cluster # 1775

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Schistosoma mansoni
cluster # 1775 cluster # 1775 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1775#0 length = 771 sequences # 2

consensusID : consensus_1775#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 771
fasta sequence

                              [ACTAACAACAAAACAAATCGAAAAATTAAACCGTATTTTGTATGGTTGCTGTCCGAAATTGGCAGTCCAGTTATGTACGTTTTAACTGCAGACGTCTCGGAGTTCAGGGAAACCTGACTCCAAATAATACCTAGTGAATGCGTGAAACGCACAGACAAGT--AAAAAAAGCCTGAATTAATTAAATAGTTGTTTCAGAAATTGTCTTAGGTGTTCGGATGTAAATACTGAGTTGTTTACGTTCACTAATCTAAAATATCATAGCTTATTTCATTAGTCTTCCTTCTGAACCATATACGATCTTTTTCGCATATATTGGCG-TACATTAATTCTACGTAGAGTTGATCAGTGATAACAATTAAAGTTGTATCTCTTTACAACGTACTATGTGATTGCATCACTAGCTTTTACTACGTTTGCCACACAAACCTGTTTTTTCGTCTAGTTACAGATTTCAGAAAATACCATCAATCAGCAATCTAGATACAGTGATTACACAACTGCATTGACTTATAGCCACACTTTCTTGTGAAGTTTTGTTTCTATGGGTTTTGAATGGCGTCTTGCGTTTTGTATTAAAAGTCTTTTGTCTTGTTTGTAGATCATGAGAATCTCATGTNCCTATTTCTCCTCGAAAAATCAATGGAAATAGTTAAAGAACTGTGCTCATCTGGGGTAATTGGTTGTGGACTGCAGAACCGACAACTTCATTGGTTTATTGCTGTAACAAATGCTAAATGCAATGCCGGTATATTTGATGGTGCAACCCATCTA]

[-] EMBL CD186768             [ACTAACAACAAAACAAATCGAAAAATTAAACCGTATTTTGTATGGTTGCTGTCCGAAATTGGCAGTCCAGTTATGTACGTTTTAACTGCAGACGTCTCGGAGTTCAGGGAAACCTGACTCCAAATAATACCTAGTGAATGCGTGAAACGCACAGACAAGT  AAAAAAAGCCTGAATTAATTAAATAGTTGTTTCAGAAATTGTCTTAGGTGTTCGGATGTAAATACTGAGTTGTTTACGTTCACTAATCTAAAATATCATAGCTTATTTCATTAGTCTTCCTTCTGAACCATATACGATCTTTTTCGCATATATTGGCG TACATTAATTCTACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD145154             [    atAACAAAACAAATCGAAAAATTAAACCGTATTTTGTATGGTTGCTGTCCGAAATTGGCAGTCCAGTTATGTACGTTTTAACTGCAGACGTCTCGGAGTTCAGGGAAACCTGACTCCAAATAATACCTAGTGAATGCGTGAAACGCACAGACAAGTAAAAAAAAAGCCTGAATTAATTAAATAGTTGTTTCAGAAATTGTCTTAGGTGTTCGGATGTAAATACTGAGTTGTTTACGTTCACTAATCTAAAATATCATAGCTTATTTCATTAGTCTTCCTTCTGAACCATATACGATCTTTTTAGCATATATTGGCGTTACATTAATTCTACGTAGAGTTGATCAGTGATAACAATTAAAGTTGTATCTCTTTACAACGTACTATGTGATTGCATCACTAGCTTTTACTACGTTTGCCACACAAACCTGTTTTTTCGTCTAGTTACAGATTTCAGAAAATACCATCAATCAGCAATCTAGATACAGTGATTACACAACTGCATTGACTTATAGCCACACTTTCTTGTGAAGTTTTGTTTCTATGGGTTTTGAATGGCGTCTTGCGTTTTGTATTAAAAGTCTTTTGTCTTGTTTGTAGATCATGAGAATCTCATGTNCCTATTTCTCCTCGAAAAATCAATGGAAATAGTTAAAGAACTGTGCTCATCTGGGGTAATTGGTTGTGGACTGCAGAACCGACAACTTCATTGGTTTATTGCTGTAACAAATGCTAAATGCAATGCCGGTATATTTGATGGTGCAACCCATCTA]




>consensus_1775#0
ACTAACAACAAAACAAATCGAAAAATTAAACCGTATTTTGTATGGTTGCTGTCCGAAATT
GGCAGTCCAGTTATGTACGTTTTAACTGCAGACGTCTCGGAGTTCAGGGAAACCTGACTC
CAAATAATACCTAGTGAATGCGTGAAACGCACAGACAAGTAAAAAAAGCCTGAATTAATT
AAATAGTTGTTTCAGAAATTGTCTTAGGTGTTCGGATGTAAATACTGAGTTGTTTACGTT
CACTAATCTAAAATATCATAGCTTATTTCATTAGTCTTCCTTCTGAACCATATACGATCT
TTTTCGCATATATTGGCGTACATTAATTCTACGTAGAGTTGATCAGTGATAACAATTAAA
GTTGTATCTCTTTACAACGTACTATGTGATTGCATCACTAGCTTTTACTACGTTTGCCAC
ACAAACCTGTTTTTTCGTCTAGTTACAGATTTCAGAAAATACCATCAATCAGCAATCTAG
ATACAGTGATTACACAACTGCATTGACTTATAGCCACACTTTCTTGTGAAGTTTTGTTTC
TATGGGTTTTGAATGGCGTCTTGCGTTTTGTATTAAAAGTCTTTTGTCTTGTTTGTAGAT
CATGAGAATCTCATGTNCCTATTTCTCCTCGAAAAATCAATGGAAATAGTTAAAGAACTG
TGCTCATCTGGGGTAATTGGTTGTGGACTGCAGAACCGACAACTTCATTGGTTTATTGCT
GTAACAAATGCTAAATGCAATGCCGGTATATTTGATGGTGCAACCCATCTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case