Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1363 cluster # 1363       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1363#0 length = 346 sequences # 2  
consensusID : consensus_1363#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 346
fasta sequence 
                              [TAATTCAATCTATTCACAATCCAATAATTATGATTACTCAATCAGTGATTTCTCAAATTGAAAATATAACAACTATTATGAATACTACAATACTACCTATGAATTTACTTTCAATGAATGATACTATTGATAAATTCATTAATCATAATGAACACTATAATAACTCATCTATTTCAACATCACAACAAACTATTATTCATCCTTATAAAGATTTAATTAAAATAAATAATAAAAATCAAAATCAAATAATCCCATTAAATTCTTCTTTATCTGAATTAAATTTAATTAAAACAAATTCATTGGTTAAAAATATTCGTAATGTCCTTGATAAACCATTAGCTGGCTT]

[+] EMBL CD161939             [TAATTCAATCTATTCACAATCCAATAATTATGATTACTCAATCAGTGATTTCTCAAATTGAAAATATAACAACTATTATGAATACTACAATACTACCTATGAATTTACTTTCAATGAATGATACTATTGATAAATTCATTAATCATAATGAACACTATAATAACTCATCTATTTCAACATCACAACAAACTATTATTCATCCTTATAAAGATTTAATTAAAATAAATAATAAAAATCAAAATCAAATAATCCCATTAAATTCTTCTTTATCTGAATTAAATTTAATTAAAACAAATTCATTGGTTAAAAATATTCGTAATGTCCTTGATAAACCATTAGCTGGCTT]
[+] EMBL CD161932             [TAATTCAATCTATTCACAATCCAATAATTATGATTACTCAATCAGTGATTTCTCAAATTGAAAATATAACAACTATTATGAATACTACAATACTACCTATGAATTTACTTTCA                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_1363#0
TAATTCAATCTATTCACAATCCAATAATTATGATTACTCAATCAGTGATTTCTCAAATTG
AAAATATAACAACTATTATGAATACTACAATACTACCTATGAATTTACTTTCAATGAATG
ATACTATTGATAAATTCATTAATCATAATGAACACTATAATAACTCATCTATTTCAACAT
CACAACAAACTATTATTCATCCTTATAAAGATTTAATTAAAATAAATAATAAAAATCAAA
ATCAAATAATCCCATTAAATTCTTCTTTATCTGAATTAAATTTAATTAAAACAAATTCAT
TGGTTAAAAATATTCGTAATGTCCTTGATAAACCATTAGCTGGCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)