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Schistosoma mansoni
cluster # 2878 cluster # 2878       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2878#0 length = 559 sequences # 2  

consensusID : consensus_2878#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 559
fasta sequence
                              [GTTAGGGATTGTTTACTTAGTCGTCCTGTGTAGAATGCTTTCACGAGTTACGTTATTCACTGAATTTATAAAGGTGTGCGACAGCGGATATATTTTAGGGAACAGTGGCGGATATGTTATATCTGAACGAATGAGTGGTAACTGACAGGAATTATCCATTTATTACTATTATTGTCGTATATATTATTATTGTATAATTAATAATAAACTAAATTATATGCATTTGTATTCTCTTTACCATAATGTTTCATTTGACCGGTTAGAAACTGTTATATAATTGATCATTCTTAATTTAATCCCAATCTATTATTAGTTACATTCTCTCATACTCGAGTATGAGTGCGATCGCACCCACTTTTGGCTTGATGTTTTATAAGTATTTTTAATTTTATGATGTGATTCAGTCTGATCTACTTGTATATAAACCATGTATATCTGAATGTACGATTCACTCAGTGGACTCTGGACTCAACGGGCAGGGCAAGGCGAGAAGCTACTGTATCGAAGACCAATAAGGGTTTAGAGTTAACCGAATGTTACTAGTGCTGGTTTGCGTGTC]

[+] EMBL CD096367             [GTTAGGGATTGTTTACTTAGTCGTCCTGTGTAGAATGCTTTCACGAGTTACGTTATTCACTGAATTTATAAAGGTGTGCGACAGCGGATATATTTTAGGGAACAGTGGCGGATATGTTATATCTGAACGAATGAGTGGTAACTGACAGGAATTATCCATTTATTACTATTATTGTCGTATATATTATTATTGTATAATTAATAATAAACTAAATTATATGCATTTGTATTCTCTTTACCATAATGTTTCATTTGACCGGTTAGAAACTGTTATATAATTGATCATTCTTAATTTAATCCCAATCTATTATTAGTTACATTCTCTCATACTCGAGTATGAGTGCGATCGCACCCACTTTTGGCTTGATGTTTTATAAGTATTTTTAATTTTATGATGTGATTCAGTCTGATCTACTTGTATATAAACCATGTATATCTGAATGTACGATTCACTCAGTGGACTCTGGACTCAACGGGCAGGGCAAGGCGAGAAGCTACTGTATCGAAGACCAATAAGGGTTTAGAGTTAACCGAATGTTACTAGTGCTGGTTTGCGTGTC]
[+] EMBL CD096525             [    GGGATTGTTTACTTAGTCGTCCTGTGTAGAATGCTTTTACGAGTTACGTTATTCACTGAATTTATAAAGATGTGCGACAGCGGATATATTTTAGGGAACAGTGGCGGATATGTTATATCTGAACGAATGAGTGGTAACTGACAGGAATTATCCATTTATTACTATTATTGTCGTGTATATTATTATTGTATAATTAATAATAAACTAAATTATATGCATTTGTATTCTCTTTACCATAATGTTTCATTTGACCGGTTAGAAACTGTTATATAATTGATCATTCTTAATTTAATCCCAATCTATTATTAGTTACATTCTCTCATACTCGAGTATGAGTGCGATCGCACCCACTTTTGGCTTGATGTTTTATAAGTATTTTTAATTTTATGATGTGATTCAGTCTGATCTACTTGTATATAAACCATGTATATCTGAATGTACGATTCACT                                                                                                          ]


>consensus_2878#0 GTTAGGGATTGTTTACTTAGTCGTCCTGTGTAGAATGCTTTCACGAGTTACGTTATTCAC TGAATTTATAAAGGTGTGCGACAGCGGATATATTTTAGGGAACAGTGGCGGATATGTTAT ATCTGAACGAATGAGTGGTAACTGACAGGAATTATCCATTTATTACTATTATTGTCGTAT ATATTATTATTGTATAATTAATAATAAACTAAATTATATGCATTTGTATTCTCTTTACCA TAATGTTTCATTTGACCGGTTAGAAACTGTTATATAATTGATCATTCTTAATTTAATCCC AATCTATTATTAGTTACATTCTCTCATACTCGAGTATGAGTGCGATCGCACCCACTTTTG GCTTGATGTTTTATAAGTATTTTTAATTTTATGATGTGATTCAGTCTGATCTACTTGTAT ATAAACCATGTATATCTGAATGTACGATTCACTCAGTGGACTCTGGACTCAACGGGCAGG GCAAGGCGAGAAGCTACTGTATCGAAGACCAATAAGGGTTTAGAGTTAACCGAATGTTAC TAGTGCTGGTTTGCGTGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)