cluster # 2498

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Schistosoma mansoni
cluster # 2498 cluster # 2498 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2498#0 length = 674 sequences # 2

consensusID : consensus_2498#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 674
fasta sequence

                              [TTACGAACAGGAAAACAAATGAAAATCGGAAGCTATTTTCCAGTGAATCAGCATACACACTTTTGATGAGTATTTATCAAGTAATTGATCTACAGTATTTTGATAGTGTTTGATATAGGTTCCATTTAACCCCCTAACTGTTCTCATATGCTTTCTCCATTCATTGTACTGTTAATTAGATAGAAACCTATTCCTCAAACTTCGTATTAGAAAGATCCTAATTATTAAGAAATCGCATATTAATTATGATGTATTGTAGACTTCTTTATATATGAATATATAAGCTAAGGTACTTGCTTAAAAACATTCATATGACCACAACTGAAAATGAGAACAATAATACCTGACTGAATACTTCCCGTTATTATTATTATTATTAAAATTCAGAGCGTTATTGGAATAAGCGGAAAATAAAACAAGTATTACATAGATGTTGCCATTGTATGCAATATACCATACAAATGATTGATTAATACTCCATGGTCTAGTAATCGGACTTAACAAGGATGGTGTAAAACAGTTCACATTAAGAGTTAGTAATGAAACACACTANNACAGAAACANAGCANCAGAAATTGCATTTTGGTATTCGGATGATAATTNTGATATTTATTGAACGATTCGTTTAGGGNTCATTCTACTTTTTATTTCTTTACTGATCATANATTGTATGC]

[+] EMBL CD088681             [TTACGAACAGGAAAACAAATGAAAATCGGAAGCTATTTTCCAGTGAATCAGCATACACACTTTTGATGAGTATTTATCAAGTAATTGATCTACAGTATTTTGATAGTGTTTGATATAGGTTCCATTTAACCCCCTAACTGTTCTCATATGCTTTCTCCATTCATTGTACTGTTAATTAGATAGAAACCTATTCCTCAAACTTCGTATTAGAAAGATCCTAATTATTAAGAAATCGCATATTAATTATGATGTATTGTAGACTTCTTTATATATGAATATATAAGCTAAGGTACTTGCTTAAAAACATTCATATGACCACAACTGAAAATGAGAACAATAATACCTGACTGAATACTTCCCGTTATTATTATTATTATTAAAATTCAGAGCGTTATTGGAATAAGCGGAAAATAAAACAAGTATTACATAGATGTTGCCATTGTATGCAATATACCATACAAATGATTGATTAATACTCCATGGTCTAGTAATCGGACTTAACAAGGATGGTGTAAAACAGTTCACATTAAGAGTTAGTAATGAAACACACTANNACAGAAACANAGCANCAGAAATTGCATTTTGGTATTCGGATGATAATTNTGATATTTATTGAACGATTCGTTTAGGGNTCATTCTACTTTTTATTTCTTTACTGATCATANATTGTATGC]
[+] EMBL CD088644             [TTACGAACAGGAAAACAAATGAAAATCGGAAGCTATTTTCCAGTGAATCAGCATACACACTTTTGATGAGTATTTATCAAGTAATTGATCTACAGTATTTTGATAGTGTTTGATATAGGTTCCATTTAACCCCCTAACTGTTCTCATATGCTTTCTCCATTCATTGTACTGTTAATTAGATAGAAACCTATTCCTCAAACTTCGTATTAGAAAGATCCTAATTATTAAGAAATCGCATATTAATTATGATGTATTGTAGACTTCTTTATATATGAATATATAAGCTAAGGTACTTGCTTAAAAACATTCATATGACCACAACTGAAAATGAGAACAATAATAACTGACAGAATACTTCCCGTTATTATTATTATTATTAAAATTCAGAGCGTTATTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_2498#0
TTACGAACAGGAAAACAAATGAAAATCGGAAGCTATTTTCCAGTGAATCAGCATACACAC
TTTTGATGAGTATTTATCAAGTAATTGATCTACAGTATTTTGATAGTGTTTGATATAGGT
TCCATTTAACCCCCTAACTGTTCTCATATGCTTTCTCCATTCATTGTACTGTTAATTAGA
TAGAAACCTATTCCTCAAACTTCGTATTAGAAAGATCCTAATTATTAAGAAATCGCATAT
TAATTATGATGTATTGTAGACTTCTTTATATATGAATATATAAGCTAAGGTACTTGCTTA
AAAACATTCATATGACCACAACTGAAAATGAGAACAATAATACCTGACTGAATACTTCCC
GTTATTATTATTATTATTAAAATTCAGAGCGTTATTGGAATAAGCGGAAAATAAAACAAG
TATTACATAGATGTTGCCATTGTATGCAATATACCATACAAATGATTGATTAATACTCCA
TGGTCTAGTAATCGGACTTAACAAGGATGGTGTAAAACAGTTCACATTAAGAGTTAGTAA
TGAAACACACTANNACAGAAACANAGCANCAGAAATTGCATTTTGGTATTCGGATGATAA
TTNTGATATTTATTGAACGATTCGTTTAGGGNTCATTCTACTTTTTATTTCTTTACTGAT
CATANATTGTATGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case