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Schistosoma mansoni
cluster # 192 cluster # 192       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_192#0 length = 873 sequences # 2  

consensusID : consensus_192#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 873
fasta sequence
                              [GGAAGCCTACACTTTTTCCTTTGATTTCATCATAGTTAACTCCACTGTAATACTAGTTGAACAAATTCAAAAGTTCGTAATTCGGAGTACCTTGGCTATGTAAGTGACCTAAACAACAAACAATTTACTTTCTTGTCCACCGAACTTGCATACATATTTACTTTGCCTTTAAAATTAAAACTTCCTTAAGCACTTTTCATCTTTTTTTATTCTCTAAGCTGCTAGTCGTGCATGTATCAGTTAATGTACATTGTTTTACTAAATTGAACTGATATCTTAAGCGCTATTTACTTGTGATCCTATTTGTCTCACAATTACATACATATACAAACACACACACACCTCGACGACGACGGCGCATTCTTCATTAAACATGAAGCATTTCATATGAAAAGTCCTGTGTTTGAGTGTACATGTATACGAACTGTATCACTCTATAGTGTTTGATAGCAAATACATACTGTATATTCTTTCTTTCCCAAGGGGTACCGGTTGTTTGTTTAGTTTATTTTTTTTTACTAGTCTTTCATTTCACTTACTAATTACACAATAGAATGTGTTGTGTAGAAGAGAACGAAATCTATGTGTGTGTAGACGTGCAGGTAGATGGATTCCACTTTGTTAAAGAAGGTTGTCAATGATTTGCACAGAATTTTTTCCCTCTCTATTTGTTTATATTGTAAATGTAATTTGTACACCTTATTTACTAATATTATATCGTTCTATTTTCCTTTCTGTACATGATTGTAAATGATAAATTACAACTTACTATTTATATAATAACTAATCATTATTATTATTACCTTTTCTGGTTAACTTTGTACAAATACTTCTCTTGTTTAACTGAATTATAAAAAGAAACAATTTGAATTG]

[+] EMBL CD080468             [GGAAGCCTACACTTTTTCCTTTGATTTCATCATAGTTAACTCCACTGTAATACTAGTTGAACAAATTCAAAAGTTCGTAATTCGGAGTACCTTGGCTATGTAAGTGACCTAAACAACAAACAATTTACTTTCTTGTCCACCGAACTTGCATACATATTTACTTTGCCTTTAAAATTAAAACTTCCTTAAGCACTTTTCATCTTTTTTTATTCTCTAAGCTGCTAGTCGTGCATGTATCAGTTAATGTACATTGTTTTACTAAATTGAACTGATATCTTAAGCGCTATTTACTTGTGATCCTATTTGTCTCACAATTACATACATATACAAACACACACACACCTCGACGACGACGGCGCATTCTTCATTAAACATGAAGCATTTCATATGAAAAGTCCTGTGTTTGAGTGTACATGTATACGAACTGTATCACTCTATAGTGTTTGATAGCAAATACATACTGTATATTCTTTCTTTCCCAAGGGGTACCGGTTGTTTGTTTAGTTTATTTTTTTTTACTAGTCTTTCATTTCACTTACTAATTACACAATAGAATGTGTTGTGTAGAAGAGAACGAAATCTATGTGTGTGTAGACGTGCAGGTAGATGGATTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCTATTTACTTGTGATCCTATNTGTCTCACAATTACATACATATACAAACACACACACACCTCGACGACGACGGCGCATTCTTCATTAAACATGAAGCATTTCATATGAAAAGTCCTGTGTTTGAGTGTACATGTATACGAACTGTATCACTCTATAGTGTTTGATAGCAAATACATACTGTATATTCTTTCTTTCCCAAGGGGTACCGGTTGTTTGTTTAGTTTATTTTTTTTTACTAGTCTTTCATTTCACTTACTAATTACACAATAGAATGTGTTGTGTAGAAGAGAACGAAATCTATGTGTGTGTAGACGTGCAGGTAGATGGATTCCACTTTGTTAAAGAAGGTTGTCAATGATTTGCACAGAATTTTTTCCCTCTCTATTTGTTTATATTGTAAATGTAATTTGTACACCTTATTTACTAATATTATATCGTTCTATTTTCCTTTCTGTACATGATTGTAAATGATAAATTACAACTTACTATTTATATAATAACTAATCATTATTATTATTACCTTTTCTGGTTAACTTTGTACAAATACTTCTCTTGTTTAACTGAATTATAAAAAGAAACAATTTGAATTG]


>consensus_192#0 GGAAGCCTACACTTTTTCCTTTGATTTCATCATAGTTAACTCCACTGTAATACTAGTTGA ACAAATTCAAAAGTTCGTAATTCGGAGTACCTTGGCTATGTAAGTGACCTAAACAACAAA CAATTTACTTTCTTGTCCACCGAACTTGCATACATATTTACTTTGCCTTTAAAATTAAAA CTTCCTTAAGCACTTTTCATCTTTTTTTATTCTCTAAGCTGCTAGTCGTGCATGTATCAG TTAATGTACATTGTTTTACTAAATTGAACTGATATCTTAAGCGCTATTTACTTGTGATCC TATTTGTCTCACAATTACATACATATACAAACACACACACACCTCGACGACGACGGCGCA TTCTTCATTAAACATGAAGCATTTCATATGAAAAGTCCTGTGTTTGAGTGTACATGTATA CGAACTGTATCACTCTATAGTGTTTGATAGCAAATACATACTGTATATTCTTTCTTTCCC AAGGGGTACCGGTTGTTTGTTTAGTTTATTTTTTTTTACTAGTCTTTCATTTCACTTACT AATTACACAATAGAATGTGTTGTGTAGAAGAGAACGAAATCTATGTGTGTGTAGACGTGC AGGTAGATGGATTCCACTTTGTTAAAGAAGGTTGTCAATGATTTGCACAGAATTTTTTCC CTCTCTATTTGTTTATATTGTAAATGTAATTTGTACACCTTATTTACTAATATTATATCG TTCTATTTTCCTTTCTGTACATGATTGTAAATGATAAATTACAACTTACTATTTATATAA TAACTAATCATTATTATTATTACCTTTTCTGGTTAACTTTGTACAAATACTTCTCTTGTT TAACTGAATTATAAAAAGAAACAATTTGAATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)