cluster # 1561

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Schistosoma mansoni
cluster # 1561 cluster # 1561 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1561#0 length = 537 sequences # 2

consensusID : consensus_1561#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 537
fasta sequence

                              [TCTTTGTAACTAACTACTCAATCCCCCTTTATTTTCTATTTATGTATAATATACAATTGTATTGATAAGACCATCAATTAGTAGTAGTATCATTATCACCATCTATTTAAATTCACTTGTTATATATTGAAATATTCATTCAAAAACGTGCTCAATTCAGTGTTTTATGTGCATCGGTAATCGATTATGCAGCAAAACATTCAAACCACGTAAAAATATCTCTGATACTAATAATAATACTACTAATAACAATACAAATAATCATCATACTACTATTGGTAATAATAATAATAATAATAATGATGTTATTGGTAAACAAAATGATTTATTACCAGAAACTGCTGCAACATTGGGTAGTGGAGATTTACGTTTAGCAGTTCGTTTACCTGAAGGTGAAGATTTACATGAATGGATTGCAATAAATAC-TGTAGATTNTTTCAATCAAATTAATATGCTTTATGGTACATTACTTGAATTTTGTACGGATGATACATGTCCAATTATGTCAGCTGGTCCAAAATATGAATATCATTGGGC]

[+] EMBL AW017245             [TCTTTGTAACTAACTACTCAATCCCCCTTTATTTTCTATTTATGTATAATATACAATTGTATTGATAAGACCATCAATTAGTAGTAGTATCATTATCACCATCTATTTAAATTCACTTGTTATATATTGAAATATTCATTCAAAAACGTGCTCAATTCAGTGTTTTATGTGCATCGGTAATCGATTATGCAGCAAAACATTCAAACCACGTAAAAATATCTCTGATACTAATAATAATACTACTAATAACAATACAAATAATCATCATACTACTATTGGTAATAATAATAATAATAATAATGATGTTATTGGTAAACAAAATGATTTATTACCAGAAACTGCTGCAACATTGGGTAGTGGAGATTTACGTTTAGCAGTTCGTTTACCTGAAGGTGAAGATTTACATGAATGGATTGCAATAAATAC TGTAGATTNTTTCAATCAAATTAATATGCTTTATGGTACATTACTTGAATTTTGTACGGATGATACATGTCCAATTATGTCAGCTGGTCCAAAATATGAATATCATTGGGC]
[+] EMBL CD077475             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggTAATAATAATAATAATAATAATGTTATTGGTAAACAAAATGATTTATTACCAGAAACTGCTGCAACATTGGGTAGTGGAGATTTACGTTTAGCAGTTCGTTTACCTGAAGGTGAAGATTTACATGAATGGATTGCAATAAATACTTGTAGATTtt                                                                                                     ]




>consensus_1561#0
TCTTTGTAACTAACTACTCAATCCCCCTTTATTTTCTATTTATGTATAATATACAATTGT
ATTGATAAGACCATCAATTAGTAGTAGTATCATTATCACCATCTATTTAAATTCACTTGT
TATATATTGAAATATTCATTCAAAAACGTGCTCAATTCAGTGTTTTATGTGCATCGGTAA
TCGATTATGCAGCAAAACATTCAAACCACGTAAAAATATCTCTGATACTAATAATAATAC
TACTAATAACAATACAAATAATCATCATACTACTATTGGTAATAATAATAATAATAATAA
TGATGTTATTGGTAAACAAAATGATTTATTACCAGAAACTGCTGCAACATTGGGTAGTGG
AGATTTACGTTTAGCAGTTCGTTTACCTGAAGGTGAAGATTTACATGAATGGATTGCAAT
AAATACTGTAGATTNTTTCAATCAAATTAATATGCTTTATGGTACATTACTTGAATTTTG
TACGGATGATACATGTCCAATTATGTCAGCTGGTCCAAAATATGAATATCATTGGGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case