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Schistosoma mansoni
cluster # 1918 cluster # 1918       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1918#0 length = 444 sequences # 2  

consensusID : consensus_1918#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 444
fasta sequence
                              [GCATTTGTTTTCTTTGTTGATTGTATTAATGAATTAACTTCATTGTAAGTCTTTTCTTCTTACTAGACTCTTTTGTATATTTTGCTTACTCTCTATTTAAACTTATGTATGCTAACGTGGATATATCAATATCTTTGATGATAATTCTAGATACAGCTTCATGTACCTGTAATTGGACAGTCGTATATTTCATTTTTCCATTTGAAATTTGTCAATTTTGACATGAAGTCTAATTTTTTTTGTACACATCTATTTACTACACATAAG-AAAAAATTACTAAATAATGAACTTGACTTAAGACTAAACGGTTCATTCATTTGGTGGTGGTTTTGGCCCTCCTTCCCCCAATTTAATTTCACATTTTATTAGTTGTATTTTGCCC-GTACGGGTACAT-ATCT-ATGGCAATTACCTTGAATCAAATGTTGACAATGCGAATTTATTAAT]

[+] EMBL SMAA28826            [GCATTTGTTTTCTTTGTTGATTGTATTAATGAATTAACTTCATTGTAAGTCTTTTCTTCTTACTAGACTCTTTTGTATATTTTGCTTACTCTCTATTTAAACTTATGTATGCTAACGTGGATATATCAATATCTTTGATGATAATTCTAGATACAGCTTCATGTACCTGTAATTGGACAGTCGTATATTTCATTTTTCCATTTGAAATTTGTCAATTTTGACATGAAGTCTAATTTTTTTTGTACACATCTATTTACTACACATAAG AAAAAATTACTAAATAATGAACTTGACTTAAGACTAAACGGTTCATTCATTTGGTGGTGGTTTTGGCCCTCCTTCCCCCAATTTAATTTCACATTTTATTAGTTGTATTTTGCCC GTACGGGTACAT ATCT ATGGCAATTACCTTGAATCAAATGTTGACAATGCGAATTTATTAAT]
[+] EMBL SMAA28825            [GCATTTGTTTTCTTTGTTGATTGTATTAATGAATTAACTTCATTGTAAGTCTTTTCTTCTTACTAGACTCTTTTGTATATTTTGCTTACTCTCTATTTAAACTTATGTATGCTAACGTGGATATATCAATATCTTTGATGATAATTCTAGATACAGCTTCATGTACCTGTAATTGGACAGTCGTATATTTCATTTTTCCATTTGAAATTTGTCAATTTTGACATGAAGTCTAATTTTTTTTGTACACATCTATTTACTACACATAAGAAAAAAATAACTAAATAATGAACTTGACTTAAGACTAAACGGTTCATTCATTTGGTGGT GTTTTGGCCCT CTTCCCCC ATTTAATTTCACATTTTA TAGTTGGATTTTGCCCTGTACGTGTA ATAACCTAATGGCAATTACCTTGGATC AATG TGACAATGCG ATTTA TAAT]


>consensus_1918#0 GCATTTGTTTTCTTTGTTGATTGTATTAATGAATTAACTTCATTGTAAGTCTTTTCTTCT TACTAGACTCTTTTGTATATTTTGCTTACTCTCTATTTAAACTTATGTATGCTAACGTGG ATATATCAATATCTTTGATGATAATTCTAGATACAGCTTCATGTACCTGTAATTGGACAG TCGTATATTTCATTTTTCCATTTGAAATTTGTCAATTTTGACATGAAGTCTAATTTTTTT TGTACACATCTATTTACTACACATAAGAAAAAATTACTAAATAATGAACTTGACTTAAGA CTAAACGGTTCATTCATTTGGTGGTGGTTTTGGCCCTCCTTCCCCCAATTTAATTTCACA TTTTATTAGTTGTATTTTGCCCGTACGGGTACATATCTATGGCAATTACCTTGAATCAAA TGTTGACAATGCGAATTTATTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)