Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2131 cluster # 2131       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2131#0 length = 684 sequences # 2  

consensusID : consensus_2131#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 684
fasta sequence
                              [GATTATTGGTCTTCTTTCTGTTTCTCATTTAACAATGTTGGTTTCATTTACTTATTTATCTTTACTCCCTTCTTTTTGCGCTTACCTATTGTATTTGTTAGATTTGACTTGATCTTCTTACCTATTCATTAATTTATTTTACATTTGAGATTTGTTTATTTTTTCAATGAGGAATAGGTTTTATGGTTTTTTTTCTCCGATTTTTTCACGTCAGTCTGTTATTTGTTTGTTTGATTGTTTCTGTCTCTCGTTTACAAGATCTTAACAATCCCGTTTTCTTCTATCTATTGTGATTCTTTTTCTATGCATCAATTGTTTGTCGGGGTTGTTGTTGTTTATTTTACTCCTCTTTTCGAGATCGATAGTTTACATCTTTTAAATGCTTATTTATTCAGGTACCAATGCTATTAGTACCCTGTTAATCCACTATTTGTGTTTCTTATTGAATTGTCCTTCTTTTATCCAGAGGCGGTTAACATTGTTAGGTTTTTAGTATGTATGCAATTTTGTGTTCCATACTCAATAATTTTTTTCATAAAGCCTACCCTGGTGTTGATCGTGCTTATCCCTCTCTCTCTCTCTGGTTATTACTGTTTCATATTCAATTTGTACATCAACGCAATTACATACTTATAGATTCAACATTTTCTAAGGGTTTAGTCATCTCCAGTTTTTATCATTTCA]

[+] EMBL CD147207             [GATTATTGGTCTTCTTTCTGTTTCTCATTTAACAATGTTGGTTTCATTTACTTATTTATCTTTACTCCCTTCTTTTTGCGCTTACCTATTGTATTTGTTAGATTTGACTTGATCTTCTTACCTATTCATTAATTTATTTTACATTTGAGATTTGTTTATTTTTTCAATGAGGAATAGGTTTTATGGTTTTTTTTCTCCGATTTTTTCACGTCAGTCTGTTATTTGTTTGTTTGATTGTTTCTGTCTCTCGTTTACAAGATCTTAACAATCCCGTTTTCTTCTATCTATTGTGATTCTTTTTCTATGCATCAATTGTTTGTCGGGGTTGTTGTTGTTTATTTTACTCCTCTTTTCGAGATCGATAGTTTACATCTTTTAAATGCTTATTTATTCAGGTACCAATGCTATTAGTACCCTGTTAATCCACTATTTGTGTTTCTTATTGAATTGTCCTTCTTTTATCCAGAGGCGGTTAACATTGTTAGGTTTTTAGTATGTATGCAATTTTGTGTTCCATACTCAATAATT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI740391             [                                                                                                                                                                                                           TTTCACGTCAGTCTGTTATTTGTTTGTTTGATTGTTTTTGTCTCTCGTTTACAAGATCTTAACAATCCCGTTTTCTTCTATCTATTGTGATTCTTTTTCTATGCATCAATTGTTTGTCGGGGTTGTTGTTGTTTATTTTACTCCTCTTTTCGAGATCGATAGTTTACATCTTTTAAATGCTTATTTATTCAGGTACCAATGCTATTAGTACCCTGTTAATCCACTATTTGTGTTTCTTATTGAATTGTCCTTCTTTTATCCAGAGGCGGTTAACATTGTTAGGTTTTTAGTATGTATGCAATTTTGTGTTCCATACTCAATAATTTTTTTCATAAAGCCTACCCTGGTGTTGATCGTGCTTATCCCTCTCTCTCTCTCTGGTTATTACTGTTTCATATTCAATTTGTACATCAACGCAATTACATACTTATAGATTCAACATTTTCTAAGGGTTTAGTCATCTCCAGTTTTTATCATTTCA]


>consensus_2131#0 GATTATTGGTCTTCTTTCTGTTTCTCATTTAACAATGTTGGTTTCATTTACTTATTTATC TTTACTCCCTTCTTTTTGCGCTTACCTATTGTATTTGTTAGATTTGACTTGATCTTCTTA CCTATTCATTAATTTATTTTACATTTGAGATTTGTTTATTTTTTCAATGAGGAATAGGTT TTATGGTTTTTTTTCTCCGATTTTTTCACGTCAGTCTGTTATTTGTTTGTTTGATTGTTT CTGTCTCTCGTTTACAAGATCTTAACAATCCCGTTTTCTTCTATCTATTGTGATTCTTTT TCTATGCATCAATTGTTTGTCGGGGTTGTTGTTGTTTATTTTACTCCTCTTTTCGAGATC GATAGTTTACATCTTTTAAATGCTTATTTATTCAGGTACCAATGCTATTAGTACCCTGTT AATCCACTATTTGTGTTTCTTATTGAATTGTCCTTCTTTTATCCAGAGGCGGTTAACATT GTTAGGTTTTTAGTATGTATGCAATTTTGTGTTCCATACTCAATAATTTTTTTCATAAAG CCTACCCTGGTGTTGATCGTGCTTATCCCTCTCTCTCTCTCTGGTTATTACTGTTTCATA TTCAATTTGTACATCAACGCAATTACATACTTATAGATTCAACATTTTCTAAGGGTTTAG TCATCTCCAGTTTTTATCATTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)