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Schistosoma mansoni
cluster # 2080 cluster # 2080       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2080#0 length = 458 sequences # 2  

consensusID : consensus_2080#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 458
fasta sequence
                              [AATTAAAATGATCTAATGCTTGTTTACGTACTTCACCTCTTATTGATCCATCAAGACGTTGGAAACCCCAACCACGTAAACTTAAATAATCAGCTATAAGATCTAACATACGAACCATTTGACTAAAGATAAGAACTCGATGTCCCTTTGATTTAAGACGTTGTAATAATTTATCTAATAAGGTACCTTTACCGCTACCTTTTAAAAATGATCTTAATCGATCTTCTTTAGTTAAATACTGTTGGTCAACTTCAGATGGAGGTGCGATTAAATGAGCATGATTACAACATTTTTTTAATTCCATAACAATATTAATAAAAGAAGCTTTATGGCCACGTGTTACTTTTAATAATCCATCATAATTACGGGCTAAAATTAATCTATATATATTTGCTTGTTCTTTAGTCATATCAACTCGCAGAATTTGTTCAATTTTTTCCGGTAATGAACTTTCTACA]

[+] EMBL CD161234             [AATTAAAATGATCTAATGCTTGTTTACGTACTTCACCTCTTATTGATCCATCAAGACGTTGGAAACCCCAACCACGTAAACTTAAATAATCAGCTATAAGATCTAACATACGAACCATTTGACTAAAGATAAGAACTCGATGTCCCTTTGATTTAAGACGTTGTAATAATTTATCTAATAAGGTACCTTTACCGCTACCTTTTAAAAATGATCTTAATCGATCTTCTTTAGTTAAATACTGTTGGTCAACTTCAGATGGAGGTGCGATTAAATGAGCATGATTACAACATTTTTTTAATTCCATAACAATATTAATAAAAGAAGCTTTATGGCCACGTGTTACTTTTAATAATCCATCATAATTACGGGCTAAAATTAATCTATATATATTTGCTTGTTCTTTAGTCATATCAACTCGCAGAATTTGTTCAATTTTTTCCGGTAATGAACTTTCTACA]
[+] EMBL CD063799             [                    tggaTACCTTGTTGACCTCTTATTGATCCATCAAGACGTTGGAAACCCCAACCACGTAAACTTAAATAATCAGCTATAAGATCTAACATACGAACCATTTGACTAAAGATAAGAACTCGATGTCCCTTTGATTTAAGACGTTGTAATAATTTATCTAATAAGGTACCTTTACCGCTACCTTTTAAAAATGATCTTAATCGATCTTCTTTAG                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_2080#0 AATTAAAATGATCTAATGCTTGTTTACGTACTTCACCTCTTATTGATCCATCAAGACGTT GGAAACCCCAACCACGTAAACTTAAATAATCAGCTATAAGATCTAACATACGAACCATTT GACTAAAGATAAGAACTCGATGTCCCTTTGATTTAAGACGTTGTAATAATTTATCTAATA AGGTACCTTTACCGCTACCTTTTAAAAATGATCTTAATCGATCTTCTTTAGTTAAATACT GTTGGTCAACTTCAGATGGAGGTGCGATTAAATGAGCATGATTACAACATTTTTTTAATT CCATAACAATATTAATAAAAGAAGCTTTATGGCCACGTGTTACTTTTAATAATCCATCAT AATTACGGGCTAAAATTAATCTATATATATTTGCTTGTTCTTTAGTCATATCAACTCGCA GAATTTGTTCAATTTTTTCCGGTAATGAACTTTCTACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)