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Schistosoma mansoni
cluster # 165 cluster # 165       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_165#0 length = 600 sequences # 2  

consensusID : consensus_165#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 600
fasta sequence
                              [TATGTTAAATATGCTGTTTTTTCTTGTTTCTTAATTGGTTTTGAACTGAACATCGTTGACTGCGGTCATTTGCAGTTGGTGAGAAGCCATGAAATACAATGAATTTATTTTATTCTGTGAATATTGTTCTCCTTGCTTTGCTTAAATTTACCAAGGGATCAGGATGTATGAGATAATAAATTACTTCAAACTTTACAAACAATTTTAGTTAACACTGCATAACCGTTAGTAAAACAATAGGATATTTTCTCTTACAATATTCCCTCTAATTATCTCTTACCTCAAACCAGTTTATTCATGTTTCAATGCTTTCGGTGATTTTATTTCAGGTTTACCTTACCATTTCATGCAATCCATTTCCGTAACTATTAATCTATGAATAGTCCCTATTAGAATCTTGACTAATGCCGTTTTGAAAATTCAACGGAAGATTTGAAGACAGTTTACGATGTAGCAGTCTCATATTATTCACTTGAACCATACACTTGTGCGAGCCTGTGGTAATTTAAACAGGTATATGACAGGAAATTCATCTGGCAATCATATACGTTATGTATTTTAATCTTATGAATTATTTCGTACTTATCCACGTGATCAATT]

[+] EMBL CD156120             [TATGTTAAATATGCTGTTTTTTCTTGTTTCTTAATTGGTTTTGAACTGAACATCGTTGACTGCGGTCATTTGCAGTTGGTGAGAAGCCATGAAATACAATGAATTTATTTTATTCTGTGAATATTGTTCTCCTTGCTTTGCTTAAATTTACCAAGGGATCAGGATGTATGAGATAATAAATTACTTCAAACTTTACAAACAATTTTAGTTAACACTGCATAACCGTTAGTAAAACAATAGGATATTTTCTCTTACAATATTCCCTCTAATTATCTCTTACCTCAAACCAGTTTATTCATGTTTCAATGCTTTCGGTGATTTTATTTCAGGTTTACCTTACCATTTCATGCAATCCATTTCCGTAACTATTAATCTATGAATAGTCCCTATTAGAATCTTGACTAATGCCGTTTTGAAAATTCAACGGAAGATTTGAAGACAGTTTACGATGTAGCAGTCTCATATTATTCACTTGAACCATACACTTGTGCGAGCCTGTGGTAATTTAAACAGGTATATGACAGGAAATTCATCTGGCAATCATATACGTTATGTATTTTAATCTTATGAATTATTTCGTACTTATCCACGTGATCAATT]
[+] EMBL CD156163             [TATGTTAAATATGCTGTTTTTTCTTGTTTCTTAATTGGTTTTGAACTGAACATCGTTGACTGCGGTCATTTGCAGTTGGTGAGAAGCCATGAAATACAATGAATTTATTTTATTCTGTGAATATTGTTCTCCTTGCTTTGCTTAAATTTACCAAGGGATCAGGATGTATGAGATAATAAATTACTTCAAACTTTACAAACAATTTTAGTTAACACTGCATAACCGTTAGTAAAACAATAGGATATTTTCTCTTACAATATTCCCTCTAATTATCTCTTACCTCAAACCAGTTTATTCATGTTTCAATGCTTTCGGTGATTTTATTTCAGGTTTACCTTACCATTTCATGCAATCCATTTCCGTAACTATTAATCTATGAATAGTCCCTATTAGAATCTTGACTAATGCCGTTTTGAAAATTCAACGGAAGATTTGAAGACAGTTTACGATGTAGCAGTCTCATATTATTCACTTGAACCATACACTTGTGCGAGCCTGTGGTAATTTAAACAGGTATATGACAGGAAATTCATCTGGCAATCATATACGTTATGTATTTTAATCTTATGAATTATTTCGTACTTATCCAC          ]


>consensus_165#0 TATGTTAAATATGCTGTTTTTTCTTGTTTCTTAATTGGTTTTGAACTGAACATCGTTGAC TGCGGTCATTTGCAGTTGGTGAGAAGCCATGAAATACAATGAATTTATTTTATTCTGTGA ATATTGTTCTCCTTGCTTTGCTTAAATTTACCAAGGGATCAGGATGTATGAGATAATAAA TTACTTCAAACTTTACAAACAATTTTAGTTAACACTGCATAACCGTTAGTAAAACAATAG GATATTTTCTCTTACAATATTCCCTCTAATTATCTCTTACCTCAAACCAGTTTATTCATG TTTCAATGCTTTCGGTGATTTTATTTCAGGTTTACCTTACCATTTCATGCAATCCATTTC CGTAACTATTAATCTATGAATAGTCCCTATTAGAATCTTGACTAATGCCGTTTTGAAAAT TCAACGGAAGATTTGAAGACAGTTTACGATGTAGCAGTCTCATATTATTCACTTGAACCA TACACTTGTGCGAGCCTGTGGTAATTTAAACAGGTATATGACAGGAAATTCATCTGGCAA TCATATACGTTATGTATTTTAATCTTATGAATTATTTCGTACTTATCCACGTGATCAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)