cluster # 2723

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Schistosoma mansoni
cluster # 2723 cluster # 2723 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2723#0 length = 500 sequences # 2

consensusID : consensus_2723#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 500
fasta sequence

                              [TCATCCACCTTAATTATTTCTAAGCATAAATAATAACACACATTGATGATGAAATTCTCTTGAATCAATCTCCCATATAATATGCTGTTATTATTTATTTAATTATTATTACTATTTGGCTACCTTTTTGATTCATTCAAACACCACGAAGCTTTTATCATGTTTCAAGTATCAATAGTAATCATTCAATTGTTTGTGTAAATAATAATAAGAATACCAGTCGTAGCTGTTCTAGTTGTTGTTGTTGTAATAATAATAATGATAACGACAATGATCGCCTTTCTCCAACTAAACTAATCACACATACAAAAGTATGAATGTAATGGTTAATTATTATGTTCTCATACTCTCTCTCTTAATTAGGAATTATTATAGTGTCAATACTGTTTCTGTGTGTATGTGTTATTTCAATGATACTTTTCAAAAACACACACACACAAATGTTTCCTTGTGTGTCTCAATTTGAAATGGGAATCAGAAAACTGAATGACCTGTATATG]

[+] EMBL CD170995             [TCATCCACCTTAATTATTTCTAAGCATAAATAATAACACACATTGATGATGAAATTCTCTTGAATCAATCTCCCATATAATATGCTGTTATTATTTATTTAATTATTATTACTATTTGGCTACCTTTTTGATTCATTCAAACACCACGAAGCTTTTATCATGTTTCAAGTATCAATAGTAATCATTCAATTGTTTGTGTAAATAATAATAAGAATACCAGTCGTAGCTGTTCTAGTTGTTGTTGTTGTAATAATAATAATGATAACGACAATGATCGCCTTTCTCCAACTAAACTAATCACACATACAAAAGTATGAATGTAATGGTTAATTATTATGTTCTCATACTCTCTCTCTTAATTAGGAATTATTATAGTGTCAATACTGTTTCTGTGTGTATGTGTTATTTCAATGATACTTTTCAAAAACACACACACACAAATGTTTCCTTGTGTGTCTCAATTTGAAATGGGAATCAGAAAACT                ]
[-] EMBL CD092869             [                                                                                                                                                                                                                  AGAATACCAGTCGTAACTGTTCT G  GTTGTTGTTGTAATAATAATAATGATAACGACAATGATCGCCTTTCTCCAAGTAAACTAATCACACATACAAAAGTGTGAATGTAATGGTTAATTATTATGTTCTCATACTCTCTCTGTTAATTAGGAATTATTATAGTGTCAATACTGTTTCTGTGTGTATGTGTTATTTCAATGATACTTTTCACACACACACACACACACATGTTTCCTTGTTTGTTTCAATTTGAAATGGGAATAAGAAAACTGAATGACCTGTATATG]




>consensus_2723#0
TCATCCACCTTAATTATTTCTAAGCATAAATAATAACACACATTGATGATGAAATTCTCT
TGAATCAATCTCCCATATAATATGCTGTTATTATTTATTTAATTATTATTACTATTTGGC
TACCTTTTTGATTCATTCAAACACCACGAAGCTTTTATCATGTTTCAAGTATCAATAGTA
ATCATTCAATTGTTTGTGTAAATAATAATAAGAATACCAGTCGTAGCTGTTCTAGTTGTT
GTTGTTGTAATAATAATAATGATAACGACAATGATCGCCTTTCTCCAACTAAACTAATCA
CACATACAAAAGTATGAATGTAATGGTTAATTATTATGTTCTCATACTCTCTCTCTTAAT
TAGGAATTATTATAGTGTCAATACTGTTTCTGTGTGTATGTGTTATTTCAATGATACTTT
TCAAAAACACACACACACAAATGTTTCCTTGTGTGTCTCAATTTGAAATGGGAATCAGAA
AACTGAATGACCTGTATATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case