Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2003 cluster # 2003       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2003#0 length = 271 sequences # 2  

consensusID : consensus_2003#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 271
fasta sequence
                              [ACCGTCTATCCTAGTGGTACGTTATTGTATAATTGGAAGCGTTAACTACCGACAAAGTAGCTAAATTTCAAATATTGGGTCTTTTGTATGCTTGCAAGTGCATATGTTTATGAGCACTTACACTATTATAATATGCTTTATTAGTGTTCTGATTGATTTTATTTAGTAATTAATACTTTCAATCTAAACTATTCTTTA-AAAGCTGCTTAGCTAACTAATTATAACTTCTGTCTTAAAGCTTGAATTGTTATCCAGCTAATGTAAAATAAAA]

[+] EMBL CD119373             [ACCGTCTATCCTAGTGGTACGTTATTGTATAATTGGAAGCGTTAACTACCGACAAAGTAGCTAAATTTCAAATATTGGGTCTTTTGTATGCTTGCAAGTGCATATGTTTATGAGCACTTACACTATTATAATATGCTTTATTAGTGTTCTGATTGATTTTATTTAGTAATTAATACTTTCAATCTAAACTATTCTTTA AAAGCTGCTTAGCTAACTAATTATAACTTCTGTCTTAAAGCTTGAATTGTTATCCAGCTAATGTAAAATAAAA]
[+] EMBL CD119362             [                 TACGTTATTGTATAATTGGAAGCGTTAACTACCGACAAAGTAGCTAAATTTCAAATATTGGGACTTTTGTATGCTTGTAAGTGCATATGTTTATGAGTACTTACACTATTATTTTATGCTTTATCAGTGTCCTGATTGATTTCATTTAGTAATTAATACTTTCAATCTAAACTATTCTTTACAAAGCTGTTTAGCTAACTAATTATAACTTCTGTCTTAAAGCTTGAATTGTTATCCAGCTAATGTAAAATAAA ]


>consensus_2003#0 ACCGTCTATCCTAGTGGTACGTTATTGTATAATTGGAAGCGTTAACTACCGACAAAGTAG CTAAATTTCAAATATTGGGTCTTTTGTATGCTTGCAAGTGCATATGTTTATGAGCACTTA CACTATTATAATATGCTTTATTAGTGTTCTGATTGATTTTATTTAGTAATTAATACTTTC AATCTAAACTATTCTTTAAAAGCTGCTTAGCTAACTAATTATAACTTCTGTCTTAAAGCT TGAATTGTTATCCAGCTAATGTAAAATAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)