Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1538 cluster # 1538       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1538#0 length = 452 sequences # 2  

consensusID : consensus_1538#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 452
fasta sequence
                              [CCTAATGATAATTGACTAGCAGCTAAATGTAACGGTGTTGAATGATCAATTAAACATGTTCTAGCTGATATACATGCACCATGATTAATCAATAAATCAGCTACTAATGGACAATCAAAATAAGCTGCATAATGTAACGGTGTCATATCAGTCCATTTACAACGAGCTTCAAGATTAGCACCTTCATCTAATAAATAATTAGCAATACGACACGAAGCTTGTTCATCGCCTAATGCACCGGATTTTGCAGTAAAATGTAATAAAGTCATATCACTTAGACCGTCACGATCATCAACATGAGCACCACGTCTAAATATCTCTTCAACTATTGTAATTAATTGTAACTGTGCATAAGGTGTCCATTGACGTAAAATAGCAAATAATTGTGATATAGTTAAATTAGTTGATGTCACTGATCCTTGACAATCTTCACACCACCATGGGACCACAGG]

[+] EMBL CD061229             [CCTAATGATAATTGACTAGCAGCTAAATGTAACGGTGTTGAATGATCAATTAAACATGTTCTAGCTGATATACATGCACCATGATTAATCAATAAATCAGCTACTAATGGACAATCAAAATAAGCTGCATAATGTAACGGTGTCATATCAGTCCATTTACAACGAGCTTCAAGATTAGCACCTTCATCTAATAAATAATTAGCAATACGA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD202787             [          ATTGACTAGCACCTAAATGTAACGGTGTTGAATGATCGATTAAACATGTTCTAGCTGATATACATGCACCACGATTAATCAATAAATCAGCTAATAATGGACAATCAAAATGAGCTGCATAATGTAACGGTGTCATATCAGTCCATTTACAACGAGCTTCAAGATTAGCACCTTCATCTAATAAATAATTAGCAATACGACACGAAGCTTGTTCATCGCCTAATGCACCGGATTTTGCAGTAAAATGTAATAAAGTCATATCACTTAGACCGTCACGATCATCAACATGAGCACCACGTCTAAATATCTCTTCAACTATTGTAATTAATTGTAACTGTGCATAAGGTGTCCATTGACGTAAAATAGCAAATAATTGTGATATAGTTAAATTAGTTGATGTCACTGATCCTTGACAATCTTCACACCACCATGGGACCACAGG]


>consensus_1538#0 CCTAATGATAATTGACTAGCAGCTAAATGTAACGGTGTTGAATGATCAATTAAACATGTT CTAGCTGATATACATGCACCATGATTAATCAATAAATCAGCTACTAATGGACAATCAAAA TAAGCTGCATAATGTAACGGTGTCATATCAGTCCATTTACAACGAGCTTCAAGATTAGCA CCTTCATCTAATAAATAATTAGCAATACGACACGAAGCTTGTTCATCGCCTAATGCACCG GATTTTGCAGTAAAATGTAATAAAGTCATATCACTTAGACCGTCACGATCATCAACATGA GCACCACGTCTAAATATCTCTTCAACTATTGTAATTAATTGTAACTGTGCATAAGGTGTC CATTGACGTAAAATAGCAAATAATTGTGATATAGTTAAATTAGTTGATGTCACTGATCCT TGACAATCTTCACACCACCATGGGACCACAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)