Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2223 cluster # 2223       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2223#0 length = 548 sequences # 2  

consensusID : consensus_2223#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 548
fasta sequence
                              [TTGTAATCTTTCATTATCTGTACGTAAATAATTTAATTGTGAATATAAATGTGACATTTCATCTTTTAATTGATCTAATTGATGTGCACTTGCTAATGCTTCTAATTGTACATCAGTTAATTTAGATTCTTTTTCAGCTAATTGACATTTTAAATGATTCAATTCATCTTGACATGATTGTTTAGTTAATTCTAATTTACTATCATTATTGTCCAGCATATTCTTATCTCTTTCTTCAACATTGAATGATGTGTTTTGTTTATCTGACTTGTTATAGTTAATTAAGTGATTTGGACAACTGAGTTGATTTGAATGGATTGGTCGATGGTCCTGCTGATGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGTCGTGCATGGTTCAAACGATCAGTTTGTTCATTTGTTGGTGGTATAATAGTACTACTATTACTACTACTAGTAGTAGTAGTAGCAGTAATGATATTACAATTATTTTGACCATTTCCACCTATTCCTAATGTACTCCATGATGATGATGACGATGATACTGATGATGAATTTGATGGAGATAAACCAT]

[-] EMBL CD133061             [TTGTAATCTTTCATTATCTGTACGTAAATAATTTAATTGTGAATATAAATGTGACATTTCATCTTTTAATTGATCTAATTGATGTGCACTTGCTAATGCTTCTAATTGTACATCAGTTAATTTAGATTCTTTTTCAGCTAATTGACATTTTAAATGATTCAATTCATCTTGACATGATTGTTTAGTTAATTCTAATTTACTATCATTATTGTCCAGCATATTCTTATCTCTTTCTTCAACATTGAATGATGTGTTTTGTTTATCTGACTTGTTATAGTTAATTAAGTGATTTGGACAACTGAGTTGATTTGAATGGATTGGTCGATGGTCCTGCTGATGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD064459             [                                                                                             TAATGCTTCTAATTGTACATCAGTTAATTTAGATTCTTTTTCAGCTAA TGACA TTTAAATGATTCAATTCATCTTGACATGA TGTTTAGTTAATTCTAATTTACTATCATTATTGTCCAGCATATTCTTATCTCTTTCTTCAACATTGAATGATGTGTTTGGTTTATCTGACTTGTTATAGTTAATTAAGTGATTTGGACAACTGAGTTGATTTGAATGGATTGGTCGATGGTCCTGCTGATGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGTCGTGCATGGTTCAAACGATCAGTTTGTTCATTTGTTGGTGGTATAATAGTACTACTATTACTACTACTAGTAGTAGTAGTAGCAGTAATGATATTACAATTATTTTGACCATTTCCACCTATTCCTAATGTACTCCATGATGATGATGACGATGATACTGATGATGAATTTGATGGAGATAAACCAT]


>consensus_2223#0 TTGTAATCTTTCATTATCTGTACGTAAATAATTTAATTGTGAATATAAATGTGACATTTC ATCTTTTAATTGATCTAATTGATGTGCACTTGCTAATGCTTCTAATTGTACATCAGTTAA TTTAGATTCTTTTTCAGCTAATTGACATTTTAAATGATTCAATTCATCTTGACATGATTG TTTAGTTAATTCTAATTTACTATCATTATTGTCCAGCATATTCTTATCTCTTTCTTCAAC ATTGAATGATGTGTTTTGTTTATCTGACTTGTTATAGTTAATTAAGTGATTTGGACAACT GAGTTGATTTGAATGGATTGGTCGATGGTCCTGCTGATGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG TCGTGCATGGTTCAAACGATCAGTTTGTTCATTTGTTGGTGGTATAATAGTACTACTATT ACTACTACTAGTAGTAGTAGTAGCAGTAATGATATTACAATTATTTTGACCATTTCCACC TATTCCTAATGTACTCCATGATGATGATGACGATGATACTGATGATGAATTTGATGGAGA TAAACCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)