cluster # 2173

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Schistosoma mansoni
cluster # 2173 cluster # 2173 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2173#0 length = 659 sequences # 2

consensusID : consensus_2173#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 659
fasta sequence

                              [CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGGGAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTTTATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTTGCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTTCGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAGAATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAACTAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA]

[+] EMBL CD196588             [CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGGGAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTTTATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTTGCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTC                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD196773             [                                                                                                                                                                                                                       ATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTTCGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAGAATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAACTAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA]




>consensus_2173#0
CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGG
GAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTT
TATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTT
GCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGA
AATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGAT
GCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTC
CAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCT
TTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTT
CGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAG
AATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAAC
TAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case