cluster # 2236

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Schistosoma mansoni
cluster # 2236 cluster # 2236 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2236#0 length = 637 sequences # 2

consensusID : consensus_2236#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 637
fasta sequence

                              [GAGGGTCTCCTCATAAATTCCTACAAAATGATATATTTAAAACAACAGATATTCATTTAAATAAATGTTCAACTATTCTACGTTATTTAGACGATTATCTGTGTATATCAACTTCTAAAATTGAATTACAAAATTTAATAAAGAGAATAAAAACTTCACTTAACTCTTATGGATTATTATTGAATGAACAAAAATCGCAAACTAATTTATATGATCCAAATGTACCTATAAAGTGGCTTGGGATTGAAGTACATTCTAGTTTAACAATAACTTTACCCAAAAATAATAGTCCACCAAAATTTTGTCGATTTTCTGGTCAATCTTTATCAGCCAATGATTGTATGCGACGATTATGTAAATTTCGTCTTCATTGTCCAACTTGGCGCTTTACTTTCCACAAGATAATCTATAATACTAACATTAGGCAAAATGTATTTATTTGTAAAAATGAAAATATCAGAAAAACTAATTATTTGTTACAAATCAACGCTAATCGATTAGGCAACAGAATAGCTGATATTGTATGGATATCTTTGAAAACCTCACCGGAAAAAGATAGATTACTTCAACCTTCTACATCTCGAAGACTAGCAAAGGCAATATTTAGGGGGTATATGTATAAATATTNGGTTTCAAT]

[+] EMBL CD084050             [GAGGGTCTCCTCATAAATTCCTACAAAATGATATATTTAAAACAACAGATATTCATTTAAATAAATGTTCAACTATTCTACGTTATTTAGACGATTATCTGTGTATATCAACTTCTAAAATTGAATTACAAAATTTAATAAAGAGAATAAAAACTTCACTTAACTCTTATGGATTATTATTGAATGAACAAAAATCGCAAACTAATTTATATGATCCAAATGTACCTATAAAGTGGCTTGGGATTGAAGTACATTCTAGTTTAACAATAACTTTACCCAAAAATAATAGTCCACCAAAATTTTGTCGATTTTCTGGTCAATCTTTATCAGCCAATGATTGTATGCGACGATTATGTAAATTTCGTCTTCATTGTCCAACTTGGCGCTTTACTTTCCACAAGATAATCTATAATACTAACA                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AA999216             [                                                                                                                                                                                                                                                                 AGTTTAACAATAACTTTACCCAAAAATAATAGTCCACCAAAATTTTGTCGATTTTCTGGTCAATCTTTATCAGCCAATGATTGTATGCGACGATTATGTAAATTTCGTCTTCATTGTCCAACTTGGCGCTTTACTTTCCACAAGATAATCTATAATACTAACATTAGGCAAAATGTATTTATTTGTAAAAATGAAAATATCAGAAAAACTAATTATTTGTTACAAATCAACGCTAATCGATTAGGCAACAGAATAGCTGATATTGTATGGATATCTTTGAAAACCTCACCGGAAAAAGATAGATTACTTCAACCTTCTACATCTCGAAGACTAGCAAAGGCAATATTTAGGGGGTATATGTATAAATATTNGGTTTCAAT]




>consensus_2236#0
GAGGGTCTCCTCATAAATTCCTACAAAATGATATATTTAAAACAACAGATATTCATTTAA
ATAAATGTTCAACTATTCTACGTTATTTAGACGATTATCTGTGTATATCAACTTCTAAAA
TTGAATTACAAAATTTAATAAAGAGAATAAAAACTTCACTTAACTCTTATGGATTATTAT
TGAATGAACAAAAATCGCAAACTAATTTATATGATCCAAATGTACCTATAAAGTGGCTTG
GGATTGAAGTACATTCTAGTTTAACAATAACTTTACCCAAAAATAATAGTCCACCAAAAT
TTTGTCGATTTTCTGGTCAATCTTTATCAGCCAATGATTGTATGCGACGATTATGTAAAT
TTCGTCTTCATTGTCCAACTTGGCGCTTTACTTTCCACAAGATAATCTATAATACTAACA
TTAGGCAAAATGTATTTATTTGTAAAAATGAAAATATCAGAAAAACTAATTATTTGTTAC
AAATCAACGCTAATCGATTAGGCAACAGAATAGCTGATATTGTATGGATATCTTTGAAAA
CCTCACCGGAAAAAGATAGATTACTTCAACCTTCTACATCTCGAAGACTAGCAAAGGCAA
TATTTAGGGGGTATATGTATAAATATTNGGTTTCAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case