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Schistosoma mansoni
cluster # 162 cluster # 162       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_162#0 length = 458 sequences # 2  

consensusID : consensus_162#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 458
fasta sequence
                              [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTA--ATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATCAATATTGCAAAGAAATA-TATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAGTTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCGTGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA]

[+] EMBL AI559042             [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTA  ATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATCAATATTGCAAAGAAATA TATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAGTTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCGTGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA]
[+] EMBL AI618835             [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTTCCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTTGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTAATATCATAAATT AAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTTTTGTTTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTTGTGTTTACTACTATGATTATTATTGTTATTTTAATCAATATTGC AAGAAATATTTTCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAACCTTTTTAGTTTCCAATGGGTAATTGTAAATGGGCTA                                                                      ]


>consensus_162#0 ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGT TAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCA GAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTAATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAA TCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCT TATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATC AATATTGCAAAGAAATATATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAG TTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCG TGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)