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Schistosoma mansoni
cluster # 1370 cluster # 1370       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1370#0 length = 891 sequences # 2  

consensusID : consensus_1370#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 891
fasta sequence
                              [TGATTACGGGCATATTGTATCGCATATTTTTGCAAGGTGGATTTTAACTATATTTCATCCATCCAAGTTCCCAGGGGGTATGATGATTTTCTTCTCAACAAAGTTTAATGCACTTACATCAAGAAAAAGGGATGTGTCCTGAGTTAAATTAAACTTACGAATGATGAAATTTATTTTATTGTTTTATCATAATTGATATTTATGTGAATACTTAAAGATATACTGAAAAAGCCTTTATTTACGATTAAGATCAAATTACTTGTGTTTTCATGGTATGTAATTGCCTGAAACTTAATAGGCCTATACCATATTTCATTGCTTGGGTAATGTAAATTTCAATTACTTAATGCTTTATATTTAACAATTATCATTTGACGTTGGTTAGCCAATTACATTTGATTAATAAATAGGTGGACTTATAACATTATACATATCTCAGAAATTGATTCATGCACCAGCTGTCTTGTTTGTAGTTTCTTTACATTTTTTTAAAGTTTACGTCTTGTTGTATGAAACACCGTTTGATTAGCATTGCACTGTGAAGTATTTCATTGAAGTGTATTTAGATAGATCTGTATAAAAACTCTTCTACTGAACATAAAGAAGAACTTCGCGCATGTAAGAAGACGTGGATTAGTTGTAAGATTTTATCAGTCACATAAAACTTTCGAATGATTTGAACATTCAGATTTTTTCTGTAATTTAAGTAAATTATTATAAATGAAGGATGTCGATTAACTTCGTAATTTCATTTTACTTAACAAATTAAATAATGGTCATTAATTTGAGGGAGTAAATGTCGTGTACCCTGTTTTTTATGTTTATTGCATTCTTCCTCCAATGACTTAAGAAGAATAGTAATAATTTTGGCTTGTTTTAAAGATATATCCT]

[+] EMBL CD083087             [TGATTACGGGCATATTGTATCGCATATTTTTGCAAGGTGGATTTTAACTATATTTCATCCATCCAAGTTCCCAGGGGGTATGATGATTTTCTTCTCAACAAAGTTTAATGCACTTACATCAAGAAAAAGGGATGTGTCCTGAGTTAAATTAAACTTACGAATGATGAAATTTATTTTATTGTTTTATCATAATTGATATTTATGTGAATACTTAAAGATATACTGAAAAAGCCTTTATTTACGATTAAGATCAAATTACTTGTGTTTTCATGGTATGTAATTGCCTGAAACTTAATAGGCCTATACCATATTTCATTGCTTGGGTAATGTAAATTTCAATTACTTAATGCTTTATATTTAACAATTATCATTTGACGTTGGTTAGCCAATTACATTTGATTAATAAATAGGTGGACTTATAACATTATACATATCTCAGAAATTGATTCATGCACCAGCTGTCTTGTTTGTAGTTTCTTTACATTTTTTTAAAGTTTACGTCTTGTTGTATGAAACACCGTTTGATTAGCATTGCACTGTGAAGTATTTCATTGAAGTGTATTTAGATAGATCTGTATAAAAACTCTTCTACTGAACATAAAGAAGAACTTCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076661             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCTATACCATATTTCATGNCTTGGGTAATGTAAATTTCAATTACTTAATGCTTTATATTTAACAATTATCATTTGACGTTGGTTAGCCAATTACATTTGATTAATAAATAGGTGGACTTATACCATTATACATATCTCAGAAATTGATTCATGCACCAGCTGTCTTGTTTGTAGTTTCTTTACATTTTTTTAAAGTTTACGTCTTGTTGTATGAAACACCGTTTGATTAGCATTGCACTGTGAAGTATTTCATTGAAGTGTATTTAGATAGATCTGTATAAAAACTCTTCTACTGAACATAAAGAAGAACTTCGCGCATGTAAGAAGACGTGGATTAGTTGTAAGATTTTATCAGTCACATAAAACTTTCGAATGATTTGAACATTCAGATTTTTTCTGTAATTTAAGTAAATTATTATAAATGAAGGATGTCGATTAACTTCGTAATTTCATTTTACTTAACAAATTAAATAATGGTCATTAATTTGAGGGAGTAAATGTCGTGTACCCTGTTTTTTATGTTTATTGCATTCTTCCTCCAATGACTTAAGAAGAATAGTAATAATTTTGGCTTGTTTTAAAGATATATCCT]


>consensus_1370#0 TGATTACGGGCATATTGTATCGCATATTTTTGCAAGGTGGATTTTAACTATATTTCATCC ATCCAAGTTCCCAGGGGGTATGATGATTTTCTTCTCAACAAAGTTTAATGCACTTACATC AAGAAAAAGGGATGTGTCCTGAGTTAAATTAAACTTACGAATGATGAAATTTATTTTATT GTTTTATCATAATTGATATTTATGTGAATACTTAAAGATATACTGAAAAAGCCTTTATTT ACGATTAAGATCAAATTACTTGTGTTTTCATGGTATGTAATTGCCTGAAACTTAATAGGC CTATACCATATTTCATTGCTTGGGTAATGTAAATTTCAATTACTTAATGCTTTATATTTA ACAATTATCATTTGACGTTGGTTAGCCAATTACATTTGATTAATAAATAGGTGGACTTAT AACATTATACATATCTCAGAAATTGATTCATGCACCAGCTGTCTTGTTTGTAGTTTCTTT ACATTTTTTTAAAGTTTACGTCTTGTTGTATGAAACACCGTTTGATTAGCATTGCACTGT GAAGTATTTCATTGAAGTGTATTTAGATAGATCTGTATAAAAACTCTTCTACTGAACATA AAGAAGAACTTCGCGCATGTAAGAAGACGTGGATTAGTTGTAAGATTTTATCAGTCACAT AAAACTTTCGAATGATTTGAACATTCAGATTTTTTCTGTAATTTAAGTAAATTATTATAA ATGAAGGATGTCGATTAACTTCGTAATTTCATTTTACTTAACAAATTAAATAATGGTCAT TAATTTGAGGGAGTAAATGTCGTGTACCCTGTTTTTTATGTTTATTGCATTCTTCCTCCA ATGACTTAAGAAGAATAGTAATAATTTTGGCTTGTTTTAAAGATATATCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)