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Schistosoma mansoni
cluster # 2173 cluster # 2173       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2173#0 length = 659 sequences # 2  

consensusID : consensus_2173#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 659
fasta sequence
                              [CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGGGAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTTTATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTTGCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTTCGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAGAATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAACTAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA]

[+] EMBL CD196588             [CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGGGAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTTTATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTTGCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTC                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD196773             [                                                                                                                                                                                                                       ATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGAAATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGATGCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTCCAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCTTTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTTCGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAGAATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAACTAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA]


>consensus_2173#0 CAAAAACGGTAAGTTATGTACACTTGTCTGCAGATTTCCACCAGATACATGATACAAGGG GAAAAATCGACATTCCCTCTAAATAACTGACGTGAAGGAATAAGTTCGGCATTTCCCCTT TATTTGTGTTTTTGTCCGCATTTTCCCCCTTTGTTCGCCTTTATTTTCCTTCTATTGGTT GCTTGGGATAAAATCCAGACAAATATTTGTCTGGAATTTATAGCCGTTAGTGATTGACGA AATTTATATTCTTCAGTCGGGCGGAATTGTGTGAGAATGAAAATAAAAACAATTATAGAT GCGGAGACATGTATGTGTATATTACGTTGATTGGGCTGTAAGCTCTTCATACTAGCCCTC CAAGAGTATCTTAGCTCATTTCTAATTTGTTGATCTGTCAAGAAGTATTATTTGATTGCT TTGTGGTCGATCGCTTGGATTACTCCATGTATCTATGCTTAATTCTAGTCCCTACATTTT CGTACTAAATCCACTTAATGAAGACTAATGGCATTTATTATTTGTGCGAACGTGATGCAG AATTTTATTTCATGGTCTTATGCTGTATTACAACTCTCAACCCGTAGGTGTTTTTGAAAC TAGACTGCTGGCTATGGAAAATTGCTGCCCGTAAAGCTCTCTCACATCTGTTTTATGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)