cluster # 1521

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Schistosoma mansoni
cluster # 1521 cluster # 1521 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1521#0 length = 616 sequences # 2

consensusID : consensus_1521#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 616
fasta sequence

                              [AATGTTATTGAATCATTCACTACAGATAATATACAATTCTATCATAATTTATCTGTATTAATCCATCAAGAATTACCTATATCAAATCGTTATTTATTAGCATGGATTATACAACATATGATGCATATTATTGATAGAGCTGGTGAAAATCGTATGACATTAGCTAATATTATTATTGTATTATCACCATGTTTAGGTATAAGTCATCGTTTATTGGGTATATTATTAAATCCTATACCGCCTAAAGATTTTTCTTTGGATCTATGTAAATTAGATCCAAAATTGCCTCCATTCACGACAAATAATATTGATCCAAGTAATTGGCATTGGTTATTTCCTCATCCAATCTATCTATTAAAATCTTATATACCTCCATTAAAATCATTATATGGATTAGAGTTGCCTGATACTAATGAAGAATTAGATATTGAATTGAAGAAACAGGAATCATTGCTTGCTTATTTATGTGAACAAATTCAAATGGATAGTGATGAAGGCAATTCTAGCAAAGAATATCATTTACGTAATGTACAGCATATAATGACAGAACTAAAACGACGTAAAAGCTTAACAGATCCTGAAGCGATTCGACAAGAAATAATTAAACAACAAGCAC]

[+] EMBL CD163084             [AATGTTATTGAATCATTCACTACAGATAATATACAATTCTATCATAATTTATCTGTATTAATCCATCAAGAATTACCTATATCAAATCGTTATTTATTAGCATGGATTATACAACATATGATGCATATTATTGATAGAGCTGGTGAAAATCGTATGACATTAGCTAATATTATTATTGTATTATCACCATGTTTAGGTATAAGTCATCGTTTATTGGGTATATTATTAAATCCTATACCGCCTAAAGATTTTTCTTTGGATCTATGTAAATTAGATCCAAAATTGCCTCCATTCACGACAAATAATATTGATCCAAGTAATTGGCATTGGTTATTTCCTCATCCAATCTATCTATTAAAATCTTATATACCTCCATTAAAATCATTATATGGATTAGAGTTGCCTGATACTAATGAAGAATTAGATATTGAATTGAAGAAACAGGAATCATTGCTTGCTTATTTATGTGAACAAATTCAAATGGATAGTGATGAAGGCAATTCTAGCAAAGAATATCATTTACGTAATGTACAGCATATAATGACAGAACTAAAACGACGTAAAAGCTTAACAGATCCTGAAGCGATTCGACAAGAAATAATTAAACAACAAGCAC]
[+] EMBL CD162778             [AATGTTATTGAATCATTCACTACAGATAATATACAATTCTATCATAATTTATCTGTATTAATCCATCAAGAATTACCTATATCAAATCGTTATTTATTAGCATGGATTATACAACATATGATGCATATTATTGATAGAGCTGGTGAAAATCGTATGACATTAGCTAATATTATTATTGTATTATCACCATGTTTAGGTATAAGTCATCGTTTATTGGGTATATTATTAAATCCTATACCGCCTAAAGATTTTTCTTTGGATCTATGTAAATTAGATCCAAAATTGCCTCCATTCACGACAAATAATATTGATCCAAGTAATTGGCATTGGTTATTTCCTCATCCAATCTATCTATTAAAATCTTATATACCTCCATTAAAATCATTATATGGATTAGAGTTGCCTGATACTAATGAAGAATTAGATATTGAATTGAAGAAACAGGAATCATTGCTTGCTTATTTATGTGAACAAATTCAAATGGATAGTGATGAAGGCAATTCTAGCAAAGAATATCATTTACGTAATGTACAGCATATAATGACAGAACTAAAACGACGTANAAGCTTAACAGATCCTGAAGCGATTCGAncag                     ]




>consensus_1521#0
AATGTTATTGAATCATTCACTACAGATAATATACAATTCTATCATAATTTATCTGTATTA
ATCCATCAAGAATTACCTATATCAAATCGTTATTTATTAGCATGGATTATACAACATATG
ATGCATATTATTGATAGAGCTGGTGAAAATCGTATGACATTAGCTAATATTATTATTGTA
TTATCACCATGTTTAGGTATAAGTCATCGTTTATTGGGTATATTATTAAATCCTATACCG
CCTAAAGATTTTTCTTTGGATCTATGTAAATTAGATCCAAAATTGCCTCCATTCACGACA
AATAATATTGATCCAAGTAATTGGCATTGGTTATTTCCTCATCCAATCTATCTATTAAAA
TCTTATATACCTCCATTAAAATCATTATATGGATTAGAGTTGCCTGATACTAATGAAGAA
TTAGATATTGAATTGAAGAAACAGGAATCATTGCTTGCTTATTTATGTGAACAAATTCAA
ATGGATAGTGATGAAGGCAATTCTAGCAAAGAATATCATTTACGTAATGTACAGCATATA
ATGACAGAACTAAAACGACGTAAAAGCTTAACAGATCCTGAAGCGATTCGACAAGAAATA
ATTAAACAACAAGCAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case