cluster # 1540

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Schistosoma mansoni
cluster # 1540 cluster # 1540 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1540#0 length = 614 sequences # 2

consensusID : consensus_1540#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 614
fasta sequence

                              [TCAATTTAAGATTGTCAACAAATTCTTTCAATTCTCTTAATTAAAAACATTTCATTTACATTCGACTTTAGTGATCAGATTGTTGTCTTCGACTTTCTATCGTTTAAGATTTTTAAATTTGTGTGTACTTATTCTTAATGATTGTGTGTATGAACGATTAAGAAATCCAAACTAGAGGTGACGAAAATGTTGTATCACGTTTACGTCTGACGCTGATTCTGTAACAACAACAGCGAACGGGAAAATAACAGGGTTTATCATGCTCATTTTGGTCTTGTATTTAAATCATATGTATTCACCACAATAATCTACCTGAAGATTTCATGATATCATTAACATCGTGAATTGTATAATTATCTAAGTTGAACTATTGTAGATAAAAATGACAGTCGTATTCAGTTCTGCGTGTACAATCTACAAATAAACGCACATATACCAATGAATATGTTGTAGTATACAGATATTAAACATCCAACTTTTTTATATTACCTTCTTCAACTGTGTTCGCAACACTTACAATTTCGTCATCGTTATTGCTTGAATAATTNTGATGACATTTGATCTCTATTCGAAGTAACTAATTGCTATTCGTANAAAAGTTTAGCCAGAAAGCC]

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[+] EMBL CD077383             [                      gaggTTCAATTCTCTTAATTAAAAACATTTCATTTACATTCGACTTTAGTGATCAGATTGTTGTCTTCGACTTTCTATCGTTTAAGATTTTTAAATTTGTGTGTACTTATTCTTAATGATTGTGTGTATGAACGATTAAGAAATCCAAACTAGAGGTGACGAAAATGTTGTATCACGTTTACGTCTGACGCTGATTCTGTAACAACAACAGCGAACGGGAAAATAACAGGGTTTATCATGCTCATTTTGGTCTTGTATTTAAATCATATGTATTCACCACAATAATCTACCTGAAGATTTCATGATATCATTAACATCGTGAATTGTATAATTATCTAAGTTGAACTATTGTAGATAAAAATGACAGTCGTATTCAGTTCTGCGTGTACAATCTACAAATAAACGCACATATACCAATGAATATGTTGTAGTATACAGATATTAAACATCCAACTTAATTATATTA                                                                                                                              ]




>consensus_1540#0
TCAATTTAAGATTGTCAACAAATTCTTTCAATTCTCTTAATTAAAAACATTTCATTTACA
TTCGACTTTAGTGATCAGATTGTTGTCTTCGACTTTCTATCGTTTAAGATTTTTAAATTT
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AATAATTNTGATGACATTTGATCTCTATTCGAAGTAACTAATTGCTATTCGTANAAAAGT
TTAGCCAGAAAGCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case