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Schistosoma mansoni
cluster # 1595 cluster # 1595       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1595#0 length = 513 sequences # 2  

consensusID : consensus_1595#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 513
fasta sequence
                              [TTGCCAGCTAGGTGGCCTTCGTTGTTATTTGGCTGATTGCTTAACCTCTGTGGGCCTCAGTTTTCTCCTTTGTAAAATGAGGATCTAATTTTTGACTTTCCTACCTTCTGTTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGTTTGAATGAGGTAATTTAGTTAATAGCAGTTTGTAAAATATAGATACCAGTAGCTTTTATTATTATGGCAATTACACAGGCAATGGTCCTGGTTAAAATTAGCAGGGGCCATATATTTCTTCCCCTTGTAGAATTCTAGCTTTCAGACTCATGGTAACATTTGTTTATCTTACTACTGAAAAGATTTTTTTGGTTGCTTTGAGCTCATTCCTTGATCTCCTTTCTGTTTCCTCATTAAAAAAGAAAAGAATAGCTAATGAATTACAGATGCTGTAAATGCCAAGCAATGACAACAGGCTGCTCTCAGGGGTCCAGTATCCTTGCATTCCACCGTATCTGTCTCTTCCACTTTCTCTT]

[+] EMBL CD117471             [TTGCCAGCTAGGTGGCCTTCGTTGTTATTTGGCTGATTGCTTAACCTCTGTGGGCCTCAGTTTTCTCCTTTGTAAAATGAGGATCTAATTTTTGACTTTCCTACCTTCTGTTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGTTTGAATGAGGTAATTTAGTTAATAGCAGTTTGTAAAATATAGATACCAGTAGCTTTTATTATTATGGCAATTACACAGGCAATGGTCCTGGTTAAAATTAGCAGGGGCCATATATTTCTTCCCCTTGTAGAATTCTAGCTTTCAGACTCATGGTAACATTTGTTTATCTTACTACTGAAAAGATTTTTTTGGTTGCTTTGAGCTCATTCCTTGATCTCCTTTCTGTTTCCTCATTAAAAAAGAAAAGAATAGCTAATGAATTACAGATGCTGTAAATGCCAAGCAATGACAACAGGCTGCTCTCAGGGGTCCAGTATCCTTGCATTCCACCGTATCTGTCTCTTCCACTTTCTCTT]
[+] EMBL CD117585             [TTGCCAGCTAGGTGGCCTTCGTTGTTATTTGGCTGATTGCTTAACCTCTGTGGGCCTCAGTTTTCTCCTTTGTAAAATGAGGATCTAATTTTTGACTTTCCTACCTTCTGTTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGTTTGAATGAGGTAATTTAGTTAATAGCAGTTTGTAAAATATAGATACCAGTAGCTTTTATTATTATGGCAATTACACAGGCAATGGTCCTGGTTAAAATTAGCAGGGGCCATATATTTCTTCCCCTTGTAGAATTCTAGCTTTCAGACTCATGGTAACATTTGTTTATCTTACTACTGAAAAGATTTTTTTGGTTGCTTTGAGCTCATTCCTTGATCTCCTTTCTGTTTCCTCATTAAAAAAGAAAAGAATAGCTAATGAATTACAGATGCTGTAAATGCCAAGCAATGACA                                                                 ]


>consensus_1595#0 TTGCCAGCTAGGTGGCCTTCGTTGTTATTTGGCTGATTGCTTAACCTCTGTGGGCCTCAG TTTTCTCCTTTGTAAAATGAGGATCTAATTTTTGACTTTCCTACCTTCTGTTTTGTGTGT GTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGTTTGAATGAGGTAATTTAGTTAAT AGCAGTTTGTAAAATATAGATACCAGTAGCTTTTATTATTATGGCAATTACACAGGCAAT GGTCCTGGTTAAAATTAGCAGGGGCCATATATTTCTTCCCCTTGTAGAATTCTAGCTTTC AGACTCATGGTAACATTTGTTTATCTTACTACTGAAAAGATTTTTTTGGTTGCTTTGAGC TCATTCCTTGATCTCCTTTCTGTTTCCTCATTAAAAAAGAAAAGAATAGCTAATGAATTA CAGATGCTGTAAATGCCAAGCAATGACAACAGGCTGCTCTCAGGGGTCCAGTATCCTTGC ATTCCACCGTATCTGTCTCTTCCACTTTCTCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)