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Schistosoma mansoni
cluster # 1444 cluster # 1444       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1444#0 length = 823 sequences # 2  

consensusID : consensus_1444#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 823
fasta sequence
                              [CCTCCAGGCCANATTCGGCACGAGGGGCAAAATCCATCAAACCAATTCCTGTCATGCTGCTGAGTGTATTGCTAGCTAGACGGCGTTATCCTTTGCAGAAATACATTTTTGTGACAATGATTTCCTTCGGTGTAGCACTTTTCATGTTCAATTGGCATTCAACGAGAGATTCCGCCAGCTACTTCGGCTTTGGAGAATGTCTTTTGATATCTTCGTTACTTCTCGATGGTGTTACTGGCGGAGTCCAAGAAGAACTTAAAAAATATAACGTCGGTTCCTACACTCTAATGATGCATATGAACCTTTGGTCTATCATCTACTTAGTGCCAGTGATTGTGTTCTCCGGAGAAGTTTCACCGTTCTTGGAGTTTATTAAACGTCATCCACATATTTTTTACGACATGAGCATTTTTGGTTTGACAAGTGCTGTTGGCCAGATATTTCTATTTGGTTTGATCACAAACTTCAGCCCATTAACTTGTTCAATTGTGACTACAACAAGAAAGTTTTTCACAGTTCTCTTCTCAATTATTTTATTTGGTCATAGTATGACAACATGCCAGTGGATAGGGACGGTATTAATATTTTCTGGTTTATTACTTGATCAGACCTATGGTAAAACACGTTCTAAACAGTCGTCCAACAACACANATAATATCAATGGGACAATGAATTCAGTTAAGAGTCATATTGAATTAGAAAAGAAAAGTGAATAATATGTTGTTTATGCAAAATAATCGAAATGTAACANATATACGAGTTTTCTTTTTATATTGAATCCCATGTAATTGGTATGNCTTTTTGNCTATATTTTTTAAATTTG]

[+] EMBL CD080204             [CCTCCAGGCCANATTCGGCACGAGGGGCAAAATCCATCAAACCAATTCCTGTCATGCTGCTGAGTGTATTGCTAGCTAGACGGCGTTATCCTTTGCAGAAATACATTTTTGTGACAATGATTTCCTTCGGTGTAGCACTTTTCATGTTCAATTGGCATTCAACGAGAGATTCCGCCAGCTACTTCGGCTTTGGAGAATGTCTTTTGATATCTTCGTTACTTCTCGATGGTGTTACTGGCGGAGTCCAAGAAGAACTTAAAAAATATAACGTCGGTTCCTACACTCTAATGATGCATATGAACCTTTGGTCTATCATCTACTTAGTGCCAGTGATTGTGTTCTCCGGAGAAGTTTCACCGTTCTTGGAGTTTATTAAACGTCATCCACATATTTTTTACGACATGAGCATTTTTGGTTTGACAAGTGCTGTTGGCCAGATATTTCTATTTGGTTTGATCACAAACTTCAGCCCATTAACTTGTTCAATTGTGACTACAACAAGAAAGTTTTTCACAGTTCTCTTCTCAATTATTTTATTTGGTCATAGTATGACAACATGCCAGTGGATAGGGACGGTATTAATATTTTCTGGTTTATTACTTGATCAGACCTATGGTAAAACACGTTCTAAACAGTCGTCCAACAACACANATAATATCAATGGGACAATGAATTCAGTTAAGAGTCATATTGAATTAGAAAAGAAAAGTGAATAATATGTTGTTTATGCAAAATAATCGAAATGTAACANATATACGAGTTTTCTTTTTATATTGAATCCCATGTAATTGGTATGNCTTTTTGNCTATATTTTTTAAATTTG]
[-] EMBL CD076934             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGAACCTTTGGTCTATCATCTACTTAGTGCCAGTGATTGTGTTCTCCGGAGAAGTTTCACCGTTCTTGGAGTTTATTAAACGTCATCCACATATTTTTTACGACATGAGCATTTTTGGTTTGACAAGTGCTGTTGGCCAGATATTTCTATTTGGTTTGATCACAAACTTCAGCCCATTAACTTGTTCAATTGTGACTACAACAAGAAAGTTTTTCACAGTTCTCTTCTCAATTATTTTATTTGGTCATAGTATGACAACATGCCAGTGGATAGGGACGGTATTAATATTTTCTGGTTTATTACTTGATCAGACCTATGGTAAAACACGTTTTAAACAGTCGTCCAACAACACAAATAATATCAATGGGACAATGAATTCAGTTAAGAGTCATATTGAATTAGAAAAGAAAAGTGAATAATATGTTGTTTATGCAAAATAATCGAAATGTAACAAATAGGCGAGTTTTTTT                                                        ]


>consensus_1444#0 CCTCCAGGCCANATTCGGCACGAGGGGCAAAATCCATCAAACCAATTCCTGTCATGCTGC TGAGTGTATTGCTAGCTAGACGGCGTTATCCTTTGCAGAAATACATTTTTGTGACAATGA TTTCCTTCGGTGTAGCACTTTTCATGTTCAATTGGCATTCAACGAGAGATTCCGCCAGCT ACTTCGGCTTTGGAGAATGTCTTTTGATATCTTCGTTACTTCTCGATGGTGTTACTGGCG GAGTCCAAGAAGAACTTAAAAAATATAACGTCGGTTCCTACACTCTAATGATGCATATGA ACCTTTGGTCTATCATCTACTTAGTGCCAGTGATTGTGTTCTCCGGAGAAGTTTCACCGT TCTTGGAGTTTATTAAACGTCATCCACATATTTTTTACGACATGAGCATTTTTGGTTTGA CAAGTGCTGTTGGCCAGATATTTCTATTTGGTTTGATCACAAACTTCAGCCCATTAACTT GTTCAATTGTGACTACAACAAGAAAGTTTTTCACAGTTCTCTTCTCAATTATTTTATTTG GTCATAGTATGACAACATGCCAGTGGATAGGGACGGTATTAATATTTTCTGGTTTATTAC TTGATCAGACCTATGGTAAAACACGTTCTAAACAGTCGTCCAACAACACANATAATATCA ATGGGACAATGAATTCAGTTAAGAGTCATATTGAATTAGAAAAGAAAAGTGAATAATATG TTGTTTATGCAAAATAATCGAAATGTAACANATATACGAGTTTTCTTTTTATATTGAATC CCATGTAATTGGTATGNCTTTTTGNCTATATTTTTTAAATTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)