Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2568 cluster # 2568       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2568#0 length = 630 sequences # 2  

consensusID : consensus_2568#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 630
fasta sequence
                              [TTTATTTTTCCTTTGTATTGTTGTTTCCATTGTTCTGGTAACTAGAATGCCGGTGATATCATAATTCAGTTTTATAGATAACAGTGAATATTTTTACTAATTCAAACCACCAACATTTGTTTCACTATTCAACAGAATTATAAACCTCATATCCGTATTTAAAAAAATATAATGAGAAACTTCCTCAATAAATATTAGATTCCCGAAAAGCCGATACAATTCAACTTTGTTTATTATGAGCATCATTTGTTAACTTATTAGCTTTTACGACCGATAGAATGGTTCTATTCAAAGCTGACTGATTTATTATCATCTATTGTTCTTAAAATCTTATTAATTATCACTGAATCAGCGGATTGAGGCCAGGAGTGGAATCTTGGAGGCTCATTTGTCATAATTATAACCTATTTGTGAAATGTACAAACCCTCGGCTTTTATGTTAATTTCGCGACTCCAGAATAGTGTCATTTTCTTCATTTCCTAATAAGTCTTCGCCCAATCTACTGGATCCAAATAAAAACGACATAAATATCATACCCATTGAACAAGGCAGTGGCTATCTATCAGCTCAATAGATAATACATGAAGCGATTGTAGTANACTACTGTTTACTANCACTATNGTTCAAGT]

[+] EMBL CD090033             [TTTATTTTTCCTTTGTATTGTTGTTTCCATTGTTCTGGTAACTAGAATGCCGGTGATATCATAATTCAGTTTTATAGATAACAGTGAATATTTTTACTAATTCAAACCACCAACATTTGTTTCACTATTCAACAGAATTATAAACCTCATATCCGTATTTAAAAAAATATAATGAGAAACTTCCTCAATAAATATTAGATTCCCGAAAAGCCGATACAATTCAACTTTGTTTATTATGAGCATCATTTGTTAACTTATTAGCTTTTACGACCGATAGAATGGTTCTATTCAAAGCTGACTGATTTATTATCATCTATTGTTCTTAAAATCTTATTAATTATCACTGAATCAGCGGATTGAGGCCAGGAGTGGAATCTTGGAGGCTCATTTGTCATAATTATAACCTATTTGTGAAATGTACAAACCCTCGGCTTTTATGTTAATTTCGCGACTCCAGAATAGTGTCATTTTCTTCATTTCCTAATAAGTCTTCGCCCAATCTACTGGATCCAAATAAAAACGACATAAATATCATACCCATTGAACAAGGCAGTGGCTATCTATCAGCTCAATAGATAATACATGAAGCGATTGTAGTANACTACTGTTTACTANCACTATNGTTCAAGT]
[+] EMBL CD089969             [TTTATTTTTCCTTTGTATTGTTGTTTCCATTGTTCTGGTAACTAGAATGCCGGTGATATCATAATTCAGTTTTATAGATAACAGTGAATATTTTTACTAATTCAAACCACCAACATTTGTTTCACTATTCAACAGAATTATAAACCTCATATCCGTATTT AAAAAATATAATGAGAAACTTCCTCAATAAATATTAGATTCCCGAAAAGCCGATACAATTCAACTTTGTTTATTATGAGCATCATTTGTTAACTTATTAGCTTTTACGACCGATAGAATGGTTCTATTCAAAGCTGACTGATTTATTATCATCTATTGTTCTTAAAACCTTATTAATTATCACTGAATCAGCGGATTGAGGCCAGGAGTGGAATCTTGGAGGCTCATTTGTCATAATTATAACCTATTTGTGAAATGTACAAACCTTCGGCTTTTATGTTAATTTCGCGACTCCAGAATAGTGTCATTTACTTCATTTCCTAATAAGTCTTCGCCCAATCTACTGGATCCAAATAAAAACGACATAAATATCATACCCATTGAACAAGGCAGTGGCTATCTATCAGCTCAATAGATAATACATGAAGCGATTGTAGTAAACTACTGT                      ]


>consensus_2568#0 TTTATTTTTCCTTTGTATTGTTGTTTCCATTGTTCTGGTAACTAGAATGCCGGTGATATC ATAATTCAGTTTTATAGATAACAGTGAATATTTTTACTAATTCAAACCACCAACATTTGT TTCACTATTCAACAGAATTATAAACCTCATATCCGTATTTAAAAAAATATAATGAGAAAC TTCCTCAATAAATATTAGATTCCCGAAAAGCCGATACAATTCAACTTTGTTTATTATGAG CATCATTTGTTAACTTATTAGCTTTTACGACCGATAGAATGGTTCTATTCAAAGCTGACT GATTTATTATCATCTATTGTTCTTAAAATCTTATTAATTATCACTGAATCAGCGGATTGA GGCCAGGAGTGGAATCTTGGAGGCTCATTTGTCATAATTATAACCTATTTGTGAAATGTA CAAACCCTCGGCTTTTATGTTAATTTCGCGACTCCAGAATAGTGTCATTTTCTTCATTTC CTAATAAGTCTTCGCCCAATCTACTGGATCCAAATAAAAACGACATAAATATCATACCCA TTGAACAAGGCAGTGGCTATCTATCAGCTCAATAGATAATACATGAAGCGATTGTAGTAN ACTACTGTTTACTANCACTATNGTTCAAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)