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Schistosoma mansoni
cluster # 1368 cluster # 1368       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1368#0 length = 756 sequences # 2  

consensusID : consensus_1368#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 756
fasta sequence
                              [CGTAATAACATCACCTTGTTTCAGATAATTCTCCGCCAGCTAATATAACTGAAAAACGTTACAATCCATTGACCACTTTATGATCTGTATCGTCATCCTTGTTCATCTATTTAATTAGTAAATCAACCGTACTATCCAGAGTGATTATCAAGAGCATCAATGCTGGCTTAAATTACATATAATTTCTATTTATTAACCTCTTGAATTATTTCAACATATTCAACAATGATATTGATGAGTAATATGTTCTTAATTTTCACTGTATGATTGGTGTATTAAATATCCTGTATATGGATTCCTGGTCTCGTGAAGCTCAACTTGCGTATGATGTTATTTTAATAGTAGCAATTTATGTTTTACCACTGATAGTTGTGTGTTTAAGTCAACATGTTGTCACAGTGCACTTGAAACAGTCACAAAGACTATTAATGCTTTCTGGATATCGTAATACAACAGCATGGACAAGAAGACGACAGCGTCTGACAAGAACTATGCGTGTTAATGGCAGCACTG-TTTGTTTTATCTTGGTCACCGAACCATGTATGTAATCTGTTGACAAAAACATTTCATATTAATTATCCAGTAACTGAAATTTTACTTGATTATTCAAT-GTGTTTAGCTATGTCAAATGCTGTCACAGGTCCATTATTATTAATTGCTACATGCTCAAACTATCATCGGTATATTTTTCGCTTCTTCTATCGATCATCAATGACAAGCCATTCACCCGCAAAGTATTCAATGCCCGTCAATCTA]

[+] EMBL BF936707             [CGTAATAACATCACCTTGTTTCAGATAATTCTCCGCCAGCTAATATAACTGAAAAACGTTACAATCCATTGACCACTTTATGATCTGTATCGTCATCCTTGTTCATCTATTTAATTAGTAAATCAACCGTACTATCCAGAGTGATTATCAAGAGCATCAATGCTGGCTTAAATTACATATAATTTCTATTTATTAACCTCTTGAATTATTTCAACATATTCAACAATGATATTGATGAGTAATATGTTCTTAATTTTCACTGTATGATTGGTGTATTAAATATCCTGTATATGGATTCCTGGTCTCGTGAAGCTCAACTTGCGTATGATGTTATTTTAATAGTAGCAATTTATGTTTTACCACTGATAGTTGTGTGTTTAAGTCAACATGTTGTCACAGTGCACTTGAAACAGTCACAAAGACTATTAATGCTTTCTGGATATCGTAATACAACAGCATGGACAAGAAGACGACAGCGTCTGACAAGAACTATGCGTGTTAATGGCAGCACTG TTTGTTTTATCTTGGTCACCGAACCATGTATGTAATCTGTTGACAAAAACATTTCATATTAATTATCCAGTAACTGAAATTTTACTTGATTATTCAAT GTGTTTAGCTATGTCAAATGCTGTCACAGGTCCATTATTATTAATTGCTACATGCTCAAACTATCATCGGTATATTTTTCGCTTCTTCTATCGATCATCAATGACAAGCCATTCACCCGCAAAGTATTCAATGCCCGTCAATCTA]
[+] EMBL BF936484             [CGTAATAACATCACCTTGTTTCAGATAATTCTCCGCCAGCTAATATAACTGAAAAACGTTACAATCCATTGACCACTTTATGATCTGTATCGTCATCCTTGTTCATCTATTTAATTAGTAAATCAACCGTACTATCCAGAGTGATTATCAAGAGCATCAATGCTGGCTTAAATTACATATAATTTCTATTTATTAACCTCTTGAATTATTTCAACATATTCAACAATGATATTGATGAGTAATATGTTCTTAATTTTCACTGTATGATTGGTGTATTAAATATCCTGTATATGGATTCCTGGTCTCGTGAAGCTCAACTTGCGTATGATGTTATTTTAATAGTAGCAATTTATGTTTTACCACTGATAGTTGTGTGTTTAAGTCAACATGTTGTCACAGTGCACTTGAAACAGTCACAAAGACTATTAATGCTTTCTGGATATCGTAATACAACAGCATGGACAAGAAGACGACAGCGTCTGACAAG ACTATGCGTGTTAATGGCAGCACTGTTTTGTTTTATCTTGGTCACCGAACCATGTATGTAATCTGTTGACAAAAACATTTCATATTAATTATCCAGTAACTGAAATTTTACTTGATTATTCAATGGTGTTTAGCTATGTCAAATGCTGTCACAGGTCCATTATTATTAATTGCTACATGCTCAAACTTTCATCGTTATATATTTCGCT                                                              ]


>consensus_1368#0 CGTAATAACATCACCTTGTTTCAGATAATTCTCCGCCAGCTAATATAACTGAAAAACGTT ACAATCCATTGACCACTTTATGATCTGTATCGTCATCCTTGTTCATCTATTTAATTAGTA AATCAACCGTACTATCCAGAGTGATTATCAAGAGCATCAATGCTGGCTTAAATTACATAT AATTTCTATTTATTAACCTCTTGAATTATTTCAACATATTCAACAATGATATTGATGAGT AATATGTTCTTAATTTTCACTGTATGATTGGTGTATTAAATATCCTGTATATGGATTCCT GGTCTCGTGAAGCTCAACTTGCGTATGATGTTATTTTAATAGTAGCAATTTATGTTTTAC CACTGATAGTTGTGTGTTTAAGTCAACATGTTGTCACAGTGCACTTGAAACAGTCACAAA GACTATTAATGCTTTCTGGATATCGTAATACAACAGCATGGACAAGAAGACGACAGCGTC TGACAAGAACTATGCGTGTTAATGGCAGCACTGTTTGTTTTATCTTGGTCACCGAACCAT GTATGTAATCTGTTGACAAAAACATTTCATATTAATTATCCAGTAACTGAAATTTTACTT GATTATTCAATGTGTTTAGCTATGTCAAATGCTGTCACAGGTCCATTATTATTAATTGCT ACATGCTCAAACTATCATCGGTATATTTTTCGCTTCTTCTATCGATCATCAATGACAAGC CATTCACCCGCAAAGTATTCAATGCCCGTCAATCTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)