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consensusID : consensus_11553#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 137 consensus length = 1379 fasta sequence
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consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#6 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#7 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 GTTCAGGTGGGTGTGTTACGAAAGTGATGACTGTTCCTGTTCCTAGTCATGTTGATTATT 180
consensus_11553#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#6 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#7 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 TAAATGCTTCTAAGTTGTGGGTGGCTAAGCAATCTTAGGTAATCATAGTAAATAGGTGGC 240
consensus_11553#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 TAAACAAGGGTTAGGCAGTATAGTTAAAGTAGTTATAATATTAGTTTTGTAAACTAAAGA 300
consensus_11553#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 AGATACATAGTGTATAGGTCTGCTGGGTTGTGGTGAGTGCCAGTTAAATAAATTTATAGT 360
consensus_11553#1 ------------------------------------------------TAAATTTACAGT 12
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consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 TTGGTGGATAACGTACCTTTTGTATCATGATTCATTGAGGTATTATAGGTTATTCTATTT 420
consensus_11553#1 CTGGTAGATAGTGTACCTTTTGTATCATGATTCATTGAGGTATTGTAGGTTATTCTATTT 72
consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#6 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#7 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#2 -----------TATTGGACTAGTCATTTTAGTAAAATTTAGATATATAATCTGATTGGTT 49
consensus_11553#4 ----------------------TCATTT-AGTGCAAATTAGATATATAA--TGATGG--T 33
consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 CCCGAAAGGTTCTCGATTTTATATAGTTCATTCTGTTAATTATAGTTAGT-TGGTGAGGT 479
consensus_11553#1 CCCGAAAGGTTCTCGATTTTATATAGTTCATTCTATTAATTGTAATTAGT-TAGTGAGGT 131
consensus_11553#5 ----------------------------TGGCNTGTTGAACCTTTTCGGTGTTAGAAGGC 32
consensus_11553#6 -----------------------------------------CTTTTCGGTGT--AGAGGC 17
consensus_11553#7 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#2 GGAATAAGTTAGGTTAGATTAT-GATGTTTCTTTTTTCTA-GTATTGCACTCAA---CTC 104
consensus_11553#4 GGAATAAGT-AGGTTAGATTATTGATAGTTTCTTTTTTCA-GTAGGGCACTCAA---CT- 87
consensus_11553#3 ----TAAGT-AGGTTAGATTATTGATTGTTCTTTTTTC-A-GTATTGCACTCAA---CTC 50
consensus_11553#0 TGGATAAGT-TACTAAGTAAGTATAATTAGAGAAACTATGTAGGTAGTGATAAATTATTC 538
consensus_11553#1 TGGATAAGT-TACTGAGTAAGTATAATTAGAGAAATTATATAGGTAGTGATAAATTATTC 190
consensus_11553#5 TGGAAAAGG-AAGTCTGT---TCNACTTTTAAATCTTCNATGGGTTGAGTTTAA--GCCC 86
consensus_11553#6 TGGAAAAGG-AAGTCTGT---TCGACTNTTAAATCNTCAN-GAGTTGAGTTAAG--ACCG 70
consensus_11553#7 ------------------------------------------------ATTAAACAATTA 12
* *
consensus_11553#2 GTTTATT-AAAAACATTGCTATTAGTTAATTATTT-AATAGTAA-GGCCTGCTCAGTGAA 161
consensus_11553#4 GTTTATT-TGAGACATTGCTATTAGTTAATTGTTT-AATAGTAA-GGCTTGCTCAGTGTA 144
consensus_11553#3 GTT-ATT-AAAAACATTGCTATTAGTTAATTATTTCAATAGTAACGGCCTGCTCAGTGAA 108
consensus_11553#0 GTGTGATCTGATATCTGGTTAGTGACTTTATTTATCGAACTTAGGGAATAGCTGAGTGTG 598
consensus_11553#1 GTGTGATCTGATATCTGGTTAGTGACTTTATTTATCGAG-TTAGAGAATAGCTGAGTGTG 249
consensus_11553#5 GGCTGT----AAGCCAGGTTGGT--TCTTATCTATAATTGGTTCTGATTAGT---GCGAA 137
consensus_11553#6 GTGTAA----ANNCCAGGTTGGN--TCTTATCNATAATTGGTTCTGATTAGT---ACGAA 121
consensus_11553#7 ACTAATA--GCAATGTTTTTAATAAACAGTTGAGT--GCAATACTGAAAAAA-GAACATC 67
* * * * *
consensus_11553#2 GAAGTTTGTTTAAATAGCCGCGATTATTGATC--GTGCTAAGGTAGCATAATATATAGCT 219
consensus_11553#4 GAAGTTTGTTTTGATAGCCGCGATTATTGATC--GTGTTAAGC----------------- 185
consensus_11553#3 GAAGTTTCGTTAAATAGCCGCGATTATTGATCCGATGCTAAGGTAGCATAATATATAGTC 168
consensus_11553#0 TTGGTTATTTAGGACA-GAGATATTGTAATTATTATGTGATAGGGTCTGAGATTAAGATT 657
consensus_11553#1 TTGGTTATTTAGGACA-GAGATATTATAATTATTGTGGGATAGAGTCTGAGATTAAGATT 308
consensus_11553#5 AGGATTATT-AGGATA-CAGTGTTTCTGTACGTATAGGAATAG----------------- 178
consensus_11553#6 AGGANTATT-AGGATA-CAGTGTTTCTGTACGTATAGGAATAGGAAGTA----------- 168
consensus_11553#7 ATATCTACYTWATTCCACCATCATTATATATCTAATTTTACTAAATG------------- 114
* ** * *
consensus_11553#2 TTTCAATTGTAGACTTGTGTTACGGTTAATCG---------------------------- 251
consensus_11553#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#3 TTTTCAT-GTAGACTTGTGAATCGGTTAATGAGGTGTGATTAGGCTGATAGTCTATACTG 227
consensus_11553#0 GTCTTAGGTTAGTAAAGTTATTTACATAGCTTAGAAGATTGATTAATAATAATCTTGTTG 717
consensus_11553#1 GTCTTAGGTTAGTGAAGTTATTTACATAGCTTAGAAGATTGGTTAATAAAAATCTTGTGG 368
consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#6 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#7 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#3 AATTTAGTTTATGT---------------------------------------------- 241
consensus_11553#0 GATAAGAGAGGTCATTTA-GTAAAATTAGATATATAATGATGGTGGAATAAGTAGGTTAG 776
consensus_11553#1 GTTAAGGATAGTCATTTAAGTAAAATT--------------------------------- 395
consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
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consensus_11553#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11553#0 ATTATTGATTGTTTCTTTTTTCAGTATTGCACTCAACTGTTTATTAAAAACATTGCTATT 836
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consensus_11553#5 ------------------------------------------------------------
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consensus_11553#0 AGTTAATTGTTTAATAGTAAGGCCTGCTCAGTGAAGAAGTTTGTTTAAATAGCCGCGATT 896
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consensus_11553#0 ATTGATCGTGCTAAGGTAGCATAATATATAGTCTTTTAATTGTAGACTTGTGAATGGTTC 956
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consensus_11553#0 AATGAGGTGTGATTAAGGTGATAGTCTATTATCTGAATTTAGTTTAGTGGTTAGGAACCC 1016
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consensus_11553#0 GTAAATGTAGATTATTCATTTATTTTTAGATCCTTTATGGATAAAGGATAAAGTTACCTT 1136
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consensus_11553#0 GGGGATAACTGAGTAAAGGACAGGGAGAGGTCCTATTGATCTGTTTATTACTACCTCGAT 1196
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consensus_11553#3 ---
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consensus_11553#6 ---
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||