cluster # 182

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Schistosoma mansoni
cluster # 182 cluster # 182 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_182#0 length = 1157 sequences # 2

consensusID : consensus_182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1157
fasta sequence

                              [TATTCATTTTATTTTGGAACTTAAGATTTTTCTGAACAATAAAATAATTGCGGAATGTTTCTTTATACATGTTTAGTATGCACATATATAATAAATATGTAATCATATAGGTGTTTATGTATCCTCTATGTTAGATAAAGATATCTATTTGTTTGTGATCAGTAAATAAATGTTTTCTTTTTTCTATCTATATATCTATCAAATACACACACACACACATGCATACATAAAATTCAATATTTCCTAATGTAGAAAAACACAAGATTTTTCATTCAATAGTATCTGTCTAGTTGCTGTCTGTGTAGTGATTGATTTGTCAACTGCTATAGATAATATAGCACTGATTAAAAGAAGAATTATTCCACAAATTGAAGCTAATGGCGCCCAACCTACGGAACAGTTCCCTTTTGAATAAGGTCCAACACTGCCACCACAAACTTCACGAATTGTAACTGAATCCCATCCTGCTGGCCACATGATGATAGATGTTAGTAGAATTAAATCAGCACTACCAAGTAATGATCCAGTACAGCTAAATACACTATGATCACAGATTTCACGTTTACATAGAGTTAATGATATAAAAATGAATGATATACATAATAAACAACATCCAATCATACTAATTAATCCAGAATACCATATTAATTTANTTTGC-ATAGCTGGTTTCGCTCCAAATCCCCATACTGATAATTGACATTTAAATAAAGTATCATCAAAAAGTTCCCAGTTCAATATATTATTATTGACAGAATCTGAAAGTTTACTACATATACTCTGACATCGAAACCATGGTCCAATAGATGGTGGTATTATTAATTGTATCAATTCATTGTCTGATCTATTGGAATTTAAAGTAAATAAATCTATATCAATATTATCATTATTATTACTGTTAACGGTATCAAAAAGATTATTTTGTGGACATGCTGTTAAACGACGTGTTTCTGATGTTTCAATACGAATTAACCAGTATGGACTAAAAAAACTTGAAATAGTGATTAGAATAGATAAAAAAGCGCATGTAATCCATATTAAGAGTATCCAACTTAATATTATTCGTGGCATAATGTTTGAATTAGCATCTAACTTCACATTTATCCTGATAATGATGATAATAGTGAAAATCCACCTCGTGCCGAATNCTGGCCTNCGAG]

[+] EMBL CD074357             [TATTCATTTTATTTTGGAACTTAAGATTTTTCTGAACAATAAAATAATTGCGGAATGTTTCTTTATACATGTTTAGTATGCACATATATAATAAATATGTAATCATATAGGTGTTTATGTATCCTCTATGTTAGATAAAGATATCTATTTGTTTGTGATCAGTAAATAAATGTTTTCTTTTTTCTATCTATATATCTATCAAATACACACACACACACATGCATACATAAAATTCAATATTTCCTAATGTAGAAAAACACAAGATTTTTCATTCAATAGTATCTGTCTAGTTGCTGTCTGTGTAGTGATTGATTTGTCAACTGCTATAGATAATATAGCACTGATTAAAAGAAGAATTATTCCACAAATTGAAGCTAATGGCGCCCAACCTACGGAACAGTTCCCTTTTGAATAAGGTCCAACACTGCCACCACAAACTTCACGAATTGTAACTGAATCCCATCCTGCTGGCCACATGATGATAGATGTTAGTAGAATTAAATCAGCACTACCAAGTAATGATCCAGTACAGCTAAATACACTATGATCACAGATTTCACGTTTACATAGAGTTAATGATATAAAAATGAATGATATACATAATAAACAACATCCAATCATACTAATTAATCCAGAATACCATATTAATTTANTTTGC ATAGCTGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD080445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CACTACCAAGTAATGATCCAGTACAGCTANATACACTATGATCACAGATTTCACGTTTACATAGAGTTAATGATATAANAATGAATGATATACATAATAAACAACATCCAATCATACTAATTAATCCAGATAACCATATTAATTTA TTTGCAATAGCTGGTTTCGCTCCAAATCCCCATACTGATAATTGACATTTAAATAAAGTATCATCAAAAAGTTCCCAGTTCAATATATTATTATTGACAGAATCTGAAAGTTTACTACATATACTCTGACATCGAAACCATGGTCCAATAGATGGTGGTATTATTAATTGTATCAATTCATTGTCTGATCTATTGGAATTTAAAGTAAATAAATCTATATCAATATTATCATTATTATTACTGTTAACGGTATCAAAAAGATTATTTTGTGGACATGCTGTTAAACGACGTGTTTCTGATGTTTCAATACGAATTAACCAGTATGGACTAAAAAAACTTGAAATAGTGATTAGAATAGATAAAAAAGCGCATGTAATCCATATTAAGAGTATCCAACTTAATATTATTCGTGGCATAATGTTTGAATTAGCATCTAACTTCACATTTATCCTGATAATGATGATAATAGTGAAAATCCACCTCGTGCCGAATNCTGGCCTNCGAG]




>consensus_182#0
TATTCATTTTATTTTGGAACTTAAGATTTTTCTGAACAATAAAATAATTGCGGAATGTTT
CTTTATACATGTTTAGTATGCACATATATAATAAATATGTAATCATATAGGTGTTTATGT
ATCCTCTATGTTAGATAAAGATATCTATTTGTTTGTGATCAGTAAATAAATGTTTTCTTT
TTTCTATCTATATATCTATCAAATACACACACACACACATGCATACATAAAATTCAATAT
TTCCTAATGTAGAAAAACACAAGATTTTTCATTCAATAGTATCTGTCTAGTTGCTGTCTG
TGTAGTGATTGATTTGTCAACTGCTATAGATAATATAGCACTGATTAAAAGAAGAATTAT
TCCACAAATTGAAGCTAATGGCGCCCAACCTACGGAACAGTTCCCTTTTGAATAAGGTCC
AACACTGCCACCACAAACTTCACGAATTGTAACTGAATCCCATCCTGCTGGCCACATGAT
GATAGATGTTAGTAGAATTAAATCAGCACTACCAAGTAATGATCCAGTACAGCTAAATAC
ACTATGATCACAGATTTCACGTTTACATAGAGTTAATGATATAAAAATGAATGATATACA
TAATAAACAACATCCAATCATACTAATTAATCCAGAATACCATATTAATTTANTTTGCAT
AGCTGGTTTCGCTCCAAATCCCCATACTGATAATTGACATTTAAATAAAGTATCATCAAA
AAGTTCCCAGTTCAATATATTATTATTGACAGAATCTGAAAGTTTACTACATATACTCTG
ACATCGAAACCATGGTCCAATAGATGGTGGTATTATTAATTGTATCAATTCATTGTCTGA
TCTATTGGAATTTAAAGTAAATAAATCTATATCAATATTATCATTATTATTACTGTTAAC
GGTATCAAAAAGATTATTTTGTGGACATGCTGTTAAACGACGTGTTTCTGATGTTTCAAT
ACGAATTAACCAGTATGGACTAAAAAAACTTGAAATAGTGATTAGAATAGATAAAAAAGC
GCATGTAATCCATATTAAGAGTATCCAACTTAATATTATTCGTGGCATAATGTTTGAATT
AGCATCTAACTTCACATTTATCCTGATAATGATGATAATAGTGAAAATCCACCTCGTGCC
GAATNCTGGCCTNCGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case