cluster # 2182

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Schistosoma mansoni
cluster # 2182 cluster # 2182 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2182#0 length = 528 sequences # 2

consensusID : consensus_2182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 528
fasta sequence

                              [AAACTTTATTTCCCATCAACTATTCAATTACTTTTTCAGTGTAATAGTAGTAGTAGTAGTCATATATAGTGTGATTGTAATCTCCAAATAAACTTCTTCCATCTACTTCTACTACACATCGGTTATCTCTTATTGTTTATTAAATAATTTAGTTTGATTTTTGTATGTAGTAAAGTATTATTTTTTTCCTTTCTTATGTGCTTACAATGATAACTGAACCTCATGTGCTGTTGTTCACTCCTACTTATCGACGATGACAGTATATTCAACTTGTATTCAGTGTTATATATAGATATGGATAGTTTGATTATTCCTTCGTATAATCTTCAGTTGTATCTCCACGGAAATACAATTTATCTCCTAACAATACTATATTACAGCTATTAATATTATTGATACTGCTATTTTGCTAACTTACATTCTCAATATTTATGGGAACAGATGTTTTGTTTTCCCATTGAAAGATATCTTACATGTAGAGTTGTCAAGTGAATGTTAACACAACTAAAAGTTGTAATGGGTCTTTCA]

[+] EMBL AI067584             [AAACTTTATTTCCCATCAACTATTCAATTACTTTTTCAGTGTAATAGTAGTAGTAGTAGTCATATATAGTGTGATTGTAATCTCCAAATAAACTTCTTCCATCTACTTCTACTACACATCGGTTATCTCTTATTGTTTATTAAATAATTTAGTTTGATTTTTGTATGTAGTAAAGTATTATTTTTTTCCTTTCTTATGTGCTTACAATGATAACTGAACCTCATGTGCTGTTGTTCACTCCTACTTATCGACGATGACAGTATATTCAACTTGTATTCAGTGTTATATATAGATATGGATAGTTTGATTATTCCTTCGTATAATCTTCAGTTGTATCTCCACGGAAATACAATTTATCTCCTAACAATACTATATTACAGCTATTAATATTATTGATACTGCTATTTTGCTAACTTACATTCTCAATATTTATGGGAACAGATGTTTTGTTTTCCCATTGAAAGATATCTTACATGTAGAGTTGTCAAGTGAATGTTAACACAACTAAAAGTTGTAATGGGTCTTTCA]
[-] EMBL CD064241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                ccATTCAGTGTTATATATAGATATGGATAGTTTGATTATTCCTTCGTATAATCTTCAGTTGTATCTCCACGGAAATACAATTTATCTCCTAACAATACTATATTACAGCTATTAATATTATTGATACTGCTATTTTGCTAACTTACATTCTCAATATTTATGGGAACAGATGTTTTGTTTTCCCATTGAAAGATATCTTACATGTAG                                                 ]




>consensus_2182#0
AAACTTTATTTCCCATCAACTATTCAATTACTTTTTCAGTGTAATAGTAGTAGTAGTAGT
CATATATAGTGTGATTGTAATCTCCAAATAAACTTCTTCCATCTACTTCTACTACACATC
GGTTATCTCTTATTGTTTATTAAATAATTTAGTTTGATTTTTGTATGTAGTAAAGTATTA
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CTACTTATCGACGATGACAGTATATTCAACTTGTATTCAGTGTTATATATAGATATGGAT
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CTAACAATACTATATTACAGCTATTAATATTATTGATACTGCTATTTTGCTAACTTACAT
TCTCAATATTTATGGGAACAGATGTTTTGTTTTCCCATTGAAAGATATCTTACATGTAGA
GTTGTCAAGTGAATGTTAACACAACTAAAAGTTGTAATGGGTCTTTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case