cluster # 2746

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Schistosoma mansoni
cluster # 2746 cluster # 2746 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2746#0 length = 945 sequences # 2

consensusID : consensus_2746#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 945
fasta sequence

                              [AAGCTAAGATAGCAGCAACACACACCACAAACAGTTGCAAAAGGATAGCCTGCTTTTCGTTGCTGATGCGTAAAAGCTTAGCCACATCCATCTAAAACAAGTTTAGCACAGAGAAAGCTGCGACCAAGATCAATTAGTGCGATGAATGTATTACATTTAGTAAGGTAGAATGACAGTAGTGAACATGAATTTATTGAAAACGGAAAAATTATTGAGGGTTAATTTATAAAGCGATATGCAACTGTTTTATACGACGAATGAACAAACTACGGCTAAGCATACAAAAACTAGATAAAGAAACACCAAAAAGATAACAATGATACACTTGGGGCACAAAGTACTTTATGGACGGTTGATGTTACATCAAAAGCGTAGATGAGGGAAAAGTAACATATTAAAATAAATCCAAGGGGATATATAGTCACGGATTAGTGAAAACTAAAATAATTCAAGGAATACCAAAAACAAAAAATAGTAGCGACTACTGGAGGATATATTTAATAAATCTGGTCTATTCCTGGAGCCTAATTAAACTAGTTTAACTGGTAGTTAATTCGTGAATACAACCAAACAGTTGTTGTAACACCAAACAATCTAATAACTGTAAACCTACTCTAAAGAAAATCAAAAAAACCCATTAAAAGTGAGGCCATCGACAACTATGTTGATAACTATTTTTAAGTTTATTATGAATCCNNNGCCTCNNCCCCAGCATGTGTCTAGTAAGGACAGCCAACGTTGAGAACATGCTGTACGAGTCGTTAGAACTAGTACTAAATAATGAAATGACTAGCTAGATTACAACAGTCTNNATAAAACCGAACTCACTCCACCNACCAGGTCTGAATCTATTCATGTCACTATGCCTACCCCGAAATGACATTAATGTCGTATTATTAGATTGTGGGTACTTGTTATTACGTCAGTTGGCTTTTCTGGGATATG]

[+] EMBL CD168636             [AAGCTAAGATAGCAGCAACACACACCACAAACAGTTGCAAAAGGATAGCCTGCTTTTCGTTGCTGATGCGTAAAAGCTTAGCCACATCCATCTAAAACAAGTTTAGCACAGAGAAAGCTGCGACCAAGATCAATTAGTGCGATGAATGTATTACATTTAGTAAGGTAGAATGACAGTAGTGAACATGAATTTATTGAAAACGGAAAAATTATTGAGGGTTAATTTATAAAGCGATATGCAACTGTTTTATACGACGAATGAACAAACTACGGCTAAGCATACAAAAACTAGATAAAGAAACACCAAAAAGATAACAATGATACACTTGGGGCACAAAGTACTTTATGGACGGTTGATGTTACATCAAAAGCGTAGATGAGGGAAAAGTAACATATTAAAATAAATCCAAGGGGATATATAGTCACGGATTAGTGAAAACTAAAATAATTCAAGGAATACCAAAAACAAAAAATAGTAGCGACTACTGGAGGATATATTTAATAAATCTGGTCTATTCCTGGAGCCTAATTAAACTAGTTTAACTGGTAGTTAATTCGTGAATACAACCAAACAGTTGTTGTAACACCAAACAATCTAATAACTGTAAACCTACTCTAAAGAAAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD093243             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTTTAACTGGTAGTTAATTCGTGAATACAACCAAACAGTTGTTGTAACACCAAACAATCTAATAACTGTAAACCTACTCTAAAGAAAATCAAAAAAACCCATTAAAAGTGAGGCCATCGACAACTATGTTGATAACTATTTTTAAGTTTATTATGAATCCNNNGCCTCNNCCCCAGCATGTGTCTAGTAAGGACAGCCAACGTTGAGAACATGCTGTACGAGTCGTTAGAACTAGTACTAAATAATGAAATGACTAGCTAGATTACAACAGTCTNNATAAAACCGAACTCACTCCACCNACCAGGTCTGAATCTATTCATGTCACTATGCCTACCCCGAAATGACATTAATGTCGTATTATTAGATTGTGGGTACTTGTTATTACGTCAGTTGGCTTTTCTGGGATATG]




>consensus_2746#0
AAGCTAAGATAGCAGCAACACACACCACAAACAGTTGCAAAAGGATAGCCTGCTTTTCGT
TGCTGATGCGTAAAAGCTTAGCCACATCCATCTAAAACAAGTTTAGCACAGAGAAAGCTG
CGACCAAGATCAATTAGTGCGATGAATGTATTACATTTAGTAAGGTAGAATGACAGTAGT
GAACATGAATTTATTGAAAACGGAAAAATTATTGAGGGTTAATTTATAAAGCGATATGCA
ACTGTTTTATACGACGAATGAACAAACTACGGCTAAGCATACAAAAACTAGATAAAGAAA
CACCAAAAAGATAACAATGATACACTTGGGGCACAAAGTACTTTATGGACGGTTGATGTT
ACATCAAAAGCGTAGATGAGGGAAAAGTAACATATTAAAATAAATCCAAGGGGATATATA
GTCACGGATTAGTGAAAACTAAAATAATTCAAGGAATACCAAAAACAAAAAATAGTAGCG
ACTACTGGAGGATATATTTAATAAATCTGGTCTATTCCTGGAGCCTAATTAAACTAGTTT
AACTGGTAGTTAATTCGTGAATACAACCAAACAGTTGTTGTAACACCAAACAATCTAATA
ACTGTAAACCTACTCTAAAGAAAATCAAAAAAACCCATTAAAAGTGAGGCCATCGACAAC
TATGTTGATAACTATTTTTAAGTTTATTATGAATCCNNNGCCTCNNCCCCAGCATGTGTC
TAGTAAGGACAGCCAACGTTGAGAACATGCTGTACGAGTCGTTAGAACTAGTACTAAATA
ATGAAATGACTAGCTAGATTACAACAGTCTNNATAAAACCGAACTCACTCCACCNACCAG
GTCTGAATCTATTCATGTCACTATGCCTACCCCGAAATGACATTAATGTCGTATTATTAG
ATTGTGGGTACTTGTTATTACGTCAGTTGGCTTTTCTGGGATATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case