Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1993 cluster # 1993       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1993#0 length = 432 sequences # 2  
consensusID : consensus_1993#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 432
fasta sequence 
                              [ATATCACTCAATGAATTAAATGAGCACATCACTAACAGTCAGTCAATACAAGAAAAAGATAATAACCAACACTTTGATAATAAAGAAGATCTAGTCAATCCAGTTATTGTATCAGGATGTTTATTTGTTGAAAGTTTATTTAAATTTACTTATGCTCATCCTATTAAAGTGATTAATAGTTTGTTAAGTCAATCGCCTAAACGTTTAATTGCATGGGCACAACATTATCAATTATCAAGAGTTTTAGAAGCTTTCATTTTATCAGAGTCTGTAATTAATGAGCTTAAAATTGGATTATTTAAGTCTTTAATGAATGGCTTCTCTGTTTTGGCATGTCATCCTAGTGGTAGTCATGTCATTGAAGCATTATGGACAACTACAAATACCTTACCTCAACCAATAATTTATAAAGAATTAATGGCAAAACAATTA]

[+] EMBL CD190932             [ATATCACTCAATGAATTAAATGAGCACATCACTAACAGTCAGTCAATACAAGAAAAAGATAATAACCAACACTTTGATAATAAAGAAGATCTAGTCAATCCAGTTATTGTATCAGGATGTTTATTTGTTGAAAGTTTATTTAAATTTACTTATGCTCATCCTATTAAAGTGATTAATAGTTTGTTAAGTCAATCGCCTAAACGTTTAATTGCATGGGCACAACATTATCAATTATCAAGAGTTTTAGAAGCTTTCATTTTATCAGAGTCTGTAATTAATGAGCTTAAAATTGGATTATTTAAGTCTTTAATGAATGGCTTCTCTGTTTTGGCATGTCATCCTAGTGGTAGT                                                                                 ]
[+] EMBL CD165166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATTGGATTATTTAAGTCTTTAATGAATGGCTTCTCTGTTTTGGCATGTCATCCTAGTGGTAGTCATGTCATTGAAGCATTATGGACAACTACAAATACCTTACCTCAACCAATAATTTATAAAGAATTAATGGCAAAACAATTA]




>consensus_1993#0
ATATCACTCAATGAATTAAATGAGCACATCACTAACAGTCAGTCAATACAAGAAAAAGAT
AATAACCAACACTTTGATAATAAAGAAGATCTAGTCAATCCAGTTATTGTATCAGGATGT
TTATTTGTTGAAAGTTTATTTAAATTTACTTATGCTCATCCTATTAAAGTGATTAATAGT
TTGTTAAGTCAATCGCCTAAACGTTTAATTGCATGGGCACAACATTATCAATTATCAAGA
GTTTTAGAAGCTTTCATTTTATCAGAGTCTGTAATTAATGAGCTTAAAATTGGATTATTT
AAGTCTTTAATGAATGGCTTCTCTGTTTTGGCATGTCATCCTAGTGGTAGTCATGTCATT
GAAGCATTATGGACAACTACAAATACCTTACCTCAACCAATAATTTATAAAGAATTAATG
GCAAAACAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)