cluster # 3019

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Schistosoma mansoni
cluster # 3019 cluster # 3019 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3019#0 length = 798 sequences # 2

consensusID : consensus_3019#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 798
fasta sequence

                              [CTGATTAATCCAAACAAGGAAGGCGAAAGTAACGCTGGACATATCAGTCGTAAAAATATACAACCAGATATTAAATTATCACAAAATTCTGACCCACGAATTGTTTCTAATGCTTCACGAAATGAACTGAATAAGCGAATGAGTACACTTGGGAAATAATTCAAACTGGATTGAATAGCTCGCCAAACAACATCGAAATATCTTAATAACATTATTTGATTGCCAATTAAAGTGCCAGTTATTATTGATCGGTGGTTTTTTAACATATTTCCAGGTGATAAAGCATATGCAGCAGTATCAGTTGCACTCAGTGAACCACCAGTACATTGAGTTGAAGATAATTTTTCTGGATCAACTTCCCAAGGTGTTAAACATGTTAGTACACGTTGTATTAACAAGTGAAATAAATGATGAAGATAAGATGAACCGACAAATTTTACATAACATTCTACAGCTTTCGTTGCTATTGTATTTGATCGAAATGCCATTGATTCATTTTCTAAGTCAGAAACTTCTCGAACAACCAAACTGGTCAAAAATTCAATCAGTGTATTATTATTTTCATGTAAATAAACCAATGAATTCGCTAATTCTTCTTTGAGCTTAACAGATAATAATAACGATTCTAACCAGTTCGTTAACAATAAACTATTATTTAGTACAAGCGTTCTTANAGGCCAATAATTGCATAATGGTAATACACCAAGTGATTGATAGCGTGCACGAATACGTAATTGTGGAAAATTTGTCTGATCTGTTACTCCATTATTTATAGAATGATTATGCNATAGGTTTAAT]

[+] EMBL CD187299             [CTGATTAATCCAAACAAGGAAGGCGAAAGTAACGCTGGACATATCAGTCGTAAAAATATACAACCAGATATTAAATTATCACAAAATTCTGACCCACGAATTGTTTCTAATGCTTCACGAAATGAACTGAATAAGCGAATGAGTACACTTGGGAAATAATTCAAACTGGATTGAATAGCTCGCCAAACAACATCGAAATATCTTAATAACATTATTTGATTGCCAATTAAAGTGCCAGTTATTATTGATCGGTGGTTTTTTAACATATTTCCAGGTGATAAAGCATATGCAGCAGTATCAGTTGCACTCAGTGAACCACCAGTACATTGAGTTGAAGATAATTTTTCTGGATCAACTTCCCAAGGTGTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD111969             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACCAGTACATTGAGTTGAAGATAATTTTTCTGGATCAACTTCCCAAGGTGTAAAACATGTTAGTACACGTTGTATTAACAAGTGAAATAAATGATGAAGATAAGATGAACCGACAAATTTTACATAACATTCTACAGCTTTCGTTGCTATTGTATTTGATCGAAATGCCATTGATTCATTTTCTAAGTCAGAAACTTCTCGAACAACCAAACTGGTCAAAAATTCAATCAGTGTATTATTATTTTCATGTAAATAAACCAATGAATTCGCTAATTCTTCTTTGAGCTTAACAGATAATAATAACGATTCTAACCAGTTCGTTAACAATAAACTATTATTTAGTACAAGCGTTCTTANAGGCCAATAATTGCATAATGGTAATACACCAAGTGATTGATAGCGTGCACGAATACGTAATTGTGGAAAATTTGTCTGATCTGTTACTCCATTATTTATAGAATGATTATGCNATAGGTTTAAT]




>consensus_3019#0
CTGATTAATCCAAACAAGGAAGGCGAAAGTAACGCTGGACATATCAGTCGTAAAAATATA
CAACCAGATATTAAATTATCACAAAATTCTGACCCACGAATTGTTTCTAATGCTTCACGA
AATGAACTGAATAAGCGAATGAGTACACTTGGGAAATAATTCAAACTGGATTGAATAGCT
CGCCAAACAACATCGAAATATCTTAATAACATTATTTGATTGCCAATTAAAGTGCCAGTT
ATTATTGATCGGTGGTTTTTTAACATATTTCCAGGTGATAAAGCATATGCAGCAGTATCA
GTTGCACTCAGTGAACCACCAGTACATTGAGTTGAAGATAATTTTTCTGGATCAACTTCC
CAAGGTGTTAAACATGTTAGTACACGTTGTATTAACAAGTGAAATAAATGATGAAGATAA
GATGAACCGACAAATTTTACATAACATTCTACAGCTTTCGTTGCTATTGTATTTGATCGA
AATGCCATTGATTCATTTTCTAAGTCAGAAACTTCTCGAACAACCAAACTGGTCAAAAAT
TCAATCAGTGTATTATTATTTTCATGTAAATAAACCAATGAATTCGCTAATTCTTCTTTG
AGCTTAACAGATAATAATAACGATTCTAACCAGTTCGTTAACAATAAACTATTATTTAGT
ACAAGCGTTCTTANAGGCCAATAATTGCATAATGGTAATACACCAAGTGATTGATAGCGT
GCACGAATACGTAATTGTGGAAAATTTGTCTGATCTGTTACTCCATTATTTATAGAATGA
TTATGCNATAGGTTTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case