cluster # 1244

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Schistosoma mansoni
cluster # 1244 cluster # 1244 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1244#0 length = 1035 sequences # 2

consensusID : consensus_1244#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1035
fasta sequence

                              [TTCTCAATCTTTTTCTATTAAAACAAATGAAAATGTTTGAATTATCAACAAAATATTTGATTATAAGCACTACAGGATTGTGGACTGAACAACATTCAGCTGATTAATTTTTATAAGCAGTTACTGTTTGATTGAAAATATGAAAATGTTACACTTTCAACAATTACATTATCACGACGACATTCATCCAAGTGTGCTACATTAAAAAACGTGTTAATTGTAGACATAACACTATTAAATGCAAGGTAATACATACTTTTATCACCAGTATCTAACCACAGTACTTGGATGAATCAAAATACATCAAACTGGTTTTGCTTTTAACCAAAGTAATGAAATTTTTCAAAAGAACCCATCAATAAAATAATAATTCCAATAAGTAAATAAAAGATAATGAAGGAAATCTAGTAAAACATGGACATTACACCAAAATGTTTTAAAATAGATAGAAGCGTACAGTCTGATAATCCCTTGTTATAGAGATAACTGTAAAGTATGAACTATACATAAGTAGTTTAGAAATTAAATAAAAACATAAAATCTTATTTAAATTTGTTTTAAATTTGAACTTGATTTCAAACATTGTCAGTTAAGTTTGGAGGTTGTTTGTTGCCAGGCGCGTAACACTCTTCCGTGTTTTCAAAAATCACGTCAAAATTAAATCGAGAACTATTTATGATCAACTGCAATGATCTGTTTTGATTTTTATGCATTCATCAATTCTTCGACATAAATTAGGAAAATACTCATCAAATGGATACTTTCCAGAAATATCAATACGGTTTTCTCGGGCAGTTATAAGCCCTAGCCAACCTTTTGGTTTATAATCACGTTGTGCACGTAAACAAATAATTGGTTTTTTCAAAAAAACTGCATATGTTGCTTCCATTTCAGCATATTCACTGTTTTTATAATTTTCGGAATATATAATACATACAGCATAAGATTTTTCTACGGCTTCAGCCAAACTTCTAAATGTATTTACAGCATATTCTCANTATTGTCTTGATCAACCTCGTGCCGAATTNTTGGCTC]

[+] EMBL CD076304             [TTCTCAATCTTTTTCTATTAAAACAAATGAAAATGTTTGAATTATCAACAAAATATTTGATTATAAGCACTACAGGATTGTGGACTGAACAACATTCAGCTGATTAATTTTTATAAGCAGTTACTGTTTGATTGAAAATATGAAAATGTTACACTTTCAACAATTACATTATCACGACGACATTCATCCAAGTGTGCTACATTAAAAAACGTGTTAATTGTAGACATAACACTATTAAATGCAAGGTAATACATACTTTTATCACCAGTATCTAACCACAGTACTTGGATGAATCAAAATACATCAAACTGGTTTTGCTTTTAACCAAAGTAATGAAATTTTTCAAAAGAACCCATCAATAAAATAATAATTCCAATAAGTAAATAAAAGATAATGAAGGAAATCTAGTAAAACATGGACATTACACCAAAATGTTTTAAAATAGATAGAAGCGTACAGTCTGATAATCCCTTGTTATAGAGATAACTGTAAAGTATGAACTATACATAAGTAGTTTAGAAATTAAATAAAAACATAAAATCTTATTTAAATTTGTTTTAAATTTGAACTTGATTTCAAACATTGTCAGTTAAGTTTGGAGGTTGTTTGTTGCCAGGCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD082714             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATAGATAGAAGCGTACAGTCTGATAATCCCTTGTTATAGAGATAACTGTAAAGTATGAACTATACATAAGTAGTTTAGAAATTAAATAAAAACATAAAATCTTATTTAAATTTGTTTTAAATTTGAACTTGATTTCAAACATTGTCAGTTAAGTTTGGAGGTTGTTTGTTGCCAGGCGCGTAACACTCTTCCGTGTTTTCAAAAATCACGTCAAAATTAAATCGAGAACTATTTATGATCAACTGCAATGATCTGTTTTGATTTTTATGCATTCATCAATTCTTCGACATAAATTAGGAAAATACTCATCAAATGGATACTTTCCAGAAATATCAATACGGTTTTCTCGGGCAGTTATAAGCCCTAGCCAACCTTTTGGTTTATAATCACGTTGTGCACGTAAACAAATAATTGGTTTTTTCAAAAAAACTGCATATGTTGCTTCCATTTCAGCATATTCACTGTTTTTATAATTTTCGGAATATATAATACATACAGCATAAGATTTTTCTACGGCTTCAGCCAAACTTCTAAATGTATTTACAGCATATTCTCANTATTGTCTTGATCAACCTCGTGCCGAATTNTTGGCTC]




>consensus_1244#0
TTCTCAATCTTTTTCTATTAAAACAAATGAAAATGTTTGAATTATCAACAAAATATTTGA
TTATAAGCACTACAGGATTGTGGACTGAACAACATTCAGCTGATTAATTTTTATAAGCAG
TTACTGTTTGATTGAAAATATGAAAATGTTACACTTTCAACAATTACATTATCACGACGA
CATTCATCCAAGTGTGCTACATTAAAAAACGTGTTAATTGTAGACATAACACTATTAAAT
GCAAGGTAATACATACTTTTATCACCAGTATCTAACCACAGTACTTGGATGAATCAAAAT
ACATCAAACTGGTTTTGCTTTTAACCAAAGTAATGAAATTTTTCAAAAGAACCCATCAAT
AAAATAATAATTCCAATAAGTAAATAAAAGATAATGAAGGAAATCTAGTAAAACATGGAC
ATTACACCAAAATGTTTTAAAATAGATAGAAGCGTACAGTCTGATAATCCCTTGTTATAG
AGATAACTGTAAAGTATGAACTATACATAAGTAGTTTAGAAATTAAATAAAAACATAAAA
TCTTATTTAAATTTGTTTTAAATTTGAACTTGATTTCAAACATTGTCAGTTAAGTTTGGA
GGTTGTTTGTTGCCAGGCGCGTAACACTCTTCCGTGTTTTCAAAAATCACGTCAAAATTA
AATCGAGAACTATTTATGATCAACTGCAATGATCTGTTTTGATTTTTATGCATTCATCAA
TTCTTCGACATAAATTAGGAAAATACTCATCAAATGGATACTTTCCAGAAATATCAATAC
GGTTTTCTCGGGCAGTTATAAGCCCTAGCCAACCTTTTGGTTTATAATCACGTTGTGCAC
GTAAACAAATAATTGGTTTTTTCAAAAAAACTGCATATGTTGCTTCCATTTCAGCATATT
CACTGTTTTTATAATTTTCGGAATATATAATACATACAGCATAAGATTTTTCTACGGCTT
CAGCCAAACTTCTAAATGTATTTACAGCATATTCTCANTATTGTCTTGATCAACCTCGTG
CCGAATTNTTGGCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case