cluster # 2211

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Schistosoma mansoni
cluster # 2211 cluster # 2211 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2211#0 length = 709 sequences # 2

consensusID : consensus_2211#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 709
fasta sequence

                              [GCACGAGGAGTCTTGGTTTTCGTGGTCTTGTTTGTGCCACACACCTTTTGAATAGATTGGATGAAAACAAGTTATCATTGTCTCGAGAAGCTAACGTTCAGAACGCTAATAATGTTAAATCAAACGACCATCCACTTTCCTCATCCGTAAATGATTCAAGCTATAATGGAAGCTTAAACTATACAAATAAGAATGGATTAACAACATTGTTGGTTTTAGCCGGTAGACCGGATCAAACTAAACATGTAACATCTGGGATATGGTTTCATCATCCTCAGGCTTGTAATAGCTCGGACAAAACGGTTGCATTATTCGATTCTCAAAAACCAAATTATTTTCTGCCAGCTGCAATCGCTCAAACCCTGGGACAATACCTTTCACCAACAGCAGTTGTATTGGCTAACTGGACACACATTGTTCAGTCTGTAAATCCCATCACTTTTTTAACTAATTATTCGAAACAAGAAAACTGTGAACAAAACAAATTCTCTTATATNTGCGGTAACTTTCCTGAAAGCTCCAACTGGTCATGGGATAGTGACTAAACAACAGATTCCTCATGTGATAAAAGATAAGTTAGTTCATAATTGCATTTTTTAAAATTGTATATTGGTCAGTGCAATATGCAAAATAAATCATTGTATCATGTATCAGTTCATCAGATCCACCAGTTCATCTTTTTCACAGTTATTCCTACTGTTGCATTTAT]

[+] EMBL CD083506             [GCACGAGGAGTCTTGGTTTTCGTGGTCTTGTTTGTGCCACACACCTTTTGAATAGATTGGATGAAAACAAGTTATCATTGTCTCGAGAAGCTAACGTTCAGAACGCTAATAATGTTAAATCAAACGACCATCCACTTTCCTCATCCGTAAATGATTCAAGCTATAATGGAAGCTTAAACTATACAAATAAGAATGGATTAACAACATTGTTGGTTTTAGCCGGTAGACCGGATCAAACTAAACATGTAACATCTGGGATATGGTTTCATCATCCTCAGGCTTGTAATAGCTCGGACAAAACGGTTGCATTATTCGATTCTCAAAAACCAAATTATTTTCTGCCAGCTGCAATCGCTCAAACCCTGGGACAATACCTTTCACCAACAGCAGTTGTATTGGCTAACTGGACACACATTGTTCAGTCTGTAAATCCCATCACTTTTTTAACTAATTATTCGAAACAAGAAAACTGTGAACAAAACAAATTCTCTTATATNTGCGGTAACTTTCCT                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD147958             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCACCAACAGTAGTTGTATTGGCTAACTGGACACACATTGTTCAGTCTGTAAATCCCATCACTTTTTTAACTAATTATTCGAAACAAGAAAACTGTGAACAAAACAAATTCTCTTATATTTGCGGTAACTTTCCTGAAAGCTCCAACTGGTCATGGGATAGTGACTAAACAACAGATTCCTCATGTGATAAAAGATAAGTTAGTTCATAATTGCATTTTTTAAAATTGTATATTGGTCAGTGCAATATGCAAAATAAATCATTGTATCATGTATCAGTTCATCAGATCCACCAGTTCATCTTTTTCACAGTTATTCCTACTGTTGCATTTAT]




>consensus_2211#0
GCACGAGGAGTCTTGGTTTTCGTGGTCTTGTTTGTGCCACACACCTTTTGAATAGATTGG
ATGAAAACAAGTTATCATTGTCTCGAGAAGCTAACGTTCAGAACGCTAATAATGTTAAAT
CAAACGACCATCCACTTTCCTCATCCGTAAATGATTCAAGCTATAATGGAAGCTTAAACT
ATACAAATAAGAATGGATTAACAACATTGTTGGTTTTAGCCGGTAGACCGGATCAAACTA
AACATGTAACATCTGGGATATGGTTTCATCATCCTCAGGCTTGTAATAGCTCGGACAAAA
CGGTTGCATTATTCGATTCTCAAAAACCAAATTATTTTCTGCCAGCTGCAATCGCTCAAA
CCCTGGGACAATACCTTTCACCAACAGCAGTTGTATTGGCTAACTGGACACACATTGTTC
AGTCTGTAAATCCCATCACTTTTTTAACTAATTATTCGAAACAAGAAAACTGTGAACAAA
ACAAATTCTCTTATATNTGCGGTAACTTTCCTGAAAGCTCCAACTGGTCATGGGATAGTG
ACTAAACAACAGATTCCTCATGTGATAAAAGATAAGTTAGTTCATAATTGCATTTTTTAA
AATTGTATATTGGTCAGTGCAATATGCAAAATAAATCATTGTATCATGTATCAGTTCATC
AGATCCACCAGTTCATCTTTTTCACAGTTATTCCTACTGTTGCATTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case