cluster # 1547

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1547 cluster # 1547 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1547#0 length = 617 sequences # 2

consensusID : consensus_1547#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 617
fasta sequence

                              [AAATTGATATAATTTATTATTGTTTGATAAGTCACTTTTATTCTTTTCCTCTTCATATTGAAAATTTACACTGAATAAATTTCCATTATTTAATTCATCAAATGGATCTTCATAACCAAATAATGAAATGTCTAAATAGGATTTACGATTTGACCAATCAATTAAAATNGACTTCTTGAAAAATTGTACTATGCACAACTTGTTGTTCAGATGAAATCGTCATCGTAAATTTATCATGGTTAGTTTCAGGTAGAGATTTTGTTCCAGTAGAAAAATTAATAGGAACTTCAAATGCATACAATAATTGATCAAGAAGCTGATGAACTGCAGTCAGTGAATGTGGACATTTACGATTGACTGGTAGACGAATTAATTCGACTAAAAATCTCACGGGATTAGTGAATAACAACAATTCACAATCTAGAAGAAAATCTTTATTGAAGAGATTTAACACTTGTTGACTATTGTCATAATTATCATCGCTAGAATTTACATTAGAAACAACCAAACGATTGAATAATTGACGAATACGTGTTTGAAAGTGTACAGTCGAATTAAGCAATGGAGTTGATCGATTAGCATTTTTCACTGATGATTGAAGTGATGTTAATAGATCA]

[-] EMBL CD130585             [AAATTGATATAATTTATTATTGTTTGATAAGTCACTTTTATTCTTTTCCTCTTCATATTGAAAATTTACACTGAATAAATTTCCATTATTTAATTCATCAAATGGATCTTCATAACCAAATAATGAAATGTCTAAATAGGATTTACGATTTGACCAATCAATTAAAATNGACTTCTTGAAAAATTGTACTATGCACAACTTGTTGTTCAGATGAAATCGTCATCGTAAATTTATCATGGTTAGTTTCAGGTAGAGATTTTGTTCCAGTAGAAAAATTAATAGGAACTTCAAATGCATACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD119136             [                                                                                                                                                                                                                                         TCATGGTTAGTTTCAGGTAGAGATTTTGTTCCAGTAGAAAAATTAATAGGAACTTCAAATGCATACAATAATTGATCAAGAAGCTGATGAACTGCAGTCAGTGAATGTGGACATTTACGATTGACTGGTAGACGAATTAATTCGACTAAAAATCTCACGGGATTAGTGAATAACAACAATTCACAATCTAGAAGAAAATCTTTATTGAAGAGATTTAACACTTGTTGACTATTGTCATAATTATCATCGCTAGAATTTACATTAGAAACAACCAAACGATTGAATAATTGACGAATACGTGTTTGAAAGTGTACAGTCGAATTAAGCAATGGAGTTGATCGATTAGCATTTTTCACTGATGATTGAAGTGATGTTAATAGATCA]




>consensus_1547#0
AAATTGATATAATTTATTATTGTTTGATAAGTCACTTTTATTCTTTTCCTCTTCATATTG
AAAATTTACACTGAATAAATTTCCATTATTTAATTCATCAAATGGATCTTCATAACCAAA
TAATGAAATGTCTAAATAGGATTTACGATTTGACCAATCAATTAAAATNGACTTCTTGAA
AAATTGTACTATGCACAACTTGTTGTTCAGATGAAATCGTCATCGTAAATTTATCATGGT
TAGTTTCAGGTAGAGATTTTGTTCCAGTAGAAAAATTAATAGGAACTTCAAATGCATACA
ATAATTGATCAAGAAGCTGATGAACTGCAGTCAGTGAATGTGGACATTTACGATTGACTG
GTAGACGAATTAATTCGACTAAAAATCTCACGGGATTAGTGAATAACAACAATTCACAAT
CTAGAAGAAAATCTTTATTGAAGAGATTTAACACTTGTTGACTATTGTCATAATTATCAT
CGCTAGAATTTACATTAGAAACAACCAAACGATTGAATAATTGACGAATACGTGTTTGAA
AGTGTACAGTCGAATTAAGCAATGGAGTTGATCGATTAGCATTTTTCACTGATGATTGAA
GTGATGTTAATAGATCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case