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Schistosoma mansoni
cluster # 1397 cluster # 1397       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1397#0 length = 722 sequences # 2  

consensusID : consensus_1397#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 722
fasta sequence
                              [CAGAATTCGGCACGAGGACCATTCATCATTCATTATCACTGAATTTAAATTATATCAGTTTAGTACCTAAAAAAATAACACTGATATCTTATTTGTTAGTTTGATTGGGATAACGTCATGGATTTATTACAATATTTAAGGATTAATATTAATATTTAACCTTCCTTCACTTTGTAATCAATATCGAGGAGCGAATTCAAAACCCTAGTGATTTGGTACTGTTTCGAAAATCAAACTTGCAAAACGTTTTGTATTTTGAATTTTTTTTAGTATCTTCGTTTCCCAAGACTCTAGAAACCTTATAAATAAGGTCAAACTAGTTAGTACGATTTAAAAAGTGACAAAATAATAATGGTCTATTGCTGTTGTGATGGTGTAGCGATCTTTTATTATGGTTTCTGTGTGATCGCATTCTAGGTTTTGTACAAACTTTAATTCAAACAGTTTGTGACTTCGATTCATCTTTACACTCCTAACAACTCCTCTTCACGAGCGTTTGTGATTTTCGGGACATACCTTTTTTTTATTCATTTCCTTGTTAATTTTATTGTTGTGTACTTGTGTTTGTCCATACACTTATCGTTCTCTTCTTGCTCACACTATTTATTCAGTATTTCGGATTTTATTAATGCTTGTAACGAGTGGTATTTTGAGTAGTGAGATTTTGTCTTCTCTGATATTTGCTTCTTTTAT-ATCTGNCTGCATTAACAGATGAATGAAAT]

[+] EMBL CD083177             [CAGAATTCGGCACGAGGACCATTCATCATTCATTATCACTGAATTTAAATTATATCAGTTTAGTACCTAAAAAAATAACACTGATATCTTATTTGTTAGTTTGATTGGGATAACGTCATGGATTTATTACAATATTTAAGGATTAATATTAATATTTAACCTTCCTTCACTTTGTAATCAATATCGAGGAGCGAATTCAAAACCCTAGTGATTTGGTACTGTTTCGAAAATCAAACTTGCAAAACGTTTTGTATTTTGAATTTTTTTTAGTATCTTCGTTTCCCAAGACTCTAGAAACCTTATAAATAAGGTCAAACTAGTTAGTACGATTTAAAAAGTGACAAAATAATAATGGTCTATTGCTGTTGTGATGGTGTAGCGATCTTTTATTATGGTTTCTGTGTGATCGCATTCTAGGTTTTGTACAAACTTTAATTCAAACAGTTTGTGACTTCGATTCATCTTTACACTCCTAACAACTCCTCTTCACGAGCGTTTGTGATTTTCGGGACATACCTTTTTTTTATTCATTTCCTTGTTAATTTTATTGTTGTGTACTTGTGTTTGTCCATACACTTATCGTTCTCTTCTTGCTCACACTATTTATTCAGTATTTCGGATTTTATTAATGCTTGTAACGAGTGGTATTTTGAGTAGTGAGATTTTGTCTTCTCTGATATTTGCTTCTTTTAT ATCTGNCTGCATTAACAGATGAATGAAA ]
[-] EMBL CD076751             [                                                                                                                                       TTAAGGATTAATATTAATATTTAACCTTCCTTCACTTTGTAATCAATATCGAGGAGCGAATTCAAAACCCTAGTGATTTGGTACTGTTTCGAAAATCAAACTTGCAAAACGTTTTGTATTTTGAATTTTTTTTAGTATCTTCGTTTCCCAAGACTCTAGAAACCTTATAAATAAGGTCAAACTAGTTAGTACGATTTAAAAAGTGACAAAATAATAATGGTCTATTGCTGTTGTGATGGTGTAGCGATCTTTTATTATGGTTTCTGTGTGATCGCATTCTAGGTTTTGTACAAACTTTAATTCAAACAGTTTGTGACTTCGATTCATCTTTACACTCCTAACAACTCCTCTTCACGAGCGTTTGTGATTTTCGGGACATACCTTTTTTTTATTCATTTCCCTGTTAATTTTATTGTTGTGTACTTGTGTTTGTCCATACACTTATCGTTCTCTTCTTGCTCACACTATTTATTCAGTATTTCGGATTTTATTAATGCTTGTAACGAGTGGTATTTTGAGTAGTGAGATTTTGTCTTCTCTGATATTTGCTTCTTTTATAATCTGTCTGCATTAACAGATGAATGAAAT]


>consensus_1397#0 CAGAATTCGGCACGAGGACCATTCATCATTCATTATCACTGAATTTAAATTATATCAGTT TAGTACCTAAAAAAATAACACTGATATCTTATTTGTTAGTTTGATTGGGATAACGTCATG GATTTATTACAATATTTAAGGATTAATATTAATATTTAACCTTCCTTCACTTTGTAATCA ATATCGAGGAGCGAATTCAAAACCCTAGTGATTTGGTACTGTTTCGAAAATCAAACTTGC AAAACGTTTTGTATTTTGAATTTTTTTTAGTATCTTCGTTTCCCAAGACTCTAGAAACCT TATAAATAAGGTCAAACTAGTTAGTACGATTTAAAAAGTGACAAAATAATAATGGTCTAT TGCTGTTGTGATGGTGTAGCGATCTTTTATTATGGTTTCTGTGTGATCGCATTCTAGGTT TTGTACAAACTTTAATTCAAACAGTTTGTGACTTCGATTCATCTTTACACTCCTAACAAC TCCTCTTCACGAGCGTTTGTGATTTTCGGGACATACCTTTTTTTTATTCATTTCCTTGTT AATTTTATTGTTGTGTACTTGTGTTTGTCCATACACTTATCGTTCTCTTCTTGCTCACAC TATTTATTCAGTATTTCGGATTTTATTAATGCTTGTAACGAGTGGTATTTTGAGTAGTGA GATTTTGTCTTCTCTGATATTTGCTTCTTTTATATCTGNCTGCATTAACAGATGAATGAA AT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)