cluster # 2406

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Schistosoma mansoni
cluster # 2406 cluster # 2406 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2406#0 length = 699 sequences # 2

consensusID : consensus_2406#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 699
fasta sequence

                              [AATTGTTATGCTAAAGTTGTGTCGATTGATGATAAAAAGCATATCGTTATATTGGCCCAACGAAAAATTTATCCTGGTGAAGAATTGACGTATGATTATCGTTTTCCTAAAGAATCCGATAAATTACCGTGCAATTGTGGCAGTTATTCTTGTAGAAAATATTTAAATTAATCTATTCTATGTATATCTATATATTAGTAAGAAAAGAAGATATTTTTAATTTCTGTTCTCTCTCTATATATATATATTTGTGTATTCTACTATTTCAATGATACAGTCACATTCTCCTCTTTTATTGTGTTCCTTTTTTCCTCTTTAATGATCAACTGGTTGTTTATTAATACATCTTCATATTATATACACATTTAATTACTTGTTAGATTTTTATAATGAAGCAAACCCTTCCCCCCTTCCAGTTCATTGAAATTTGTTGTCTTTTATGTACAAAAGTTATAAAGATACAAAAACATCCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTATAATTTCCTGCATTTCTTCATTAATGAAAAAAGAAGAAGAATATTATTGTTTTTATTATTGTTGTGGTTATTTTTATGCATCGAAACAATAGTGTGTACATTTTATCAATATTATAATATATGTATGTATATAACTGTACTGATCTGAATAAGTCTCTTTCTAATTATTCAATATGAATATAAATTATATAATATATGTATATG]

[+] EMBL BF936926             [AATTGTTATGCTAAAGTTGTGTCGATTGATGATAAAAAGCATATCGTTATATTGGCCCAACGAAAAATTTATCCTGGTGAAGAATTGACGTATGATTATCGTTTTCCTAAAGAATCCGATAAATTACCGTGCAATTGTGGCAGTTATTCTTGTAGAAAATATTTAAATTAATCTATTCTATGTATATCTATATATTAGTAAGAAAAGAAGATATTTTTAATTTCTGTTCTCTCTCTATATATATATATTTGTGTATTCTACTATTTCAATGATACAGTCACATTCTCCTCTTTTATTGTGTTCCTTTTTTCCTCTTTAATGATCAACTGGTTGTTTATTAATACATCTTCATATTATATACACATTTAATTACTTGTTAGATTTTTATAATGAAGCAAACCCTTCCCCCCTTCCAGTTCATTGAAATTTGTTGTCTTTTATGTACAAAAGTTATAAAGATACAAAAACATCCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTATAATTTCCTGCATTTCTTCATTAATGAAAAAAGAAGAAGAATATTATTGTTTTTATTATTGTTGTGGTTATTTTTATGCATCGAAACAATAGTGTGTACATTTTATCAATATTATAATATATGTATGTATATAACTGTACTGATCTGAATAAGTCTCTTTCTAATTATTCAATATGAATATAAATTATATAATATATGTATATG]
[-] EMBL CD086461             [                             TGATAAAAAGCATATCGTTATATTGGCCCAACGAAATATTTATCATGGTGAAGAATTGACGTATGATTATCGTTTTCGTAAAGAATCCGATAAATTACCGTGCAATTGTGGCAGTTATTCTTGTAGAAAATATTTAAATTAATCTATTCTATGTATATCTATATATTAGTAAGAAAAGAAGATATTTTTAATTTCTGTTCCCTCTCTATATATATATATTTGTGTATTCTACTATTTCAATGATACAGTCACATTCTCCTCTTTTATTGTGTTCCTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_2406#0
AATTGTTATGCTAAAGTTGTGTCGATTGATGATAAAAAGCATATCGTTATATTGGCCCAA
CGAAAAATTTATCCTGGTGAAGAATTGACGTATGATTATCGTTTTCCTAAAGAATCCGAT
AAATTACCGTGCAATTGTGGCAGTTATTCTTGTAGAAAATATTTAAATTAATCTATTCTA
TGTATATCTATATATTAGTAAGAAAAGAAGATATTTTTAATTTCTGTTCTCTCTCTATAT
ATATATATTTGTGTATTCTACTATTTCAATGATACAGTCACATTCTCCTCTTTTATTGTG
TTCCTTTTTTCCTCTTTAATGATCAACTGGTTGTTTATTAATACATCTTCATATTATATA
CACATTTAATTACTTGTTAGATTTTTATAATGAAGCAAACCCTTCCCCCCTTCCAGTTCA
TTGAAATTTGTTGTCTTTTATGTACAAAAGTTATAAAGATACAAAAACATCCTCTCTCTC
TCTCTTTTTTTTTTATAATTTCCTGCATTTCTTCATTAATGAAAAAAGAAGAAGAATATT
ATTGTTTTTATTATTGTTGTGGTTATTTTTATGCATCGAAACAATAGTGTGTACATTTTA
TCAATATTATAATATATGTATGTATATAACTGTACTGATCTGAATAAGTCTCTTTCTAAT
TATTCAATATGAATATAAATTATATAATATATGTATATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case