cluster # 1901

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Schistosoma mansoni
cluster # 1901 cluster # 1901 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1901#0 length = 701 sequences # 2

consensusID : consensus_1901#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 701
fasta sequence

                              [TTTATACATAAACTTTATATTTTAAAGAGGCAAAGATAACGATGTAATTCACGTTCATTAGGATGATGAGTGATACATGTTTACAATTATTTATGTCAGAAGTGACTACATCTATACTAGTGATCTGATTTCGAGTTCTCATAACTGAACTCCGAACATTACTGAAATTATTCACTCGATGTTATCTAGCTATTGTAGTGT---TGTTTTCCTCACCTTATTGTGAACTACAACTGTACTGAGCAAGTCTTTTACTTCTTTCATAATTATGGATAAGCTCACAATAACTGGACTCCATTTGATTACTGTATTTCAATCGTTGGATATGATGGTTTTGCAGGAATTATAATAACTACTTTTTTAGAGTCATTTGTTGTGTTTACGTCTGTCAAGTGCAGCTAACAGGTGGGACATATAATTTCCATAGAAATTTATCTTGAAAGATCAACATTTAAATACAAGTATGTTAGCCAGTGACNCTCGATGTTCTATGTAGTTGATGGGATGATGTTGGGGACGATTTGGCTGTATCTGTTTACAAATTTATGTCTGTACAGCAATACTAATAATTGTGAGGTACAATTTATTTTCACCCATAAGCCATTCCATAATTACTCCAAGCTTGGTGTTTATAAGGATAATAGCTGGAACAGAATCATAACTTATGAAGTTTATACCGTGGCTTTATTTCGTGGCAAGATTAT]

[+] EMBL CD079996             [TTTATACATAAACTTTATATTTTAAAGAGGCAAAGATAACGATGTAATTCACGTTCATTAGGATGATGAGTGATACATGTTTACAATTATTTATGTCAGAAGTGACTACATCTATACTAGTGATCTGATTTCGAGTTCTCATAACTGAACTCCGAACATTACTGAAATTATTCACTCGATGTTATCTAGCTATTGTAGTGT   TGTTTTCCTCACCTTATTGTGAACTACAACTGTACTGAGCAAGTCTTTTACTTCTTTCATAATTATGGATAAGCTCACAATAACTGGACTCCATTTGATTACTGTATTTCAATCGTTGGATATGATGGTTTTGCAGGAATTATAATAACTACTTTTTTAGAGTCATTTGTTGTGTTTACGTCTGTCAAGTGCAGCTAACAGGTGGGACATATAATTTCCATAGAAATTTATCTTGAAAGATCAACATTTAAATACAAGTATGTTAGCCAGTGACNCTCGATGTTCTATGTAGTTGATGGGATGATGTTGGGGACGATTTGGCTGTATCTGTTTACAAATTTATGTCTGTACAGCAATACTAATAATTGTGAGGTACAATTTATTTTCACCCATAAGCCATTCCATAATTACTCCAAGCTTGGTGTTTATAAGGATAATAGCTGGAACAGAATCATAACTTATGAAGTTTATACCGTGGCTTTATTTCGTGGCAAGATTAT]
[+] EMBL CD083804             [TTTATACATAAACTTTATATTTTAAAGAGGCAAAGATAACGATGTAATTCACGTTCATTAGGATGATGAGTGATACATGTTTACAATTATTTATGTCAGAAGTGACTACATCTATACTAGTGATCTGATTTCGAGTTCTCATAACTGAACTCCGAACATTACTGAAATTATTCACTCGATGTTATCTAGCTATTGTAGTGTCCCTGTTTTCCTCACCTTATTGTGAACTACAACTGTACTGAGCAAGTCTTTTACTTCTTTCATAATTATGGATAAGCTCACAATAACTGGACTCCATTTGATTACTGTATTTCAATCGTTGGATATGATGGTTTTGCAGGAATTATAATAACTACTTTTTTAGAGTCATTTGTTGTGTTTACGTCTGTCAAGTGCAGCTAACAGGTGGGACATATAATTTCCATAGAAATTTATCTTGAAAGATCAACATTTAAATACAAGTATGTTAGCCAGTGAC CTCGATGT                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_1901#0
TTTATACATAAACTTTATATTTTAAAGAGGCAAAGATAACGATGTAATTCACGTTCATTA
GGATGATGAGTGATACATGTTTACAATTATTTATGTCAGAAGTGACTACATCTATACTAG
TGATCTGATTTCGAGTTCTCATAACTGAACTCCGAACATTACTGAAATTATTCACTCGAT
GTTATCTAGCTATTGTAGTGTTGTTTTCCTCACCTTATTGTGAACTACAACTGTACTGAG
CAAGTCTTTTACTTCTTTCATAATTATGGATAAGCTCACAATAACTGGACTCCATTTGAT
TACTGTATTTCAATCGTTGGATATGATGGTTTTGCAGGAATTATAATAACTACTTTTTTA
GAGTCATTTGTTGTGTTTACGTCTGTCAAGTGCAGCTAACAGGTGGGACATATAATTTCC
ATAGAAATTTATCTTGAAAGATCAACATTTAAATACAAGTATGTTAGCCAGTGACNCTCG
ATGTTCTATGTAGTTGATGGGATGATGTTGGGGACGATTTGGCTGTATCTGTTTACAAAT
TTATGTCTGTACAGCAATACTAATAATTGTGAGGTACAATTTATTTTCACCCATAAGCCA
TTCCATAATTACTCCAAGCTTGGTGTTTATAAGGATAATAGCTGGAACAGAATCATAACT
TATGAAGTTTATACCGTGGCTTTATTTCGTGGCAAGATTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case