATCCCTATGTATCATCACAATTAAGTCCGTCTCCCCATTCAGTCACGAACCTCTATTCTGGTGAAGGATTAGTGAGAACTTCAGACGCATTTTCATCTACATCTAATAACTCATGCCTTCTAAT ] [+] EMBL SMAA69075 [ CGCATTTTCATCTACATCTAATAACTCATGCCTTCTAATTGGTGATAAAAGCCTGGAATTGCCTGAATTAGACAATATGGCAATGTGGGCTCCTCTTCCCCAATTAGATGTTTCAGGTCTTGGTGTTTAACATGTTCCGACCTTTTCAGAAGATGAAGAAGAATTGGATCAGTCTATTGTGAATCAGCTGCACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||