cluster # 1646

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Schistosoma mansoni
cluster # 1646 cluster # 1646 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1646#0 length = 516 sequences # 2

consensusID : consensus_1646#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 516
fasta sequence

                              [CGTCACGAGGGTTTGTTTAAATTGATACTATGTATTATACAAGCTTATTGATCCTATTCTATCTAATTTGGATTTATTATACAGTACANGGGAAAAGTTTACACTTGACAACATCCAAAAGGCTTTTACCATATTATTATTATATGAATTATTATAAACCCTATTATTATTATTTGAATCATAGATTAAGTAGTTCTGATTATTCATTGAATAGTTATCTTCAATCTTACCAATATCATACATATTCTCAACGACCATATTCTTAAAAAGAATTATCTAATTATTCCTGGAATTGATAAGTTTAAAACTATTGAAAGTGAACATTGAACATATAAAAGAATTTCTGGAATTACTACTGGACATATGAGATATGGTAACGGTTTACCTTATCTAATTTGAGGGGGGATATGTGAATGTGAAAGCGACTCTGCTATACAAATTTTTTGTGCAATCTGGGAGTGGGCTGATATAATTTCGCGTTTCTATGGGATAACACTAGAACTTTTCAATGGGATT]

[+] EMBL CD077790             [CGTCACGAGGGTTTGTTTAAATTGATACTATGTATTATACAAGCTTATTGATCCTATTCTATCTAATTTGGATTTATTATACAGTACANGGGAAAAGTTTACACTTGACAACATCCAAAAGGCTTTTACCATATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI618798             [                                TATTATACAAGCTTATTGATCCTATTCTATCTAATTTGGATTTATTATACAGTACA GGGAAAAGTTTACACT  ACAACATCCAAAAGGCTTTTACCATATTATTATTATATGAATTATTATAAACCCTATTATTATTATTTGAATCATAGATTAAGTAGTTCTGATTATTCATTGAATAGTTATCTTCAATCTTACCAATATCATACATATTCTCAACGACCATATTCTTAAAAAGAATTATCTAATTATTCCTGGAATTGATAAGTTTAAAACTATTGAAAGTGAACATTGAACATATAAAAGAATTTCTGGAATTACTACTGGACATATGAGATATGGTAACGGTTTACCTTATCTAATTTGAGGGGGGATATGTGAATGTGAAAGCGACTCTGCTATACAAATTTTTTGTGCAATCTGGGAGTGGGCTGATATAATTTCGCGTTTCTATGGGATAACACTAGAACTTTTCAATGGGATT]




>consensus_1646#0
CGTCACGAGGGTTTGTTTAAATTGATACTATGTATTATACAAGCTTATTGATCCTATTCT
ATCTAATTTGGATTTATTATACAGTACANGGGAAAAGTTTACACTTGACAACATCCAAAA
GGCTTTTACCATATTATTATTATATGAATTATTATAAACCCTATTATTATTATTTGAATC
ATAGATTAAGTAGTTCTGATTATTCATTGAATAGTTATCTTCAATCTTACCAATATCATA
CATATTCTCAACGACCATATTCTTAAAAAGAATTATCTAATTATTCCTGGAATTGATAAG
TTTAAAACTATTGAAAGTGAACATTGAACATATAAAAGAATTTCTGGAATTACTACTGGA
CATATGAGATATGGTAACGGTTTACCTTATCTAATTTGAGGGGGGATATGTGAATGTGAA
AGCGACTCTGCTATACAAATTTTTTGTGCAATCTGGGAGTGGGCTGATATAATTTCGCGT
TTCTATGGGATAACACTAGAACTTTTCAATGGGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case