cluster # 2025

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Schistosoma mansoni
cluster # 2025 cluster # 2025 Sequences # 2 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_2025#0 length = 690 sequences # 1

consensus_2025#1 length = 303 sequences # 1

consensusID : consensus_2025#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 690
fasta sequence

                              [GAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGGACCACAGAAATTCACTGTTGAATGTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACTTGCCTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGAAAATGCTGAAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTATTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCCACATCATAACACAATGCACATACATATTAAACCATGTAGCATTTCTACTTGGATGATGTTATAAATCATAGACTTTCGAATACACCTACATTACACATATTTAGATATTTCGGCGGAGGGGGGGGGAAATACCGCTCGGACATCGACATATACGTATATGTTTATTTATGTATGTATGTGTGTGAGTGTGTATGTCCCCCAAGTCAAAATGTTCAAATCTTTTGAATATCATTGTTTCTATAAAACATTATGTAATATAAGTAATTTCACATTTTATTTCAATGATATTTAGTAGTAATAATTAACTAATGGTTCTTTATTGTATTTATGTATGTGTGTACACTTACTTACGTCTTTTACCCTTCGTAGAAGAGTTAAGACCGCCCAACAGCGTTCTCCA]

[+] EMBL CD081407             [GAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGGACCACAGAAATTCACTGTTGAATGTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACTTGCCTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGAAAATGCTGAAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTATTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCCACATCATAACACAATGCACATACATATTAAACCATGTAGCATTTCTACTTGGATGATGTTATAAATCATAGACTTTCGAATACACCTACATTACACATATTTAGATATTTCGGCGGAGGGGGGGGGAAATACCGCTCGGACATCGACATATACGTATATGTTTATTTATGTATGTATGTGTGTGAGTGTGTATGTCCCCCAAGTCAAAATGTTCAAATCTTTTGAATATCATTGTTTCTATAAAACATTATGTAATATAAGTAATTTCACATTTTATTTCAATGATATTTAGTAGTAATAATTAACTAATGGTTCTTTATTGTATTTATGTATGTGTGTACACTTACTTACGTCTTTTACCCTTCGTAGAAGAGTTAAGACCGCCCAACAGCGTTCTCCA]




>consensus_2025#0
GAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGGACCACAGAAATTCACTGTTGAATGTTGGGGTTC
TGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACTTGCCTGCCTATCC
AACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGAAAATGCTGAAGGATTTGA
AGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTATTTTAACAAA
CTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCCACATCATAAC
ACAATGCACATACATATTAAACCATGTAGCATTTCTACTTGGATGATGTTATAAATCATA
GACTTTCGAATACACCTACATTACACATATTTAGATATTTCGGCGGAGGGGGGGGGAAAT
ACCGCTCGGACATCGACATATACGTATATGTTTATTTATGTATGTATGTGTGTGAGTGTG
TATGTCCCCCAAGTCAAAATGTTCAAATCTTTTGAATATCATTGTTTCTATAAAACATTA
TGTAATATAAGTAATTTCACATTTTATTTCAATGATATTTAGTAGTAATAATTAACTAAT
GGTTCTTTATTGTATTTATGTATGTGTGTACACTTACTTACGTCTTTTACCCTTCGTAGA
AGAGTTAAGACCGCCCAACAGCGTTCTCCA

consensusID : consensus_2025#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 303
fasta sequence

                              [CTATGAATGGTTTTTCAGAATTATGGGGTTCAAGTGGACCACAGAAATTCACTGTTGAATGTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACCTGCCTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGATAATGCTGAAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTATTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCCACA]

[+] EMBL CD114702             [CTATGAATGGTTTTTCAGAATTATGGGGTTCAAGTGGACCACAGAAATTCACTGTTGAATGTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACCTGCCTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGATAATGCTGAAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTATTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCCACA]




>consensus_2025#1
CTATGAATGGTTTTTCAGAATTATGGGGTTCAAGTGGACCACAGAAATTCACTGTTGAAT
GTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACCTGC
CTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGATAATGCTG
AAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTA
TTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCC
ACA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_2025#0      ---------GAGGCCAANAATT-CGGCACGAGGGCGGACCACAGAAATTCACTGTTGAAT 50
consensus_2025#1      CTATGAATGGTTTTTCAGAATTATGGGGTTCAAGTGGACCACAGAAATTCACTGTTGAAT 60
                               *      * ****  **       * *************************

consensus_2025#0      GTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACTTGC 110
consensus_2025#1      GTTGGGGTTCTGTGGATCAGTTGCCTCGTGCTCATACTTGTTTTAATCGTTTAGACCTGC 120
                      ******************************************************** ***

consensus_2025#0      CTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGAAAATGCTG 170
consensus_2025#1      CTGCCTATCCAACATTTGAAGAATTACGTTGTAAATTAATTATTGCTATTGATAATGCTG 180
                      **************************************************** *******

consensus_2025#0      AAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTA 230
consensus_2025#1      AAGGATTTGAAGGTGTCGATTGAATAAAAGTTCTTAACCTTCCATAAATATCGACTATTA 240
                      ************************************************************

consensus_2025#0      TTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCC 290
consensus_2025#1      TTTTAACAAACTTCATTTATTTACTGTTGTTCTTTTTTGATTGTTGTTGTTGTAAATTCC 300
                      ************************************************************

consensus_2025#0      ACATCATAACACAATGCACATACATATTAAACCATGTAGCATTTCTACTTGGATGATGTT 350
consensus_2025#1      ACA--------------------------------------------------------- 303
                      ***                                                         

consensus_2025#0      ATAAATCATAGACTTTCGAATACACCTACATTACACATATTTAGATATTTCGGCGGAGGG 410
consensus_2025#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2025#0      GGGGGGAAATACCGCTCGGACATCGACATATACGTATATGTTTATTTATGTATGTATGTG 470
consensus_2025#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2025#0      TGTGAGTGTGTATGTCCCCCAAGTCAAAATGTTCAAATCTTTTGAATATCATTGTTTCTA 530
consensus_2025#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2025#0      TAAAACATTATGTAATATAAGTAATTTCACATTTTATTTCAATGATATTTAGTAGTAATA 590
consensus_2025#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2025#0      ATTAACTAATGGTTCTTTATTGTATTTATGTATGTGTGTACACTTACTTACGTCTTTTAC 650
consensus_2025#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_2025#0      CCTTCGTAGAAGAGTTAAGACCGCCCAACAGCGTTCTCCA 690
consensus_2025#1      ----------------------------------------