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Schistosoma mansoni
cluster # 2055 cluster # 2055       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2055#0 length = 966 sequences # 2  

consensusID : consensus_2055#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 966
fasta sequence
                              [AGCCATATTCGGCACGACGGTCGAAATCTGAATGCACCTGCTGAAAGAGCATATAGAATTACAGAGGGTCGATGTGTATTCGCTGGCGGTTCACCCTTCAATGATGTTCTGCTTAAAGTTTCTGGAAAAGAAGTGCATTTCCAACCCGGTCAATGCAATAATTCTTACATTTTCCCCGGTGTGGGACTTGCCATTACACTGTGTCAAATTCGTCCAGTTTTACAAGAACTTTTCGTAATCGCTGCTGAATGTTTAGCAGGTCAAGTCGACGAAAAAGATTTGGATGTCGGTCGTGTATTCCCACCGTTAAGAGATATACGCAATGTTTCGTTGGCTATAGCAGTACGTGTTGCAGAATATGCTTACTCAAAAGGTATTTGCCATTATGAACCACAACCTAAGGATATTGAATTATATTTGTCTCAAAAGATGTATGATCCAAATTATATACCAGTTATGCCTGAAGTATACGATTGGCCACTTGGTGTCACTGATGCAGTCTCATAAAGATTGGAATTTTCAAAAATGAAATAACTTCATTTCAGTGCAGAGTATTAGAGTTTCAAACACTACATTTCTCACCTTTCTATCACCACTAAATGTTTTCTAATTTTTTTCATTATAGAGTTCGTTCATTGTTTACCTTTTTCGTCTCAATAGTAGCATGGCTATATTTTAGGGTAATTTAGCCAACGTACTATTCATTAATTCGATTTCATTTTGTGATGTATTTCTTTCCTTTTATCANAACAGTTTATGATTNTACTCCTGNTAGATTACTGAGGATACTANCTGCATATTACCNTGTACATTTCGGTTATAGTGTTTTAATTGTGCTTTTTTGTCTACCAATGTTTCCAGTTTATCTTGTCCAAGATTNTGTCTTCTTTTATAAAGTCAAATTCACTTCTTTTGTTGAAAAACGAATNNGTTGTGTCTCTAATAGTTAAGATTAGCCAGCAGTCG]

[+] EMBL CD081722             [AGCCATATTCGGCACGACGGTCGAAATCTGAATGCACCTGCTGAAAGAGCATATAGAATTACAGAGGGTCGATGTGTATTCGCTGGCGGTTCACCCTTCAATGATGTTCTGCTTAAAGTTTCTGGAAAAGAAGTGCATTTCCAACCCGGTCAATGCAATAATTCTTACATTTTCCCCGGTGTGGGACTTGCCATTACACTGTGTCAAATTCGTCCAGTTTTACAAGAACTTTTCGTAATCGCTGCTGAATGTTTAGCAGGTCAAGTCGACGAAAAAGATTTGGATGTCGGTCGTGTATTCCCACCGTTAAGAGATATACGCAATGTTTCGTTGGCTATAGCAGTACGTGTTGCAGAATATGCTTACTCAAAAGGTATTTGCCATTATGAACCACAACCTAAGGATATTGAATTATATTTGTCTCAAAAGATGTATGATCCAAATTATATACCAGTTATGCCTGAAGTATACGATTGGCCACTTGGTGTCACTGATGCAGTCTCATAAAGATTGGAATTTTCAAAAATGAAATAACTTCATTTCAGTGCAGAGTATTAGAGTTTCAAACACTACATTTCTCACCTTTCTATCACCACTAAATGTTTTCTAATTTTTTTCATTATAGAGTTCGTTCATTGTTTACCTTTTTCGTCTCAATAGTAGCATGGCTATATTTTAGGGTAATTTAGCCAACGTACTATTCATTAATTCGATTTCATTTTGTGATGTATTTCTTTCCTTTTATCANAACAGTTTATGATTNTACTCCTGNTAGATTACTGAGGATACTANCTGCATATTACCNTGTACATTTCGGTTATAGTGTTTTAATTGTGCTTTTTTGTCTACCAATGTTTCCAGTTTATCTTGTCCAAGATTNTGTCTTCTTTTATAAAGTCAAATTCACTTCTTTTGTTGAAAAACGAATNNGTTGTGTCTCTAATAGTTAAGATTAGCCAGCAGTCG]
[+] EMBL CD134948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTATTTGCCATTATTAACCACAACCTAAGGATATTGAATTATATTTGTCTCAAAAGATGTATGATCCAAATTATATACCAGTTATGCCTGAAGTATACGATTGGCCACTTGGTGTCACTGATGCAGTCTCATAAAGATTGGAATTTTCAAAAATGAAATAACTTCATTTCAGTGCAGAGTATTAGAGTTTCAAACACTACATTTCTCACCTTTCTATCACCACTAAATGTCCTCTAATTTTTTTCATTATAGAGTTCGTTCATTGTTTACCTTTTTCGTCTCAATAGTAGCATGGCTATATTTTAGGGTAATTTAGCCAACGTACTATTCATTAATTCGAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_2055#0 AGCCATATTCGGCACGACGGTCGAAATCTGAATGCACCTGCTGAAAGAGCATATAGAATT ACAGAGGGTCGATGTGTATTCGCTGGCGGTTCACCCTTCAATGATGTTCTGCTTAAAGTT TCTGGAAAAGAAGTGCATTTCCAACCCGGTCAATGCAATAATTCTTACATTTTCCCCGGT GTGGGACTTGCCATTACACTGTGTCAAATTCGTCCAGTTTTACAAGAACTTTTCGTAATC GCTGCTGAATGTTTAGCAGGTCAAGTCGACGAAAAAGATTTGGATGTCGGTCGTGTATTC CCACCGTTAAGAGATATACGCAATGTTTCGTTGGCTATAGCAGTACGTGTTGCAGAATAT GCTTACTCAAAAGGTATTTGCCATTATGAACCACAACCTAAGGATATTGAATTATATTTG TCTCAAAAGATGTATGATCCAAATTATATACCAGTTATGCCTGAAGTATACGATTGGCCA CTTGGTGTCACTGATGCAGTCTCATAAAGATTGGAATTTTCAAAAATGAAATAACTTCAT TTCAGTGCAGAGTATTAGAGTTTCAAACACTACATTTCTCACCTTTCTATCACCACTAAA TGTTTTCTAATTTTTTTCATTATAGAGTTCGTTCATTGTTTACCTTTTTCGTCTCAATAG TAGCATGGCTATATTTTAGGGTAATTTAGCCAACGTACTATTCATTAATTCGATTTCATT TTGTGATGTATTTCTTTCCTTTTATCANAACAGTTTATGATTNTACTCCTGNTAGATTAC TGAGGATACTANCTGCATATTACCNTGTACATTTCGGTTATAGTGTTTTAATTGTGCTTT TTTGTCTACCAATGTTTCCAGTTTATCTTGTCCAAGATTNTGTCTTCTTTTATAAAGTCA AATTCACTTCTTTTGTTGAAAAACGAATNNGTTGTGTCTCTAATAGTTAAGATTAGCCAG CAGTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)