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Schistosoma mansoni
cluster # 2076 cluster # 2076       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2076#0 length = 787 sequences # 2  

consensusID : consensus_2076#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 787
fasta sequence
                              [GGGGAATTCATCTAGAAGTACATATCTATGTTGTGTCATATGATCGTCGTCACTGCTACGACGACTACTACCGCCACTATGTATTGTTTACTTCCGTCTGCTCACATCAGTTTTTCATCTAATAATAATAATACTTGATTCTTATCATTCATCTATTCATTATATTGCGCCTGTTTGTTTGTCCTCTCTTTTTGCTTTTTTAAAGTTTATCATTTGTAATTTATGATTATGTAGTTTACTTTTCCATGTCTTTCATAATGACACACATCTATCCCACCAATAACAAACTAGTGTTGATTCATCTTTTAACTATCTATCATAAGATTGTATTACATTTTGTTCTCCTCTTCTACACACTAGGTAATTTCATCACTTTTAATATGATTGTTCTTTTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGCTGCACAGATTAGGGTTCTTTATCCAACCAACCTCCCCCCGCACCCTTACCAGTAAAATTTGTGTTACTTTTGATTATATGCTAAATTGTTATGTTTTCATTGCCCCAGTATCTATTGATGATATTGTCTGTTGTGCTTTCTGAGTCAAAAAGTAAATTTTTTTTCTTAGTTGCTATGCAAAATAACAATTTCCTCTTTTGTTTCTGACGTCTTTTCTTCTCAATTTGCTTATTTCTTAATGTAAATGCCAAAAAATTTTTTTTTAGGCATTAAAAAGAGGGATTACACATTTGAAAGAACCAGTACTCTTGCATATTAATATATAGGAATCAGTTGTTCATCAAAGATTCAACCGTCACTCAAATATAGA]

[-] EMBL CD087663             [GGGGAATTCATCTAGAAGTACATATCTATGTTGTGTCATATGATCGTCGTCACTGCTACGACGACTACTACCGCCACTATGTATTGTTTACTTCCGTCTGCTCACATCAGTTTTTCATCTAATAATAATAATACTTGATTCTTATCATTCATCTATTCATTATATTGCGCCTGTTTGTTTGTCCTCTCTTTTTGCTTTTTTAAAGTTTATCATTTGTAATTTATGATTATGTAGTTTACTTTTCCATGTCTTTCATAATGACACACATCTATCCCACCAATAACAAACTAGTGTTGATTCATCTTTTAACTATCTATCATAAGATTGTATTACATTTTGTTCTCCTCTTCTACACACTAGGTAATTTCATCACTTTTAATATGATTGTTCTTTTTTTGTTGTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD082015             [                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaggCAAACTAGTGTTGATTCATCTTTTAACTATCTATCATAAGATTGTATTACATTTTGTTCTCCTCTTCTACACACTAGGTAATTTCATCACTTTTAATATGATTGTTCTTTTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGCTGCACAGATTAGGGTTCTTTATCCAACCAACCTCCCCCCGCACCCTTACCAGTAAAATTTGTGTTACTTTTGATTATATGCTAAATTGTTATGTTTTCATTGCCCCAGTATCTATTGATGATATTGTCTGTTGTGCTTTCTGAGTCAAAAAGTAAATTTTTTTTCTTAGTTGCTATGCAAAATAACAATTTCCTCTTTTGTTTCTGACGTCTTTTCTTCTCAATTTGCTTATTTCTTAATGTAAATGCCAAAAAATTTTTTTTTAGGCATTAAAAAGAGGGATTACACATTTGAAAGAACCAGTACTCTTGCATATTAATATATAGGAATCAGTTGTTCATCAAAGATTCAACCGTCACTCAAATATAGA]


>consensus_2076#0 GGGGAATTCATCTAGAAGTACATATCTATGTTGTGTCATATGATCGTCGTCACTGCTACG ACGACTACTACCGCCACTATGTATTGTTTACTTCCGTCTGCTCACATCAGTTTTTCATCT AATAATAATAATACTTGATTCTTATCATTCATCTATTCATTATATTGCGCCTGTTTGTTT GTCCTCTCTTTTTGCTTTTTTAAAGTTTATCATTTGTAATTTATGATTATGTAGTTTACT TTTCCATGTCTTTCATAATGACACACATCTATCCCACCAATAACAAACTAGTGTTGATTC ATCTTTTAACTATCTATCATAAGATTGTATTACATTTTGTTCTCCTCTTCTACACACTAG GTAATTTCATCACTTTTAATATGATTGTTCTTTTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGCTGC ACAGATTAGGGTTCTTTATCCAACCAACCTCCCCCCGCACCCTTACCAGTAAAATTTGTG TTACTTTTGATTATATGCTAAATTGTTATGTTTTCATTGCCCCAGTATCTATTGATGATA TTGTCTGTTGTGCTTTCTGAGTCAAAAAGTAAATTTTTTTTCTTAGTTGCTATGCAAAAT AACAATTTCCTCTTTTGTTTCTGACGTCTTTTCTTCTCAATTTGCTTATTTCTTAATGTA AATGCCAAAAAATTTTTTTTTAGGCATTAAAAAGAGGGATTACACATTTGAAAGAACCAG TACTCTTGCATATTAATATATAGGAATCAGTTGTTCATCAAAGATTCAACCGTCACTCAA ATATAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)