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Schistosoma mansoni
cluster # 1341 cluster # 1341       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1341#0 length = 865 sequences # 2  

consensusID : consensus_1341#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 865
fasta sequence
                              [ATTAGGCACGAGAGCTGTTGATCACATAATCCATATGTATTTCACTATGCGAAAGATTTGTATTATGGCAGGATCGGATATATCAAGTTGGTTTGTAAAACTAATGTACATTTCGCAAATAATGATAATCAGCCTTGTAATTCAGATCTTTTGAAGTTCTGTGATTCCAGTAACCACATACTATCCTCATTTGCAACTTCAAGTATATCATTTCGCTTCCGTAAGCGACTATACTTGTCTCATGGCTTTTTTCTTAATTTCATTGTTGACATTGGTAGTATCGATTTGTCTTATGTTACACACTATCAACAAACTGATTTTTCACAACCTACGAAAGGCCTTCTAGAAGCTTGATAAATCCATGGTCCATATGCAAGCCAGTTACAGCAAACGAATACGTTACAAGAACTCAGCTGAGTCCGTTCCAACTTCCGTTGTTAATTGCAATAGTAATAAATAAATTCTAGATTATGCAGAGTGTATAACCGACGCACAACCGGTCAAACACATGATGAACCTAAGGAGATGCACAATTGAGTACAGGAATCTGGATTTTTATTTAAGCTATGGCGGTCGTGATATTTATACTANNATGTGGTCCCTTTGCATTAAACTGAGTGCTTATTACGAATTCGAAGTATAATACGTCCATTTGTGGTCAGCCATTTCCACTTGCCCTAAATTGCATTATTTCAAGAGTTTTTAGTTCAAAAGTCAATTTGAATACCTTTAATAATCGTATTTATTTGAATAATTTATGACATTTATGAAAGTTTCATTGTTTATTGAGTTTTTAATGTTCATAGCTTATCTTTACACTGGTTAATTATTTTGGCTGAAATACAACTGAGCTACTTACAGAAGG]

[+] EMBL CD082967             [ATTAGGCACGAGAGCTGTTGATCACATAATCCATATGTATTTCACTATGCGAAAGATTTGTATTATGGCAGGATCGGATATATCAAGTTGGTTTGTAAAACTAATGTACATTTCGCAAATAATGATAATCAGCCTTGTAATTCAGATCTTTTGAAGTTCTGTGATTCCAGTAACCACATACTATCCTCATTTGCAACTTCAAGTATATCATTTCGCTTCCGTAAGCGACTATACTTGTCTCATGGCTTTTTTCTTAATTTCATTGTTGACATTGGTAGTATCGATTTGTCTTATGTTACACACTATCAACAAACTGATTTTTCACAACCTACGAAAGGCCTTCTAGAAGCTTGATAAATCCATGGTCCATATGCAAGCCAGTTACAGCAAACGAATACGTTACAAGAACTCAGCTGAGTCCGTTCCAACTTCCGTTGTTAATTGCAATAGTAATAAATAAATTCTAGATTATGCAGAGTGTATAACCGACGCACAACCGGTCAAACACATGATGAACCTAAGGAGATGCACAATTGAGTACAGGAATCTGGATTTTTATTTAAGCTATGGCGGTCGTGATATTTATACTANNATGTGGTCCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076551             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCTTCTAGAAGCTTGATAAATCCATGGTCCATATGCAAGCCAGTTACAGCAAACGAATACGTTACAAGAACTCAGCTGAGTCCGTTCCAACTTCCGTTGTTAATTGCAATAGTAATAAATAAATTTTAGATTATGCAGAGTGTATAACCGACGCACAACCGGTCAAACACATGATGAACCTAAGGAGATGCCCAATTGAGTACAGGAATTTGGATTTTTATTTAAGCTATGGCGGTCGTGATATTTATACTAAATTGTGGTCCCTTTGCATTAAACTGAGTGCTTATTACGAATTCGAAGTATAATACGTCCATTTGTGGTCAGCCATTTCCACTTGCCCTAAATTGCATTATTTCAAGAGTTTTTAGTTCAAAAGTCAATTTGAATACCTTTAATAATCGTATTTATTTGAATAATTTATGACATTTATGAAAGTTTCATTGTTTATTGAGTTTTTAATGTTCATAGCTTATCTTTACACTGGTTAATTATTTTGGCTGAAATACAACTGAGCTACTTACAGAAGG]


>consensus_1341#0 ATTAGGCACGAGAGCTGTTGATCACATAATCCATATGTATTTCACTATGCGAAAGATTTG TATTATGGCAGGATCGGATATATCAAGTTGGTTTGTAAAACTAATGTACATTTCGCAAAT AATGATAATCAGCCTTGTAATTCAGATCTTTTGAAGTTCTGTGATTCCAGTAACCACATA CTATCCTCATTTGCAACTTCAAGTATATCATTTCGCTTCCGTAAGCGACTATACTTGTCT CATGGCTTTTTTCTTAATTTCATTGTTGACATTGGTAGTATCGATTTGTCTTATGTTACA CACTATCAACAAACTGATTTTTCACAACCTACGAAAGGCCTTCTAGAAGCTTGATAAATC CATGGTCCATATGCAAGCCAGTTACAGCAAACGAATACGTTACAAGAACTCAGCTGAGTC CGTTCCAACTTCCGTTGTTAATTGCAATAGTAATAAATAAATTCTAGATTATGCAGAGTG TATAACCGACGCACAACCGGTCAAACACATGATGAACCTAAGGAGATGCACAATTGAGTA CAGGAATCTGGATTTTTATTTAAGCTATGGCGGTCGTGATATTTATACTANNATGTGGTC CCTTTGCATTAAACTGAGTGCTTATTACGAATTCGAAGTATAATACGTCCATTTGTGGTC AGCCATTTCCACTTGCCCTAAATTGCATTATTTCAAGAGTTTTTAGTTCAAAAGTCAATT TGAATACCTTTAATAATCGTATTTATTTGAATAATTTATGACATTTATGAAAGTTTCATT GTTTATTGAGTTTTTAATGTTCATAGCTTATCTTTACACTGGTTAATTATTTTGGCTGAA ATACAACTGAGCTACTTACAGAAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)