Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1545 cluster # 1545       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1545#0 length = 500 sequences # 2  

consensusID : consensus_1545#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 500
fasta sequence
                              [CGATACGAATCAAAATAGTGTATGAACTTAAATTCAATTCATTTCGTTTTACTCCTCTATTACCTTTGATTATTGTAACAAAAACATTTTCGACAACTTAATTAATTCACGTTAAAATACGTTGCTAACTTATTAATTTTAAACGAGTTCATGAACCGATCAATGTTAGACCACCATTGAAAGCCTGAAAGCACTGGACAGCCGTTTGGTCCAGTCAGTCCATGTCGTCCCACATAAATTACGGAGTAAAAGATGAATTTAAAATAGGAAGATAAAGATTTCATATGTAATATTTAATATATTATTGTACCCAGAAGAGTTTTCAAAATCTTACATAAAATAGTCTTAAAGACAAACAAAAGTGTTAACTGAATTGAGGACATAGACACCAGATCACTGATGGGATTAAATGGCGTTCACGTTTTATATCGTCAATCAGTTAAAGGTGAATACATAAATCATCGGATCTCTACCCAATGGCTAGAAGTTTGTGAAAAAAA]

[+] EMBL CD077399             [CGATACGAATCAAAATAGTGTATGAACTTAAATTCAATTCATTTCGTTTTACTCCTCTATTACCTTTGATTATTGTAACAAAAACATTTTCGACAACTTAATTAATTCACGTTAAAATACGTTGCTAACTTATTAATTTTAAACGAGTTCATGAACCGATCAATGTTAGACCACCATTGAAAGCCTGAAAGCACTGGACAGCCGTTTGGTCCAGTCAGTCCATGTCGTCCCACATAAATTACGGAGTAAAAGATGAATTTAAAATAGGAAGATAAAGATTTCATATGTAATATTTAATATATTATTGTACCCAGAAGAGTTTTCAAAATCTTACATAAAATAGTCTTAAAGACAAACAAAAGTGTTAACTGAATTGAGGACATAGACACCAGATCACTGATGGGATTAAATGGCGTTCACGTTTTATATCGTCAATCAGTTAAAGGTGAATACATAAATCATCGGATCTCTACCCAATGGCTAGAAGTTTGTGAAAAAAA]
[+] EMBL AI559037             [       AATCAAAATAGTGTATGAACTTAAATTCAATTCATTTCGTTTTACTCCTCTATTACCTTTGATTATTGTAACAAAAACATTTTCGACAACTTAATTAATTCACGTTAAAATACGTTGCTAACTTATTAATTTTAAACGAGTTCATGAACCGATCAATGTTAGACCACCATTGAAAGCCTGAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_1545#0 CGATACGAATCAAAATAGTGTATGAACTTAAATTCAATTCATTTCGTTTTACTCCTCTAT TACCTTTGATTATTGTAACAAAAACATTTTCGACAACTTAATTAATTCACGTTAAAATAC GTTGCTAACTTATTAATTTTAAACGAGTTCATGAACCGATCAATGTTAGACCACCATTGA AAGCCTGAAAGCACTGGACAGCCGTTTGGTCCAGTCAGTCCATGTCGTCCCACATAAATT ACGGAGTAAAAGATGAATTTAAAATAGGAAGATAAAGATTTCATATGTAATATTTAATAT ATTATTGTACCCAGAAGAGTTTTCAAAATCTTACATAAAATAGTCTTAAAGACAAACAAA AGTGTTAACTGAATTGAGGACATAGACACCAGATCACTGATGGGATTAAATGGCGTTCAC GTTTTATATCGTCAATCAGTTAAAGGTGAATACATAAATCATCGGATCTCTACCCAATGG CTAGAAGTTTGTGAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)