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Schistosoma mansoni
cluster # 1709 cluster # 1709       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1709#0 length = 613 sequences # 2  

consensusID : consensus_1709#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 613
fasta sequence
                              [CATAATCATTCTAGTCATCATCATCATCATTATCATCAACAGCAGCAGCAGAATAAATGTATTGATGAAAATCTACGTAAAACAGTATCAGAGCCAAGTTTAAAAATGCGTAGCGGATCTGGTGGTGTACAAAAATCTCGTTATAAACCGGATCGTCGTCATTACAATCAACATCATCATCATCATTTTGGAATGAATACAGCAACAGCAGCAGCAGCTGTAGCTGCAGCTGCAATAACTGTATCTAATGATCCATTAGCTATTGTTGGATTATGGCCACAATTGAGTTCAGCATTTCAACATGCAAATTTAATACAAAAAACAATTAATAAAAAACCATTACCACAATTACCAGATATGAATAATAATAATAATAATAATAATGTGAATGGATCAACCATTCGAACAATCTATGGGAAAGCATTATTAAATAAACATGATTTAAGATTTACACCATCTTTGGATAGACCAATAATTTATACATCATCAGGTATTAAAATACCTATAATTAGTGATAATAACATTGATGACAGTAATAATAATGATGTCGATGGCGTTTCTGTGAATAATTTAACTAACAAATCAGAATATTTAATAATGAATANTTATGAAT]

[+] EMBL CD197484             [CATAATCATTCTAGTCATCATCATCATCATTATCATCAACAGCAGCAGCAGAATAAATGTATTGATGAAAATCTACGTAAAACAGTATCAGAGCCAAGTTTAAAAATGCGTAGCGGATCTGGTGGTGTACAAAAATCTCGTTATAAACCGGATCGTCGTCATTACAATCAACATCATCATCATCATTTTGGAATGAATACAGCAACAGCAGCAGCAGCTGTAGCTGCAGCTGCAATAACTGTATCTAATGATCCATTAGCTATTGTTGGATTATGGCCACAATTGAGTTCAGCATTTCAACATGCAAATTTAATACAAAAAACAATTAATAAAAAACCATTACCACAATTACCAGATAT                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD192835             [                                                                                                                                                                                        ATTTTGGAATGAATACAGCAACAGCAGCAGCAGCTGTAGCTGCAGCTGCAATAACTGTATCTAATGATCCATTAGCTATTGTTGGATTATGGCCACAATTGAGTTCAGCATTTCAACATGCAAATTTAATACAAAAAACAATTAATAAAAAACCATTACAACAATTACAAGATATGAATAATAATAATAATAATAATAATGTGAATGGATCAACCATTCGAACAATCTATGGGAAAGCATTATTAAATAAACATGATTTAAGATTTACACCATCTTTGGATAGACCAATAATTTATACATCATCAGGTATTAAAATACCTATAATTAGTGATAATAACATTGATGACAGTAATAATAATGATGTCGATGGCGTTTCTGTGAATAATTTAACTAACAAATCAGAATATTTAATAATGAATANTTATGAAT]


>consensus_1709#0 CATAATCATTCTAGTCATCATCATCATCATTATCATCAACAGCAGCAGCAGAATAAATGT ATTGATGAAAATCTACGTAAAACAGTATCAGAGCCAAGTTTAAAAATGCGTAGCGGATCT GGTGGTGTACAAAAATCTCGTTATAAACCGGATCGTCGTCATTACAATCAACATCATCAT CATCATTTTGGAATGAATACAGCAACAGCAGCAGCAGCTGTAGCTGCAGCTGCAATAACT GTATCTAATGATCCATTAGCTATTGTTGGATTATGGCCACAATTGAGTTCAGCATTTCAA CATGCAAATTTAATACAAAAAACAATTAATAAAAAACCATTACCACAATTACCAGATATG AATAATAATAATAATAATAATAATGTGAATGGATCAACCATTCGAACAATCTATGGGAAA GCATTATTAAATAAACATGATTTAAGATTTACACCATCTTTGGATAGACCAATAATTTAT ACATCATCAGGTATTAAAATACCTATAATTAGTGATAATAACATTGATGACAGTAATAAT AATGATGTCGATGGCGTTTCTGTGAATAATTTAACTAACAAATCAGAATATTTAATAATG AATANTTATGAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)