Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1973 cluster # 1973       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1973#0 length = 654 sequences # 2  

consensusID : consensus_1973#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 654
fasta sequence
                              [GGATTACAGGAAAATCTACTTTATCACGTCGTGTTCTGGGACCACGTTTAAATTATGCATATTATTTGGATAAACAGTTTATACCTCCAATTGAAAGAATGACACAAGTTATTGGTTGGCGTGTTCGAACTTGGTTATCAGAACTTCCTCGTTACTTAACTTCCAGACACCATCGATATATTTTGACTTCAGAACCATCTCACATTTATCCTTCAAGACCTCAGCATCAATTCACAAATCTAGGTTCTCCATCTTCATCGTTTATTTTATCTCCTAATTCATCCCAACTTAATTTAATTTCACAAAATCAACGTAAACCTCCCTATCGTCCTTCATCATTTATGCGTGCTTTTGTTGGTCAACCACCACAAATTTGTCCTAGTTGTGAATCATTAATACCAAATACTAGTTTTACTGATCAATTAGGTCATTGTAGAACTTGTACTGATGGTAATTCACGATTAATGAATATTGGAACTATCAAACTTGGTTGTAATATTAATCATGTACAGTCCTCATTGAATCGTTTAGAAACAATCTGTTCATATTGTATCATACATCGTGGTATGTCCTGTGATCCTGTATGGTTATGTAATAATTNTTTCTGTCCAATCATAGTCAACGTTTAATTGCTTCAGCTGATTTAGCTCTATT]

[+] EMBL CD080581             [GGATTACAGGAAAATCTACTTTATCACGTCGTGTTCTGGGACCACGTTTAAATTATGCATATTATTTGGATAAACAGTTTATACCTCCAATTGAAAGAATGACACAAGTTATTGGTTGGCGTGTTCGAACTTGGTTATCAGAACTTCCTCGTTACTTAACTTCCAGACACCATCGATATATTTTGACTTCAGAACCATCTCACATTTATCCTTCAAGACCTCAGCATCAATTCACAAATCTAGGTTCTCCATCTTCATCGTTTATTTTATCTCCTAATTCATCCCAACTTAATTTAATTTCACAAAATCAACGTAAACCTCCCTATCGTCCTTCATCATTTATGCGTGCTTTTGTTGGTCAACCACCACAAATTTGTCCTAGTTGTGAATCATTAATACCAAATACTAGTTTTACTGATCAATTAGGTCATTGTAGAACTTGTACTGATGGTAATTCACGATTAATGAATATTGGAACTATCAAACTTGGTTGTAATATTAATCATGTACAGTCCTCATTGAATCGTTTAGAAACAATCTGTTCATATTGTATCATACATCGTGGTATGTCCTGTGATCCTGTATGGTTATGTAATAATTNTTTCTGTCCAATCATAGTCAACGTTTAATTGCTTCAGCTGATTTAGCTCTATT]
[-] EMBL CD139801             [                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTA TTTATCTCCTAATTCATCCCCACTTAATTTAATTTCACAAAATCAACGTAAACCTCCCTATCGTCCTTCATCATTTATGCGTGCTTTTGTTGGTCAACCACCACAAATTTGTCCTAGTTGTGAATCATTAATACCAAATACTAGTTTTTCTGATCAATTAGGTCATTGTAGAACTTGTACTGATGGTAATTCACGAT                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_1973#0 GGATTACAGGAAAATCTACTTTATCACGTCGTGTTCTGGGACCACGTTTAAATTATGCAT ATTATTTGGATAAACAGTTTATACCTCCAATTGAAAGAATGACACAAGTTATTGGTTGGC GTGTTCGAACTTGGTTATCAGAACTTCCTCGTTACTTAACTTCCAGACACCATCGATATA TTTTGACTTCAGAACCATCTCACATTTATCCTTCAAGACCTCAGCATCAATTCACAAATC TAGGTTCTCCATCTTCATCGTTTATTTTATCTCCTAATTCATCCCAACTTAATTTAATTT CACAAAATCAACGTAAACCTCCCTATCGTCCTTCATCATTTATGCGTGCTTTTGTTGGTC AACCACCACAAATTTGTCCTAGTTGTGAATCATTAATACCAAATACTAGTTTTACTGATC AATTAGGTCATTGTAGAACTTGTACTGATGGTAATTCACGATTAATGAATATTGGAACTA TCAAACTTGGTTGTAATATTAATCATGTACAGTCCTCATTGAATCGTTTAGAAACAATCT GTTCATATTGTATCATACATCGTGGTATGTCCTGTGATCCTGTATGGTTATGTAATAATT NTTTCTGTCCAATCATAGTCAACGTTTAATTGCTTCAGCTGATTTAGCTCTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)