cluster # 1911

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Schistosoma mansoni
cluster # 1911 cluster # 1911 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1911#0 length = 897 sequences # 2

consensusID : consensus_1911#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 897
fasta sequence

                              [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATTCTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACATTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGTGCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCTTTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCAACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCATGAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTATTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTT-ATGATCAAAGTGATTCANNACCGAC-AACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGC-AATACATTTTATTG-ATTGATATATCCATAATATTAACAACTTTATATTTTAAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT]

[+] EMBL CD080050             [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATTCTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACATTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGTGCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCTTTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCAACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCATGAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTATTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTT ATGATCAAAGTGATTCANNACCGAC AACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGC AATACATTTTATTG ATTGATATATCC                                                                                    ]
[-] EMBL AI976119             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTG TACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTT ATTTATTGATTTTGTTTTTTCTTCTATACTGTTGATGATCAAAGTGATTCA AACCGACAAACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTTTCTTTTTCTTTGTTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGCGATTACATTTTATTGTATTGATATATACATAATATTAACAACTTTATATTTTAAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT]




>consensus_1911#0
CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATT
CTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACA
TTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGT
GCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCT
TTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCA
ACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCAT
GAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTT
GTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATA
TGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAA
AATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATG
CAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTA
TTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTTATGATCAAAGTGATTCANNACCGACAACTGTT
CTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTC
TATGAGCAATACATTTTATTGATTGATATATCCATAATATTAACAACTTTATATTTTAAA
AGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case