cluster # 1812

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Schistosoma mansoni
cluster # 1812 cluster # 1812 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1812#0 length = 698 sequences # 2

consensusID : consensus_1812#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 698
fasta sequence

                              [AACGAGAATACACTTTTAGTATATAGTAGTTTATAGGAGTGTATCTGTTTTTATTTCTTAATAATGAGTTTATTTAAACTTGCATGTTAATTGAGGTTTTTGGTTTATTTTGTGCGTATAGAGTTGATATAGAGTTGAAACAATAGATTTTTTTGGTTAAGCGAAAACACCCTAATGCTCTATCTTTATTTAATGGAATGAACTGTTTAAAACTTTAGTTGTTCATAGTTGAATGACGTTATTGATTTAGTTGAAAGGGTTTTTTGGAGATTGATTTGATTTTTTAGTGGGTAATTTTCACAGATTAATCTTAGCGTGGGTATAAATAAAAGGCAGAAGGCACTAGATAGGCATTTCGTTCTAGTACGAAATCCTCAGCAGAAATCAATCTGGGATGAACGCAACCAAAAATTTGATCTGTTTCATGAAACGCTTCAACTATAATATTTAGCTCACTAGCTATCTACTTCAAGAAGTTCTAGTAGGAAGTCATGGAGTTTAGATATGACTAAAATTAGAAATGTAAACCACTGGGTACCAATTCAGTTATCTATAGTCTAAATGTACGCTTTGAGCTCTGGAGGTTACGGATACGTACTGCTAAGTCTTATACTAGCATANAACATGTCCAGTGCTCCTTGGTTCTTTTAGCGGTATTCTAACTGAGATCAGTTTTTGACGAATAGAACCTATAGGAC]

[+] EMBL CD196695             [AACGAGAATACACTTTTAGTATATAGTAGTTTATAGGAGTGTATCTGTTTTTATTTCTTAATAATGAGTTTATTTAAACTTGCATGTTAATTGAGGTTTTTGGTTTATTTTGTGCGTATAGAGTTGATATAGAGTTGAAACAATAGATTTTTTTGGTTAAGCGAAAACACCCTAATGCTCTATCTTTATTTAATGGAATGAACTGTTTAAAACTTTAGTTGTTCATAGTTGAATGACGTTATTGATTTAGTTGAAAGGGTTTTTTGGAGATTGATTTGATTTTTTAGTGGGTAATTTTCACAGATTAATCTTAGCGTGGGTATAAATAAAAGGCAGAAGGCACTAGATAGGCATTTCGTTCTAGTACGAAATCCTCAGCAGAAATCAATCTGGGATGAACGCAACCAAAAATTTGATCTGTTTCATGAAACGCTTCAACTATAATATTTAGCTCACTAGC                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD079027             [                                                                                                                                    gGTTGAAACAATAGATTTTTTTGGTTAAGCGAAAACACCCTAATGCTCTATCTTTATTTAATGGAATGAACTGTTTAAAACTTTAGTTGTTCATAGTTGAATGACGTTATTGATTTAGTTGAAAGGGTTTTTTGGAGATTGATTTGATTTTTTAGTGGGTAATTTTCACAGATTAATCTTAGCGTGGGTATAAATAAAAGGCAGAAGGCACTAGATAGGCATTTCGTTCTAGTACGAAATCCTCAGCAGAAATCAATCTGGGATGAACACAACCAAAAATTTGATCTGTTTCATGAAACGCTTCAACTATAATATTTAGCTCACTAGCTATCTACTTCAAGAAGTTCTAGTAGGAAGTCATGGAGTTTAGATATGACTAAAATTAGAAATGTAAACCACTGGGTACCAATTCAGTTATCTATAGTCTAAATGTACGCTTTGAGCTCTGGAGGTTACGGATACGTACTGCTAAGTCTTATACTAGCATANAACATGTCCAGTGCTCCTTGGTTCTTTTAGCGGTATTCTAACTGAGATCAGTTTTTGACGAATAGAACCTATAGGAC]




>consensus_1812#0
AACGAGAATACACTTTTAGTATATAGTAGTTTATAGGAGTGTATCTGTTTTTATTTCTTA
ATAATGAGTTTATTTAAACTTGCATGTTAATTGAGGTTTTTGGTTTATTTTGTGCGTATA
GAGTTGATATAGAGTTGAAACAATAGATTTTTTTGGTTAAGCGAAAACACCCTAATGCTC
TATCTTTATTTAATGGAATGAACTGTTTAAAACTTTAGTTGTTCATAGTTGAATGACGTT
ATTGATTTAGTTGAAAGGGTTTTTTGGAGATTGATTTGATTTTTTAGTGGGTAATTTTCA
CAGATTAATCTTAGCGTGGGTATAAATAAAAGGCAGAAGGCACTAGATAGGCATTTCGTT
CTAGTACGAAATCCTCAGCAGAAATCAATCTGGGATGAACGCAACCAAAAATTTGATCTG
TTTCATGAAACGCTTCAACTATAATATTTAGCTCACTAGCTATCTACTTCAAGAAGTTCT
AGTAGGAAGTCATGGAGTTTAGATATGACTAAAATTAGAAATGTAAACCACTGGGTACCA
ATTCAGTTATCTATAGTCTAAATGTACGCTTTGAGCTCTGGAGGTTACGGATACGTACTG
CTAAGTCTTATACTAGCATANAACATGTCCAGTGCTCCTTGGTTCTTTTAGCGGTATTCT
AACTGAGATCAGTTTTTGACGAATAGAACCTATAGGAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case